基因页：MACF1

概括？
基因 23499
象征 MACF1
同义词 ABP620 | ACF7 | MACF | OFC4
描述 微管 - 肌动交联因子1
参考 MIM：608271|HGNC：HGNC：13664|ENSEMBL：ENSG00000127603|HPRD：09750|Vega：Otthumg00000007754
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p32-p31
Pascal P值 0.021
Sherlock P值 0.912
胎儿β 1.813
支持 结构可塑性
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.7115

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
MACF1 CHR1 39904999 C t NM_012090 p.4033r> w 错过 精神分裂症 DNM：XU_2012


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003779 肌动蛋白结合 IEA -
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005509 钙离子结合 nas -
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 17043677
去：0004553 水解酶活性，水解O-糖基化合物 IEA -
去：0008017 微管结合 IEA -
去：0008017 微管结合 nas -
去：0051015 肌动蛋白丝结合 nas 10529403|10559237
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0001707 中胚层的形成 IEA -
GO：0016055 Wnt受体信号通路 IEA -
去：0005975 碳水化合物代谢过程 IEA -
去：0007163 细胞极性的建立或维护 IEA -
去：0007050 细胞周期停滞 IEA -
去：0008150 生物_Process nd -
去：0006928 细胞运动 IEA -
去：0006620 翻译后蛋白靶向膜 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005856 细胞骨架 IEA -
去：0005856 细胞骨架 nas 10529403
去：0005737 细胞质 艾达 10559237
去：0005737 细胞质 ISS -
去：0015630 微管细胞骨架 IEA -
GO：0015629 肌动蛋白细胞骨架 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Laiho结直肠癌锯齿状 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoebeke淋巴干细胞向上 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合粒细胞的tonks目标向上 55 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer肌原靶标 50 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF信令不通过Akt1 48hr向上 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1目标DN 47 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标DN 124 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Mycn扩增靶向 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ropero HDAC2目标 114 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Georges细胞周期miR192目标 62 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN 81 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori大型BII淋巴细胞DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞向上 90 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yu Myc针对DN 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时DN 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时DN 101 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
de yy1靶向DN 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mir15a和mir16 1的Bonci目标 91 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36小时DN 185 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 126 132 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 126 132 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-138 943 950 1A，M8 HSA-MIR-138脑 Agcugguuguguugaauc
mir-142-5p 366 372 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-15/16/195/424/497 640 646 1a HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-186 364 370 1a HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-19 557 564 1A，M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-192/215 254 260 1a HSA-MIR-192 cugaccuaugaauugacagcc
HSA-MIR-215 Augaccuaugaauugacagac
mir-217 1180 1186 1a HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-23 163 169 1a HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-25/32/92/363/367 587 593 1a HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-377 1084 1090 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-379 1129 1135 1a HSA-MIR-379脑 UgguagacuauggaaCGUA
mir-409-5p 197 203 M8 HSA-MIR-409-5P Agguacccgagaacuuugca
mir-410 83 89 M8 HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-421 1111 1117 1a HSA-MIR-421 ggccucauaauguuguug
mir-503 640 646 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag
mir-544 1115 1121 1a HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu