基因页:SIRT3
概括?
基因 | 23410 |
象征 | SIRT3 |
同义词 | sir2l3 |
描述 | Sirtuin 3 |
参考 | MIM:604481|HGNC:HGNC:14931|Ensembl:ENSG00000142082|HPRD:06836|Vega:Otthumg00000119074 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P15.5 |
Pascal P值 | 0.967 |
Sherlock P值 | 0.165 |
胎儿β | -0.946 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑 伏隔核基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG22718774 | 11 | 236527 | SIRT3 | 3.94e-8 | -0.009 | 1.12E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2179782 | CHR6 | 37588562 | SIRT3 | 23410 | 0.11 | 反式 | ||
RS1129271 | CHR7 | 102087201 | SIRT3 | 23410 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SIRT3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC4A4 | 0.82 | 0.82 |
AQP4 | 0.81 | 0.70 |
cybrd1 | 0.80 | 0.77 |
add3 | 0.80 | 0.79 |
TLR4 | 0.80 | 0.77 |
itgav | 0.79 | 0.69 |
FGF2 | 0.79 | 0.74 |
SSPN | 0.79 | 0.79 |
PDLIM5 | 0.77 | 0.79 |
BMPR1B | 0.77 | 0.68 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RP9 | -0.31 | -0.48 |
CCDC107 | -0.31 | -0.44 |
Znf32 | -0.31 | -0.52 |
NR2C2AP | -0.30 | -0.46 |
FAM128A | -0.30 | -0.44 |
SNHG12 | -0.30 | -0.48 |
C7orf40 | -0.30 | -0.38 |
AC011491.1 | -0.30 | -0.41 |
ATF4 | -0.30 | -0.41 |
rpain | -0.30 | -0.43 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID HDAC ClassIII途径 | 25 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HDAC Classi途径 | 66 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sotiriou乳腺癌1级vs 3 DN | 52 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YANG乳腺癌ESR1激光升高 | 34 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莫迪海马后产后 | 63 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向DN | 135 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由HPV31 UP永生 | 84 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 | 65 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IRS1和IRS2的GUO目标 | 98 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |