概括
基因 23399
象征 ctdnep1
同义词 Dullard | HSA011916 | Net56
描述 CTD核包膜磷酸酶1
参考 MIM:610684|HGNC:HGNC:19085|ENSEMBL:ENSG00000175826|HPRD:16845|Vega:Otthumg00000102180
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p13
Pascal P值 2.439E-4
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4587148 CHR6 161805706 ctdnep1 23399 0.2 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATP6V0C 0.93 0.96
TMEM59L 0.93 0.94
NRSN2 0.92 0.95
AP001107.1 0.92 0.95
SLC25A22 0.91 0.90
SLC22A17 0.91 0.94
ENTPD6 0.90 0.92
IGSF8 0.90 0.90
SH3BP1 0.90 0.93
pink1 0.90 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
EIF5B -0.48 -0.54
AC005921.3 -0.46 -0.62
NSBP1 -0.44 -0.44
AF347015.18 -0.43 -0.26
AC010300.1 -0.43 -0.44
RBMX2 -0.42 -0.45
KCNMB3 -0.42 -0.41
AF347015.21 -0.40 -0.19
ifi44 -0.40 -0.48
C21orf57 -0.40 -0.37

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤复制编号 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn 146 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因