基因页面:ARHGEF12
总结吗?
| GeneID | 23365年 |
| 象征 | ARHGEF12 |
| 同义词 | LARG | PRO2792 |
| 描述 | ρ鸟嘌呤核苷酸交换因子12 |
| 参考 | MIM: 604763|HGNC: HGNC: 14193|运用:ENSG00000196914|HPRD: 09207|织女:OTTHUMG00000166143 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q23.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.081 |
| 夏洛克假定值 | 0.741 |
| 胎儿β | -0.218 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 小脑半球 小脑 |
| 支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.006 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg26681847 | 11 | 120208749 | ARHGEF12 | 3.79 e-5 | 0.883 | 0.02 | DMG: Wockner_2014 |
| cg10493270 | 11 | 120251845 | ARHGEF12 | 2.265的军医 | 0.461 | 0.036 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005089 | ρguanyl-nucleotide交换因素的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005085 | guanyl-nucleotide交换因素活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0001664 | G-protein-coupled受体结合 | 艾达 | 15755723 | |
| 去:0005096 | GTPase激活活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 16192269 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007186 | g蛋白耦合受体蛋白信号通路 | 艾达 | 15755723 | |
| 去:0007242 | 细胞内的信号级联 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0035023 | ρ调节蛋白信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 15755723 | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG血管平滑肌收缩 | 115年 | 81年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG轴突引导 | 129年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG调节肌动蛋白细胞骨架 | 216年 | 144年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA肌凝蛋白通路 | 31日 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA PAR1通路 | 37 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID RHOA REG通路 | 46 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ρgtpase REACTOME信号 | 113年 | 81年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME信号通过神经生长因子 | 217年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME发育生物学 | 396年 | 292年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME NRAGE信号通过物死亡 | 43 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME细胞死亡信号通过NRAGE NRIF和纳德 | 60 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME我正常受体介导信号关系 | 81年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME轴突引导 | 251年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME G ALPHA1213信号事件 | 74年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME SEMA4D SEMAPHORIN信号 | 32 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME SEMAPHORIN交互 | 68年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME SEMA4D诱导细胞迁移和生长锥崩溃 | 27 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SOTIRIOU乳腺癌1级和3 DN | 52 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王LMO4目标了 | 372年 | 227年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HOEBEKE淋巴干细胞DN | 86年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1 HSC融合起来 | 185年 | 126年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1单核细胞融合 | 204年 | 140年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合持续在单核细胞 | 21 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应费马DN | 284年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SEIDEN瘤形成的满足 | 88年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MYLLYKANGAS放大热点23 | 24 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼转移DN | 261年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VERHAAK AML NPM1突变的DN | 246年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAVIN FOXP3目标集群P3 | 160年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受FOXP3刺激 | 1022年 | 619年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC MYC目标 | 217年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC需要MYC的目标 | 210年 | 123年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YAUCH刺猬信号旁分泌 | 149年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王肿瘤侵袭性了 | 374年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRESHOCK癌症拷贝数 | 323年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VALK AML集群8 | 26 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和发票16易位 | 422年 | 277年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| S3 HOSHIDA肝癌子类 | 266年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 詹女士多发性骨髓瘤DN | 46 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒1小时DN | 222年 | 147年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| gabriele MIR21目标 | 289年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 | 448年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-130/301 | 1152年 | 1158年 | m8 | hsa - mir - 130 a大脑 | CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU |
| hsa - mir - 301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
| hsa - mir - 130 b大脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
| hsa - mir - 454 - 3 - p | UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU | ||||
| miR-148/152 | 1153年 | 1160年 | 1、m8 | hsa - mir - 148 a | UCAGUGCACUACAGAACUUUGU |
| hsa - mir - 152大脑 | UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG | ||||
| hsa - mir - 148 b | UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU | ||||
| mir - 182 | 1164年 | 1170年 | 1 | hsa - mir - 182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
| miR-19 | 1151年 | 1157年 | m8 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
| hsa-miR-19b | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir - 193 | 1111年 | 1118年 | 1、m8 | hsa - mir - 193 a | AACUGGCCUACAAAGUCCCAG |
| hsa - mir - 193 b | AACUGGCCCUCAAAGUCCCGCUUU | ||||
| mir - 214 | 1098年 | 1104年 | 1 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
| mir - 218 | 366年 | 372年 | m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| mir - 219 | 3667年 | 3673年 | 1 | hsa - mir - 219大脑 | UGAUUGUCCAAACGCAAUUCU |
| miR-22 | 176年 | 182年 | m8 | hsa-miR-22大脑 | AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU |
| mir - 224 | 3962年 | 3968年 | m8 | hsa - mir - 224 | CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA |
| miR-26 | 766年 | 772年 | 1 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| mir - 361 | 3840年 | 3846年 | 1 | hsa - mir - 361大脑 | UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC |
| mir - 370 | 945年 | 951年 | 1 | hsa - mir - 370大脑 | GCCUGCUGGGGUGGAACCUGG |
| mir - 375 | 3862年 | 3868年 | 1 | hsa - mir - 375 | UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA |
| mir - 383 | 3755年 | 3761年 | 1 | hsa - mir - 383大脑 | AGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCU |
| mir - 488 | 3706年 | 3713年 | 1、m8 | hsa - mir - 488 | CCCAGAUAAUGGCACUCUCAA |
| mir - 494 | 3853年 | 3859年 | m8 | hsa - mir - 494大脑 | UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU |
| mir - 495 | 865年 | 871年 | 1 | hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU |
| mir - 96 | 1163年 | 1170年 | 1、m8 | hsa - mir - 96大脑 | UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC |