基因页:kat6b
概括?
基因 | 23522 |
象征 | kat6b |
同义词 | gtpts | morf | moz2 | myst4 | zc2hc6b | qkf | querkopf |
描述 | 赖氨酸乙酰转移酶6B |
参考 | MIM:605880|HGNC:HGNC:17582|Ensembl:ENSG00000156650|HPRD:07065|Vega:Otthumg0000000018509 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q22.2 |
Pascal P值 | 0.601 |
胎儿β | 2.128 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15912797 | 10 | 76586382 | kat6b | 1.22E-8 | -0.008 | 4.99E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
CG18491775 | 10 | 76586186 | kat6b | 2.78E-8 | -0.014 | 8.72E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KAT6B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
mprip | 0.86 | 0.88 |
Foxred2 | 0.85 | 0.87 |
KIAA0664 | 0.85 | 0.87 |
FBXL18 | 0.84 | 0.87 |
FKRP | 0.84 | 0.86 |
mgat3 | 0.84 | 0.86 |
RNF123 | 0.83 | 0.85 |
达格拉 | 0.83 | 0.88 |
ULK1 | 0.83 | 0.86 |
弗林 | 0.83 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GNG11 | -0.59 | -0.63 |
AF347015.21 | -0.58 | -0.55 |
C1orf54 | -0.56 | -0.60 |
Sycp3 | -0.54 | -0.63 |
clec2b | -0.53 | -0.58 |
AF347015.31 | -0.52 | -0.47 |
鼻孔 | -0.51 | -0.48 |
AL050337.1 | -0.51 | -0.58 |
AL139819.3 | -0.51 | -0.54 |
MT-CO2 | -0.51 | -0.46 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
去:0004406 | H3/H4组蛋白乙酰转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
去:0008134 | 转录因子结合 | 艾达 | 11965546 | |
GO:0016564 | 转录阻遏活性 | 艾达 | 10497217 | |
GO:0016407 | 乙酰转移酶活性 | 艾达 | 11965546 | |
GO:0016563 | 转录激活剂活性 | 艾达 | 10497217 | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006334 | 核小体组装 | nas | 10497217 | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | nas | 10497217 | |
GO:0016568 | 染色质修饰 | IEA | - | |
GO:0016481 | 转录的负调节 | 艾达 | 10497217 | |
GO:0016573 | 组蛋白乙酰化 | 艾达 | 11965546 | |
GO:0045941 | 转录的正调节 | 艾达 | 11965546 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000786 | 核小体 | nas | 10497217 | |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 10497217 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YANG乳腺癌ESR1激光升高 | 34 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤区分井与适度的 | 109 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng DNA损坏紫外线 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen多能状态 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga PML Interactome | 42 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir1靶向 | 53 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 899 | 905 | 1a | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-24 | 1235 | 1241 | 1a | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
mir-381 | 1140 | 1146 | M8 | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |