基因页面:ZDHHC17

总结吗?
GeneID 23390年
象征 ZDHHC17
同义词 HIP14 | HIP3 | HSPC294 | HYPH
描述 锌指DHHC-type包含17
参考 MIM: 607799|HGNC: HGNC: 18412|运用:ENSG00000186908|HPRD: 09697|织女:OTTHUMG00000169917
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 12 q21.2
帕斯卡假定值 0.196
夏洛克假定值 0.596
胎儿β 0.386
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.0159

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg07639963 12 77157760 ZDHHC17 5.93 e-5 -0.267 0.023 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs10994209 chr10 61877705 ZDHHC17 23390年 0.1 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
C4orf41 0.95 0.95
GAPVD1 0.93 0.94
TRIP12 0.93 0.94
USP7 0.93 0.93
SEC63 0.93 0.94
BAG5 0.93 0.94
ZC3H14 0.93 0.93
UTP14C 0.93 0.94
RAD23B 0.93 0.92
FBXO11 0.93 0.94
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.78 -0.81
AF347015.31 -0.78 -0.81
MT-CO2 -0.78 -0.81
IFI27 -0.76 -0.78
HIGD1B -0.76 -0.79
FXYD1 -0.76 -0.78
ENHO -0.74 -0.81
C1orf54 -0.73 -0.80
AF347015.8 -0.72 -0.77
MT-CYB -0.72 -0.75

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0004871 信号传感器活动 小鬼 12761501
去:0004871 信号传感器活动 国际空间站 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 15603740
去:0016740 转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0019706 protein-cysteine S-palmitoleyltransferase活动 艾达 15603740
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0042953 脂蛋白运输 艾达 15603740
去:0018345 蛋白质棕榈酰化 国际能源机构 - - - - - -
去:0043123 积极的监管I-kappaB激酶/ NF-kappaB级联 小鬼 12761501
去:0043123 积极的监管I-kappaB激酶/ NF-kappaB级联 国际空间站 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000139 高尔基体膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005794 高尔基体 国际能源机构 - - - - - -
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0031410 胞质囊泡 国际能源机构 - - - - - -
去:0030659 胞质囊泡膜 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
武田的目标NUP98 HOXA9融合16 d 175年 108年 所有SZGR 2.0基因通路
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1 HSC融合起来 185年 126年 所有SZGR 2.0基因通路
乳腺癌顶浆分泌与腔的农民 326年 213年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 855年 609年 所有SZGR 2.0基因通路
滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN 483年 336年 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN NIPP1目标 848年 527年 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN EZH2目标 1024年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
沈SMARCA2目标了 424年 268年 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植排斥和好的DN 546年 351年 所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 555年 346年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃长期造血干细胞 302年 191年 所有SZGR 2.0基因通路
马森FOXP3如果绑定 1229年 713年 所有SZGR 2.0基因通路
BOCHKIS FOXA2目标 425年 261年 所有SZGR 2.0基因通路
TAVAZOIE转移 108年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
DUTERTRE雌二醇响应24小时DN 505年 328年 所有SZGR 2.0基因通路
IKEDA MIR30 DN的目标 27 24 所有SZGR 2.0基因通路
RATTENBACHER受CELF1 467年 251年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 128 489年 495年 1 hsa - mir - 128 a UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
hsa - mir - 128 b UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
mir - 142 - 5 - p 1786年 1792年 m8 hsa - mir - 142 - 5 - p CAUAAAGUAGAAAGCACUAC
mir - 144 487年 493年 m8 hsa - mir - 144 UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
mir - 146 273年 279年 1 hsa - mir - 146 a UGAGAACUGAAUUCCAUGGGUU
hsa - mir - 146 b大脑 UGAGAACUGAAUUCCAUAGGCU
miR-148/152 1150年 1157年 1、m8 hsa - mir - 148 a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa - mir - 152大脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa - mir - 148 b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
mir - 181 1851年 1857年 1 hsa - mir - 181 a大脑 AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 b深圳 AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
hsa - mir - 181 c大脑 AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 d大脑 AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
mir - 200 bc / 429 2577年 2583年 1 hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
miR-204/211 1473年 1479年 m8 hsa - mir - 204大脑 UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU
hsa - mir - 211 UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU
hsa - mir - 204大脑 UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU
hsa - mir - 211 UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU
miR-21 2527年 2533年 1 hsa-miR-21大脑 UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA
hsa - mir - 590 GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG
miR-27 489年 495年 m8 hsa-miR-27a大脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b大脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
miR-30-5p 1223年 1230年 1、m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
miR-33 872年 878年 1 hsa-miR-33 GUGCAUUGUAGUUGCAUUG
hsa-miR-33b GUGCAUUGCUGUUGCAUUGCA
miR-34/449 181年 188年 1、m8 hsa-miR-34a大脑 UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
hsa-miR-34c AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC
hsa - mir - 449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
hsa - mir - 449 b AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC
mir - 369 - 3 - p 2578年 2584年 m8 hsa - mir - 369 - 3 - p AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU
mir - 383 1154年 1160年 1 hsa - mir - 383大脑 AGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCU
mir - 493 - 5 - p 475年 481年 m8 hsa - mir - 493 - 5 - p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
mir - 496 1853年 1859年 1 hsa - mir - 496 AUUACAUGGCCAAUCUC
米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 677年 683年 m8 hsa - mir - 93大脑 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
hsa - mir - 302 a UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
hsa - mir - 302 b UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG
hsa - mir - 302 c UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
hsa - mir - 302 d UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU
hsa - mir - 372 AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU
hsa - mir - 373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
hsa - mir - 520 e AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
hsa - mir - 520 a AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU
hsa - mir - 520 b AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
hsa - mir - 520 c AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
hsa - mir - 520 d AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU
mir - 96 2571年 2577年 m8 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC