基因页:AP4E1
概括?
基因 | 23431 |
象征 | AP4E1 |
同义词 | CPSQ4 | SPG51 |
描述 | 适配器相关的蛋白质复合物4 Epsilon 1亚基 |
参考 | MIM:607244|HGNC:HGNC:573|Ensembl:ENSG00000081014|HPRD:06258|Vega:Otthumg00000172458 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q21.2 |
Pascal P值 | 0.014 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG27183811 | 15 | 51200847 | AP4E1 | 5.89e-10 | -0.009 | 9.07e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AP4E1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
crybg3 | 0.87 | 0.85 |
KIAA0494 | 0.87 | 0.87 |
PDE8A | 0.86 | 0.82 |
SPG20 | 0.85 | 0.84 |
DOCK5 | 0.85 | 0.78 |
ATP10B | 0.85 | 0.85 |
MTMR10 | 0.84 | 0.80 |
WIPF1 | 0.84 | 0.83 |
SLC12A2 | 0.84 | 0.78 |
ABCA8 | 0.84 | 0.78 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1orf86 | -0.47 | -0.54 |
NR2C2AP | -0.47 | -0.50 |
CCDC107 | -0.46 | -0.51 |
AC011491.1 | -0.46 | -0.51 |
AC174470.1 | -0.46 | -0.53 |
RPL36 | -0.45 | -0.63 |
CCDC28B | -0.45 | -0.58 |
SH2B2 | -0.45 | -0.52 |
Med19 | -0.45 | -0.50 |
NOL12 | -0.44 | -0.47 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg溶酶体 | 121 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 | 60 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Golgi相关囊泡生物发生 | 53 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康(Kang)因tert而永生 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gyorffy阿霉素耐药性 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |