概括
基因 23478
象征 Sec11a
同义词 1810012e07rik | sec11l1 | spc18 | spcs4a | sid2895
描述 SEC11同源物A,信号肽酶复合物亚基
参考 HGNC:HGNC:17718|ENSEMBL:ENSG00000140612|HPRD:07503|Vega:Otthumg00000172489
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q25.3
Pascal P值 1.753E-8
Sherlock P值 0.868
胎儿β 0.59

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008236 丝氨酸型肽酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:6) -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006465 信号肽处理 IEA -
去:0006508 蛋白水解 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005792 微型体 IEA -
去:0005789 内质网膜 IEA -
去:0005783 内质网 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg蛋白出口 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome翻译 222 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SRP依赖性共通晶蛋白靶向膜 179 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
能量代谢的反应组整合 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
变形素的反应组合成和脱酰化 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组的合成分泌和GIP失活 14 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome泌尿素合成分泌和失活 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome合成分泌和GLP1的失活 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Choi ATL阶段预测变量 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng IL22信号传导DN 42 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-141/200a 296 302 M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-208 432 438 1a HSA-MIR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
mir-24 282 288 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-499 431 438 1A,M8 HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa