概括
基因 23410
象征 SIRT3
同义词 sir2l3
描述 Sirtuin 3
参考 MIM:604481|HGNC:HGNC:14931|Ensembl:ENSG00000142082|HPRD:06836|Vega:Otthumg00000119074
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.5
Pascal P值 0.967
Sherlock P值 0.165
胎儿β -0.946
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
小脑
伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG22718774 11 236527 SIRT3 3.94e-8 -0.009 1.12E-5 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2179782 CHR6 37588562 SIRT3 23410 0.11 反式
RS1129271 CHR7 102087201 SIRT3 23410 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC4A4 0.82 0.82
AQP4 0.81 0.70
cybrd1 0.80 0.77
add3 0.80 0.79
TLR4 0.80 0.77
itgav 0.79 0.69
FGF2 0.79 0.74
SSPN 0.79 0.79
PDLIM5 0.77 0.79
BMPR1B 0.77 0.68
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RP9 -0.31 -0.48
CCDC107 -0.31 -0.44
Znf32 -0.31 -0.52
NR2C2AP -0.30 -0.46
FAM128A -0.30 -0.44
SNHG12 -0.30 -0.48
C7orf40 -0.30 -0.38
AC011491.1 -0.30 -0.41
ATF4 -0.30 -0.41
rpain -0.30 -0.43

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID HDAC ClassIII途径 25 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HDAC Classi途径 66 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sotiriou乳腺癌1级vs 3 DN 52 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG乳腺癌ESR1激光升高 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马后产后 63 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由HPV31 UP永生 84 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 65 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IRS1和IRS2的GUO目标 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因