基因页:Snapin
Summary?
GeneID | 23557 |
Symbol | Snapin |
同义词 | bloc1s7 | blos7 | borcs3 |快照 |
描述 | SNAP associated protein |
参考 | MIM:607007|HGNC:HGNC:17145|Ensembl:ENSG00000143553|HPRD:06111|Vega:Otthumg0000000037086 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q21.3 |
Sherlock P值 | 0.836 |
胎儿β | 0.245 |
支持 | canabinoid 多巴胺 胞吞作用 SEROTONIN |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00814 | |
Literature | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 3 | |
网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献:9.7664 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SNAPIN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0000149 | 圈圈结合 | 塔斯 | 10195194 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007269 | 神经递质分泌 | 塔斯 | neuron, axon, Synap, serotonin, Neurotransmitter, dopamine (GO term level: 8) | 10195194 |
去:0006886 | 细胞内蛋白转运 | 塔斯 | 10195194 | |
去:0006887 | exocytosis | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008021 | 突触囊泡 | 塔斯 | 突触,神经递质(GO期限:12) | 10195194 |
GO:0019717 | 突触体 | IEA | Synap, Brain (GO term level: 7) | - |
GO:0045202 | synapse | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
去:0005737 | cytoplasm | IEA | - | |
GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0030054 | cell junction | IEA | - | |
GO:0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - | |
去:0030659 | 细胞质囊泡膜 | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
bloc1s1 | blos1 |FLJ39337 |FLJ97089 |GCN5L1 |MGC87455 |Micoa |RT14 | 溶酶体细胞器复合物1,亚基1的生物发生1 | Snapin interacts with BLOS1. | 绑定 | 15102850 |
bloc1s1 | blos1 |FLJ39337 |FLJ97089 |GCN5L1 |MGC87455 |Micoa |RT14 | 溶酶体细胞器复合物1,亚基1的生物发生1 | Two-hybrid | Biogrid | 15102850 |
bloc1s2 | blos2 |FLJ30135 |MGC10120 |RP11-316M21.4 | 溶酶体细胞器复合物1,亚基2的生物发生2 | - | HPRD,Biogrid | 15102850 |
bloc1s2 | blos2 |FLJ30135 |MGC10120 |RP11-316M21.4 | 溶酶体细胞器复合物1,亚基2的生物发生2 | Snapin与BLOS2相互作用。 | 绑定 | 15102850 |
bloc1s3 | blos3 |FLJ26641 |FLJ26676 |HPS8 |RP | 溶酶体细胞器复合物1,亚基3的生物发生3 | - | HPRD,Biogrid | 15102850 |
CNO | BCAS4L |FLJ11230 | 卡布奇诺同源物(鼠标) | Snapin与卡布奇诺咖啡相互作用。 | 绑定 | 15102850 |
CNO | BCAS4L |FLJ11230 | 卡布奇诺同源物(鼠标) | - | HPRD,Biogrid | 15102850 |
DDR1 | cak |CD167 |DDR |EDDR1 |MCK10 |NEP |ntrk4 |ptk3 |ptk3a |RTK6 | TRKE | 盘状蛋白结构域受体酪氨酸激酶1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
DTNBP1 | dbnd |DKFZP564K192 |FLJ30031 |HPS7 |MGC20210 |MY031 |Sdy | dystrobrevin binding protein 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Two-hybrid |
Biogrid | 15102850 |
DTNBP1 | dbnd |DKFZP564K192 |FLJ30031 |HPS7 |MGC20210 |MY031 |Sdy | dystrobrevin binding protein 1 | Snapin与dysbindin相互作用。 | 绑定 | 15102850 |
EBAG9 | EB9 |PDAF |RCAS1 | 雌激素受体结合位点相关的抗原,9 | EBAG9与Snapin相互作用。 | 绑定 | 15635093 |
EEF1G | EF1G |GIG35 | eukaryotic translation elongation factor 1 gamma | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
GPRASP1 | 喘着气|gasp1 |KIAA0443 | G蛋白偶联受体相关排序蛋白1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
hap1 | hap2 |hip5 |HLP |HHLP1 | 亨廷顿相关蛋白1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
ikbkap | DKFZP781H1425 |dys |ELP1 |fd |FLJ12497 |ikap |iki3 |TOT1 | B细胞中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂,激酶复合物相关蛋白 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
IMMT | DKFZP779P1653 |HMP |MGC111146 |P87 |P87/89 |P89 |Pig4 |PIG52 | 内膜蛋白,线粒体(线粒体) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
Kat5 | esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 | K(赖氨酸)乙酰转移酶5 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
kif5c | FLJ44735 |KIAA0531 |Kinn |MGC111478 |NKHC |NKHC-2 |NKHC2 | 动机家庭成员5C | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
LAMC1 | lamb2 |MGC87297 | 拉明蛋白,伽玛1(以前为lamb2) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
LRP12 | DKFZP781F1053 |FLJ12929 |ST7 | low density lipoprotein-related protein 12 | - | HPRD | 12809483 |
myst2 | HBO1 |HBOA |Kat7 | Myst组蛋白乙酰转移酶2 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
PLDN | PA | PALLID | pallidin同源物(鼠标) | - | HPRD,Biogrid | 15102850 |
RGS7 | - | G蛋白信号传导的调节剂7 | - | HPRD,Biogrid | 12659861 |
snap23 | HST17016 |snap23a |snap23b | synaptosomal-associated protein, 23kDa | SNAP23与Snapin相互作用。 | 绑定 | 15635093 |
snap23 | HST17016 |snap23a |snap23b | synaptosomal-associated protein, 23kDa | - | HPRD,Biogrid | 12877659 |
snap25 | FLJ23079 | RIC-4 | RIC4 | SEC9 | SNAP | SNAP-25 | bA416N4.2 | dJ1068F16.2 | 突触小体相关蛋白,25KDA | - | HPRD,Biogrid | 10195194 |
snap25 | FLJ23079 | RIC-4 | RIC4 | SEC9 | SNAP | SNAP-25 | bA416N4.2 | dJ1068F16.2 | 突触小体相关蛋白,25KDA | SNAP25与Snapin相互作用。 | 绑定 | 15635093 |
SPAG5 | 最深|MAP126 |HMAP126 | 精子相关的抗原5 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
ST7 | DKFZP762O2113 |ETS7Q |Fam4a |FAM4A1 |helg |ray1 |Sen4 |TSG7 | 抑制肿瘤性7 | Two-hybrid | Biogrid | 12809483 |
TRPV1 | DKFZP434K0220 |VR1 | 瞬态受体电位阳离子通道,亚家族V,成员1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 Two-hybrid |
Biogrid | 15066994 |