概括
基因 23405
象征 DICER1
同义词 dcr1 | dicer | dicer1e | herna | k12h4.8 like | mng1 | rmse2
描述 DICER 1核糖核酸酶III
参考 MIM:606241|HGNC:HGNC:17098|Ensembl:ENSG00000100697|HPRD:05875|Vega:Otthumg00000166134
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q32.13
Pascal P值 0.216
Sherlock P值 0.068
TADA P值 0.024
DEG P值 DEG:SANDERS_2014:DS1_P = 0.126:DS1_BETA = 0.047800:DS2_P = 8.40E-01:DS2_BETA = 0.009:DS2_FDR = 9.28e-011
胎儿β 0.475
DMG 1(#研究)
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Sanders_2013 微阵列 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列(LCLS)上的微阵列进行全基因组基因表达谱。
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
DICER1 CHR14 95590783 t C NM_001195573
NM_001271282
NM_030621
NM_177438
p.376k> e
p.376k> e
p.376k> e
p.376k> e
错过
错过
错过
错过
精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24130561 14 95621734 DICER1 2.492E-4 -0.536 0.037 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID TAP63途径 54 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome microRNA miRNA生物发生 23 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组调节RNA途径 26 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘sox4靶向 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn 90 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向 135 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向8小时 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Mycn扩增靶向 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇7 27 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iizuka肝癌进展G1 G2 DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜蜜的克拉斯靶向 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D4 55 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho Stemness 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee区分T淋巴细胞 200 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙通过TSC2敏感血清 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因