基因页：VPS8
概括？
| 基因 | 23355 |
| 象征 | VPS8 |
| 同义词 | KIAA0804 |
| 描述 | VPS8，Corvet复合物亚基 |
| 参考 | HGNC：HGNC：29122|Ensembl：ENSG00000156931|HPRD：11111|Vega：Otthumg00000156707 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q27.2 |
| Pascal P值 | 0.249 |
| Sherlock P值 | 3.097E-5 |
| 胎儿β | -0.033 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS62286935 | 3 | 184555231 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 25300 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62286936 | 3 | 184556483 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 26552 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS61741194 | 3 | 184587274 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 57343 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS80051460 | 3 | 184587926 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 57995 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201291790 | 3 | 184620289 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 3.785e-6 | 0.02 | 90358 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62286955 | 3 | 184621202 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 91271 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62286956 | 3 | 184622725 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 92794 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62286959 | 3 | 184638094 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 108163 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS112843941 | 3 | 184645378 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 115447 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62289479 | 3 | 184711397 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 181466 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS145841670 | 3 | 184718460 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 188529 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS74823827 | 3 | 184727815 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 197884 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62289499 | 3 | 184730390 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.339E-6 | 0.02 | 200459 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS116713356 | 3 | 184736990 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 207059 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62289500 | 3 | 184737550 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 207619 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62289501 | 3 | 184737911 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 207980 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8028863 | 3 | 184760314 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.598E-6 | 0.02 | 230383 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62287919 | 3 | 184784607 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.6e-6 | 0.02 | 254676 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS57628070 | 3 | 184788052 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.571E-6 | 0.02 | 258121 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS77142485 | 3 | 184788130 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.603E-6 | 0.02 | 258199 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62287921 | 3 | 184790415 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.578E-6 | 0.02 | 260484 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62287922 | 3 | 184790949 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.554E-6 | 0.02 | 261018 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62287923 | 3 | 184792190 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.5e-6 | 0.02 | 262259 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62287925 | 3 | 184792815 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 1.489E-6 | 0.02 | 262884 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS62287929 | 3 | 184795079 | VPS8 | ENSG00000156931.11 | 3.019E-6 | 0.02 | 265148 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 刘sox4靶向 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 | 143 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 按拷贝数量的丁肺癌表达 | 100 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nouzova在APL中甲基化 | 68 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |