概括
基因 23522
象征 kat6b
同义词 gtpts | morf | moz2 | myst4 | zc2hc6b | qkf | querkopf
描述 赖氨酸乙酰转移酶6B
参考 MIM:605880|HGNC:HGNC:17582|Ensembl:ENSG00000156650|HPRD:07065|Vega:Otthumg0000000018509
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q22.2
Pascal P值 0.601
胎儿β 2.128
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15912797 10 76586382 kat6b 1.22E-8 -0.008 4.99E-6 DMG:JAFFE_2016
CG18491775 10 76586186 kat6b 2.78E-8 -0.014 8.72E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
mprip 0.86 0.88
Foxred2 0.85 0.87
KIAA0664 0.85 0.87
FBXL18 0.84 0.87
FKRP 0.84 0.86
mgat3 0.84 0.86
RNF123 0.83 0.85
达格拉 0.83 0.88
ULK1 0.83 0.86
弗林 0.83 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GNG11 -0.59 -0.63
AF347015.21 -0.58 -0.55
C1orf54 -0.56 -0.60
Sycp3 -0.54 -0.63
clec2b -0.53 -0.58
AF347015.31 -0.52 -0.47
鼻孔 -0.51 -0.48
AL050337.1 -0.51 -0.58
AL139819.3 -0.51 -0.54
MT-CO2 -0.51 -0.46

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 IEA -
去:0004406 H3/H4组蛋白乙酰转移酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
去:0008134 转录因子结合 艾达 11965546
GO:0016564 转录阻遏活性 艾达 10497217
GO:0016407 乙酰转移酶活性 艾达 11965546
GO:0016563 转录激活剂活性 艾达 10497217
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006334 核小体组装 nas 10497217
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 nas 10497217
GO:0016568 染色质修饰 IEA -
GO:0016481 转录的负调节 艾达 10497217
GO:0016573 组蛋白乙酰化 艾达 11965546
GO:0045941 转录的正调节 艾达 11965546
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000786 核小体 nas 10497217
去:0005634 塔斯 10497217

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌24小时DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG乳腺癌ESR1激光升高 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分井与适度的 109 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP 89 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G6 153 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kyng DNA损坏紫外线 62 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen多能状态 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga PML Interactome 42 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir1靶向 53 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 899 905 1a HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-24 1235 1241 1a HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-381 1140 1146 M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu