概括
基因 2356
象征 FPGS
同义词 -
描述 叶基聚谷氨酸合酶
参考 MIM:136510|HGNC:HGNC:3824|ENSEMBL:ENSG00000136877|HPRD:00642|Vega:Otthumg00000020716
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9q34.1
Pascal P值 0.142
Sherlock P值 0.755
胎儿β -0.275
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG11973688 9 130564956 FPGS 5.93e-10 -0.011 9.07e-7 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17542473 CHR4 111182451 FPGS 2356 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004326 四氢基聚谷氨酸合酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:6) -
去:0004326 四氢基聚谷氨酸合酶活性 ISS 谷氨酸(GO期限:6) 10964921
去:0004326 四氢基聚谷氨酸合酶活性 塔斯 谷氨酸(GO期限:6) 7721888
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009116 核苷代谢过程 ISS 10964921
去:0006139 核苷酶,核苷,核苷酸和核酸代谢过程 塔斯 7721888
去:0009396 叶酸和衍生物生物合成过程 IEA -
去:0009058 生物合成过程 IEA -
去:0006730 单碳复合代谢过程 IEA -
去:0006544 甘氨酸代谢过程 ISS 10964921
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 塔斯 7721888
去:0005737 细胞质 塔斯 1409616
去:0005739 线粒体 塔斯 7721888

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg叶酸生物合成 11 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维生素和辅因子的反应组代谢 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC和血清反应协同 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan V2晚分化基因 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向DN 148 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因