基因页:SMCHD1
概括?
基因 | 23347 |
象征 | SMCHD1 |
同义词 | - |
描述 | 染色体的结构维护柔性铰链结构含量为1 |
参考 | MIM:614982|HGNC:HGNC:29090|ENSEMBL:ENSG00000101596|Vega:Otthumg00000178235 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18p11.32 |
Pascal P值 | 0.049 |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SMCHD1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AKR1C2 | 0.76 | 0.65 |
AKR1C1 | 0.68 | 0.60 |
wdyhv1 | 0.66 | 0.63 |
OCIAD2 | 0.64 | 0.70 |
ACAT1 | 0.62 | 0.65 |
LEMD1 | 0.62 | 0.66 |
TSPAN2 | 0.62 | 0.58 |
tuba1a | 0.61 | 0.62 |
UBE2L6 | 0.60 | 0.71 |
PRDX4 | 0.60 | 0.74 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
抓牢 | -0.56 | -0.78 |
Stat6 | -0.56 | -0.77 |
SPARCL1 | -0.55 | -0.67 |
EPB41L2 | -0.54 | -0.73 |
C2orf55 | -0.54 | -0.76 |
cobl | -0.54 | -0.73 |
Rapgef4 | -0.54 | -0.75 |
DGKZ | -0.54 | -0.67 |
kcnip3 | -0.54 | -0.76 |
DDN | -0.53 | -0.72 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与导管正常 | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova在APL中甲基化 | 68 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 97 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheok对胃嘌呤和高清MTX DN的反应 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |