概括
基因 23383
象征 mau2
同义词 kiaa0892 | mau2l | scc4 | mau-2
描述 MAU2姐妹染色质被凝聚因子
参考 MIM:614560|HGNC:HGNC:29140|ENSEMBL:ENSG00000129933|HPRD:11117|Vega:Otthumg00000150188
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.11
Pascal P值 1.175E-7
Sherlock P值 0.711
胎儿β 1.287
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:RIPKE_2013 全基因组协会研究 多阶段GWA,瑞典人口和PGC2。24个领先的SNP
LK:是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS2905426 CHR19 19478022 TG 6.921E-9 基因间 Mau2,Gatad2a dist = 8459; dist = 18620

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11882889 CHR19 19887684 mau2 23383 0.14 顺式
RS16829545 CHR2 151977407 mau2 23383 7.731E-6 反式
RS3845734 CHR2 171125572 mau2 23383 0.2 反式
RS7584986 CHR2 184111432 mau2 23383 0.08 反式
SNP_A-4218600 0 mau2 23383 0.19 反式
RS16955618 CHR15 29937543 mau2 23383 4.306E-7 反式
RS1230896 CHR16 13196672 mau2 23383 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC增强的Schlosser血清反应 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAO AOX4靶向皮肤DN 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因