基因页：RIMBP2
概括？
| 基因 | 23504 |
| 象征 | RIMBP2 |
| 同义词 | PPP1R133 | RBP2 | RIM-BP2 |
| 描述 | 边缘结合蛋白2 |
| 参考 | MIM：611602|HGNC：HGNC：30339|ENSEMBL：ENSG00000060709|HPRD：17183|Vega：Otthumg00000168385 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12Q24.33 |
| Pascal P值 | 0.074 |
| Sherlock P值 | 0.863 |
| 胎儿β | -0.776 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG14256008 | 12 | 131200631 | RIMBP2 | 5.85e-8 | -0.012 | 1.49E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS36781 | CHR5 | 109289728 | RIMBP2 | 23504 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meinhold卵巢癌低级 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLI1融合DN的Rorie目标 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| coates巨噬细胞M1与M2 DN | 78 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |