概括
基因 23373
象征 CRTC1
同义词 mect1 | torc-1 | torc1 | wamtp1
描述 CREB调节的转录共激活因子1
参考 MIM:607536|HGNC:HGNC:16062|ENSEMBL:ENSG00000105662|HPRD:06339|Vega:Otthumg00000183115
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.11
Pascal P值 0.027
Sherlock P值 0.758
胎儿β -0.623
DMG 2(#研究)
主持人 小脑
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01874562 19 18873037 CRTC1 1.557E-4 0.466 0.032 DMG:Wockner_2014
CG12045676 19 18794818 CRTC1 9.28e-8 -0.015 2.11E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID AP1途径 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌吸烟者 80 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM胃癌化学敏感性 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk中央女性生育 29 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis正常胚胎DN 25 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因