基因页:CRTC1
概括?
基因 | 23373 |
象征 | CRTC1 |
同义词 | mect1 | torc-1 | torc1 | wamtp1 |
描述 | CREB调节的转录共激活因子1 |
参考 | MIM:607536|HGNC:HGNC:16062|ENSEMBL:ENSG00000105662|HPRD:06339|Vega:Otthumg00000183115 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.11 |
Pascal P值 | 0.027 |
Sherlock P值 | 0.758 |
胎儿β | -0.623 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 小脑 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01874562 | 19 | 18873037 | CRTC1 | 1.557E-4 | 0.466 | 0.032 | DMG:Wockner_2014 |
CG12045676 | 19 | 18794818 | CRTC1 | 9.28e-8 | -0.015 | 2.11E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CRTC1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID AP1途径 | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM胃癌化学敏感性 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk中央女性生育 | 29 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis正常胚胎DN | 25 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |