Summary
GeneID 23557
Symbol Snapin
同义词 bloc1s7 | blos7 | borcs3 |快照
描述 SNAP associated protein
参考 MIM:607007|HGNC:HGNC:17145|Ensembl:ENSG00000143553|HPRD:06111|Vega:Otthumg0000000037086
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21.3
Sherlock P值 0.836
胎儿β 0.245
支持 canabinoid
多巴胺
胞吞作用
SEROTONIN

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
Literature 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 3
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:9.7664

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000149 圈圈结合 塔斯 10195194
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007269 神经递质分泌 塔斯 neuron, axon, Synap, serotonin, Neurotransmitter, dopamine (GO term level: 8) 10195194
去:0006886 细胞内蛋白转运 塔斯 10195194
去:0006887 exocytosis IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008021 突触囊泡 塔斯 突触,神经递质(GO期限:12) 10195194
GO:0019717 突触体 IEA Synap, Brain (GO term level: 7) -
GO:0045202 synapse IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
去:0005737 cytoplasm IEA -
GO:0016020 IEA -
GO:0030054 cell junction IEA -
GO:0031410 细胞质囊泡 IEA -
去:0030659 细胞质囊泡膜 IEA -

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
bloc1s1 blos1 |FLJ39337 |FLJ97089 |GCN5L1 |MGC87455 |Micoa |RT14 溶酶体细胞器复合物1,亚基1的生物发生1 Snapin interacts with BLOS1. 绑定 15102850
bloc1s1 blos1 |FLJ39337 |FLJ97089 |GCN5L1 |MGC87455 |Micoa |RT14 溶酶体细胞器复合物1,亚基1的生物发生1 Two-hybrid Biogrid 15102850
bloc1s2 blos2 |FLJ30135 |MGC10120 |RP11-316M21.4 溶酶体细胞器复合物1,亚基2的生物发生2 - HPRD,Biogrid 15102850
bloc1s2 blos2 |FLJ30135 |MGC10120 |RP11-316M21.4 溶酶体细胞器复合物1,亚基2的生物发生2 Snapin与BLOS2相互作用。 绑定 15102850
bloc1s3 blos3 |FLJ26641 |FLJ26676 |HPS8 |RP 溶酶体细胞器复合物1,亚基3的生物发生3 - HPRD,Biogrid 15102850
CNO BCAS4L |FLJ11230 卡布奇诺同源物(鼠标) Snapin与卡布奇诺咖啡相互作用。 绑定 15102850
CNO BCAS4L |FLJ11230 卡布奇诺同源物(鼠标) - HPRD,Biogrid 15102850
DDR1 cak |CD167 |DDR |EDDR1 |MCK10 |NEP |ntrk4 |ptk3 |ptk3a |RTK6 | TRKE 盘状蛋白结构域受体酪氨酸激酶1 Two-hybrid Biogrid 16169070
DTNBP1 dbnd |DKFZP564K192 |FLJ30031 |HPS7 |MGC20210 |MY031 |Sdy dystrobrevin binding protein 1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
Two-hybrid
Biogrid 15102850
DTNBP1 dbnd |DKFZP564K192 |FLJ30031 |HPS7 |MGC20210 |MY031 |Sdy dystrobrevin binding protein 1 Snapin与dysbindin相互作用。 绑定 15102850
EBAG9 EB9 |PDAF |RCAS1 雌激素受体结合位点相关的抗原,9 EBAG9与Snapin相互作用。 绑定 15635093
EEF1G EF1G |GIG35 eukaryotic translation elongation factor 1 gamma Two-hybrid Biogrid 16169070
GPRASP1 喘着气|gasp1 |KIAA0443 G蛋白偶联受体相关排序蛋白1 Two-hybrid Biogrid 16169070
hap1 hap2 |hip5 |HLP |HHLP1 亨廷顿相关蛋白1 Two-hybrid Biogrid 16169070
ikbkap DKFZP781H1425 |dys |ELP1 |fd |FLJ12497 |ikap |iki3 |TOT1 B细胞中Kappa光多肽基因增强子的抑制剂,激酶复合物相关蛋白 Two-hybrid Biogrid 16169070
IMMT DKFZP779P1653 |HMP |MGC111146 |P87 |P87/89 |P89 |Pig4 |PIG52 内膜蛋白,线粒体(线粒体) Two-hybrid Biogrid 16169070
Kat5 esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 K(赖氨酸)乙酰转移酶5 Two-hybrid Biogrid 16169070
kif5c FLJ44735 |KIAA0531 |Kinn |MGC111478 |NKHC |NKHC-2 |NKHC2 动机家庭成员5C Two-hybrid Biogrid 16169070
LAMC1 lamb2 |MGC87297 拉明蛋白,伽玛1(以前为lamb2) Two-hybrid Biogrid 16169070
LRP12 DKFZP781F1053 |FLJ12929 |ST7 low density lipoprotein-related protein 12 - HPRD 12809483
myst2 HBO1 |HBOA |Kat7 Myst组蛋白乙酰转移酶2 Two-hybrid Biogrid 16169070
PLDN PA | PALLID pallidin同源物(鼠标) - HPRD,Biogrid 15102850
RGS7 - G蛋白信号传导的调节剂7 - HPRD,Biogrid 12659861
snap23 HST17016 |snap23a |snap23b synaptosomal-associated protein, 23kDa SNAP23与Snapin相互作用。 绑定 15635093
snap23 HST17016 |snap23a |snap23b synaptosomal-associated protein, 23kDa - HPRD,Biogrid 12877659
snap25 FLJ23079 | RIC-4 | RIC4 | SEC9 | SNAP | SNAP-25 | bA416N4.2 | dJ1068F16.2 突触小体相关蛋白,25KDA - HPRD,Biogrid 10195194
snap25 FLJ23079 | RIC-4 | RIC4 | SEC9 | SNAP | SNAP-25 | bA416N4.2 | dJ1068F16.2 突触小体相关蛋白,25KDA SNAP25与Snapin相互作用。 绑定 15635093
SPAG5 最深|MAP126 |HMAP126 精子相关的抗原5 Two-hybrid Biogrid 16169070
ST7 DKFZP762O2113 |ETS7Q |Fam4a |FAM4A1 |helg |ray1 |Sen4 |TSG7 抑制肿瘤性7 Two-hybrid Biogrid 12809483
TRPV1 DKFZP434K0220 |VR1 瞬态受体电位阳离子通道,亚家族V,成员1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Two-hybrid
Biogrid 15066994


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome膜贩运 129 74 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽 60 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME GOLGI ASSOCIATED VESICLE BIOGENESIS 53 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori大型BII淋巴细胞DN 58 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成11 57 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张乳腺癌祖细胞 425 253 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE UP 442 263 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过TP53 GR棕熊短波紫外线反应OUP A 898 516 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway