概括
基因 23347
象征 SMCHD1
同义词 -
描述 染色体的结构维护柔性铰链结构含量为1
参考 MIM:614982|HGNC:HGNC:29090|ENSEMBL:ENSG00000101596|Vega:Otthumg00000178235
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18p11.32
Pascal P值 0.049
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AKR1C2 0.76 0.65
AKR1C1 0.68 0.60
wdyhv1 0.66 0.63
OCIAD2 0.64 0.70
ACAT1 0.62 0.65
LEMD1 0.62 0.66
TSPAN2 0.62 0.58
tuba1a 0.61 0.62
UBE2L6 0.60 0.71
PRDX4 0.60 0.74
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
抓牢 -0.56 -0.78
Stat6 -0.56 -0.77
SPARCL1 -0.55 -0.67
EPB41L2 -0.54 -0.73
C2orf55 -0.54 -0.76
cobl -0.54 -0.73
Rapgef4 -0.54 -0.75
DGKZ -0.54 -0.67
kcnip3 -0.54 -0.76
DDN -0.53 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与导管正常 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova在APL中甲基化 68 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yegnasubramanian前列腺癌 128 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 97 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对胃嘌呤和高清MTX DN的反应 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因