概括
基因 23541
象征 SEC14L2
同义词 C22ORF6 | SPF | TAP | TAP1
描述 Sec14像脂质结合2
参考 MIM:607558|HGNC:HGNC:10699|Ensembl:ENSG00000100003|HPRD:06344|Vega:Otthumg00000151024
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q12.2
Pascal P值 0.004
Sherlock P值 0.623

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ACTR1A 0.92 0.91
RPN1 0.91 0.91
ywhaq 0.91 0.91
ARF4 0.91 0.91
CCT5 0.91 0.91
C7orf70 0.90 0.88
ATP5A1 0.90 0.88
MRPL3 0.90 0.90
NIPSNAP1 0.89 0.90
SLC25A17 0.89 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.73 -0.78
AF347015.8 -0.72 -0.78
AF347015.33 -0.72 -0.78
AF347015.27 -0.70 -0.77
AF347015.31 -0.70 -0.75
mt-cyb -0.70 -0.75
AF347015.2 -0.68 -0.77
AF347015.21 -0.68 -0.77
AF347015.15 -0.68 -0.76
FXYD1 -0.68 -0.77

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005543 磷脂结合 nas 7364757
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
去:0008431 维生素E结合 nas 10829015
GO:0016563 转录激活剂活性 nas 11444841
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006350 转录 IEA -
去:0006810 运输 IEA -
GO:0045893 转录,DNA依赖性的阳性调节 nas 11444841
GO:0045540 调节胆固醇生物合成过程 nas 11226224
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 nas 11444841
去:0005737 细胞质 nas 10829015
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID Delta NP63途径 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘肝癌 38 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
苏肝 55 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G123 DN 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖DN 179 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过KDM3A的Krieg缺氧 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 359 365 1a HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A ucccugagacccuuaaccugug