概括
基因 23431
象征 AP4E1
同义词 CPSQ4 | SPG51
描述 适配器相关的蛋白质复合物4 Epsilon 1亚基
参考 MIM:607244|HGNC:HGNC:573|Ensembl:ENSG00000081014|HPRD:06258|Vega:Otthumg00000172458
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q21.2
Pascal P值 0.014
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG27183811 15 51200847 AP4E1 5.89e-10 -0.009 9.07e-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
crybg3 0.87 0.85
KIAA0494 0.87 0.87
PDE8A 0.86 0.82
SPG20 0.85 0.84
DOCK5 0.85 0.78
ATP10B 0.85 0.85
MTMR10 0.84 0.80
WIPF1 0.84 0.83
SLC12A2 0.84 0.78
ABCA8 0.84 0.78
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf86 -0.47 -0.54
NR2C2AP -0.47 -0.50
CCDC107 -0.46 -0.51
AC011491.1 -0.46 -0.51
AC174470.1 -0.46 -0.53
RPL36 -0.45 -0.63
CCDC28B -0.45 -0.58
SH2B2 -0.45 -0.52
Med19 -0.45 -0.50
NOL12 -0.44 -0.47

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg溶酶体 121 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome膜贩运 129 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 60 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Golgi相关囊泡生物发生 53 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康(Kang)因tert而永生 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gyorffy阿霉素耐药性 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因