基因页：R3HDM1
概括？
| 基因 | 23518 |
| 象征 | R3HDM1 |
| 同义词 | R3HDM |
| 描述 | R3H域包含1 |
| 参考 | HGNC：HGNC：9757|Ensembl：ENSG0000000048991|HPRD：10180|Vega：Otthumg00000131740 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q21.3 |
| Pascal P值 | 0.535 |
| Sherlock P值 | 0.466 |
| 胎儿β | -0.973 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.023 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.02395 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13588645 | 2 | 136289118 | R3HDM1 | -0.021 | 0.44 | DMG：Nishioka_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | R3HDM1 | 23518 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| lingo3 | 0.86 | 0.77 |
| KCNAB1 | 0.83 | 0.63 |
| pde1b | 0.82 | 0.73 |
| PMEPA1 | 0.82 | 0.72 |
| SCN4B | 0.81 | 0.71 |
| rasd2 | 0.81 | 0.78 |
| ENTPD3 | 0.81 | 0.68 |
| htr1d | 0.80 | 0.65 |
| ano3 | 0.80 | 0.60 |
| LRPAP1 | 0.79 | 0.72 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RPS3AP47 | -0.35 | -0.52 |
| RPL24 | -0.35 | -0.54 |
| RPL38 | -0.35 | -0.59 |
| RPL35A | -0.35 | -0.58 |
| RPL34 | -0.35 | -0.58 |
| RPL5 | -0.35 | -0.47 |
| RPS6 | -0.34 | -0.54 |
| RPL27 | -0.34 | -0.50 |
| RPS8 | -0.34 | -0.51 |
| RPS24 | -0.34 | -0.54 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003676 | 核酸结合 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Bidus转移DN | 161 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Choi ATL阶段预测变量 | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射5的响应5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 史密斯·泰特（Smith Tert） | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老肌肉DN | 123 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王复发性肝癌 | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-130/301 | 864 | 870 | M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| mir-140 | 639 | 645 | M8 | HSA-MIR-140脑 | agugguuuuacccuaugguag |
| mir-203.1 | 169 | 175 | 1a | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
| mir-30-5p | 964 | 971 | 1A，M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
| mir-381 | 292 | 298 | M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
| mir-493-5p | 917 | 923 | 1a | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
| mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 866 | 872 | 1a | HSA-MIR-93脑 | aaagugcuguucgugcagguag |
| HSA-MIR-302A | uaagugcuugcauguuuguga | ||||
| HSA-MIR-302B | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
| HSA-MIR-302C | uaagugcuuccauguucagugg | ||||
| HSA-MIR-302D | Uaagugcuauguugugugu | ||||
| HSA-MIR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
| HSA-MIR-373 | Gaagugcuucgauuuggggugu | ||||
| HSA-MIR-520E | Aaagugcuuuuuugaggg | ||||
| HSA-MIR-520A | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
| HSA-MIR-520B | aaagugcuuuuuuagaggg | ||||
| HSA-MIR-520C | aaagugcuuuuuuaggggug | ||||
| HSA-MIR-520D | aaaguguuugugggguggguu | ||||