基因页:ctdnep1
概括?
基因 | 23399 |
象征 | ctdnep1 |
同义词 | Dullard | HSA011916 | Net56 |
描述 | CTD核包膜磷酸酶1 |
参考 | MIM:610684|HGNC:HGNC:19085|ENSEMBL:ENSG00000175826|HPRD:16845|Vega:Otthumg00000102180 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p13 |
Pascal P值 | 2.439E-4 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4587148 | CHR6 | 161805706 | ctdnep1 | 23399 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CTDNEP1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ATP6V0C | 0.93 | 0.96 |
TMEM59L | 0.93 | 0.94 |
NRSN2 | 0.92 | 0.95 |
AP001107.1 | 0.92 | 0.95 |
SLC25A22 | 0.91 | 0.90 |
SLC22A17 | 0.91 | 0.94 |
ENTPD6 | 0.90 | 0.92 |
IGSF8 | 0.90 | 0.90 |
SH3BP1 | 0.90 | 0.93 |
pink1 | 0.90 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EIF5B | -0.48 | -0.54 |
AC005921.3 | -0.46 | -0.62 |
NSBP1 | -0.44 | -0.44 |
AF347015.18 | -0.43 | -0.26 |
AC010300.1 | -0.43 | -0.44 |
RBMX2 | -0.42 | -0.45 |
KCNMB3 | -0.42 | -0.41 |
AF347015.21 | -0.40 | -0.19 |
ifi44 | -0.40 | -0.48 |
C21orf57 | -0.40 | -0.37 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤复制编号 | 181 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 | 102 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病持续时间corr dn | 146 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |