基因页:SEC14L2
概括?
基因 | 23541 |
象征 | SEC14L2 |
同义词 | C22ORF6 | SPF | TAP | TAP1 |
描述 | Sec14像脂质结合2 |
参考 | MIM:607558|HGNC:HGNC:10699|Ensembl:ENSG00000100003|HPRD:06344|Vega:Otthumg00000151024 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q12.2 |
Pascal P值 | 0.004 |
Sherlock P值 | 0.623 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SEC14L2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ACTR1A | 0.92 | 0.91 |
RPN1 | 0.91 | 0.91 |
ywhaq | 0.91 | 0.91 |
ARF4 | 0.91 | 0.91 |
CCT5 | 0.91 | 0.91 |
C7orf70 | 0.90 | 0.88 |
ATP5A1 | 0.90 | 0.88 |
MRPL3 | 0.90 | 0.90 |
NIPSNAP1 | 0.89 | 0.90 |
SLC25A17 | 0.89 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.73 | -0.78 |
AF347015.8 | -0.72 | -0.78 |
AF347015.33 | -0.72 | -0.78 |
AF347015.27 | -0.70 | -0.77 |
AF347015.31 | -0.70 | -0.75 |
mt-cyb | -0.70 | -0.75 |
AF347015.2 | -0.68 | -0.77 |
AF347015.21 | -0.68 | -0.77 |
AF347015.15 | -0.68 | -0.76 |
FXYD1 | -0.68 | -0.77 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005543 | 磷脂结合 | nas | 7364757 | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
去:0008431 | 维生素E结合 | nas | 10829015 | |
GO:0016563 | 转录激活剂活性 | nas | 11444841 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
GO:0045893 | 转录,DNA依赖性的阳性调节 | nas | 11444841 | |
GO:0045540 | 调节胆固醇生物合成过程 | nas | 11226224 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | nas | 11444841 | |
去:0005737 | 细胞质 | nas | 10829015 | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID Delta NP63途径 | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘肝癌 | 38 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌转移 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
苏肝 | 55 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 UP | 167 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G123 DN | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过KDM3A的Krieg缺氧 | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-125/351 | 359 | 365 | 1a | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug |