基因页:FPGS
概括?
基因 | 2356 |
象征 | FPGS |
同义词 | - |
描述 | 叶基聚谷氨酸合酶 |
参考 | MIM:136510|HGNC:HGNC:3824|ENSEMBL:ENSG00000136877|HPRD:00642|Vega:Otthumg00000020716 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9q34.1 |
Pascal P值 | 0.142 |
Sherlock P值 | 0.755 |
胎儿β | -0.275 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG11973688 | 9 | 130564956 | FPGS | 5.93e-10 | -0.011 | 9.07e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17542473 | CHR4 | 111182451 | FPGS | 2356 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FPGS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004326 | 四氢基聚谷氨酸合酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:6) | - |
去:0004326 | 四氢基聚谷氨酸合酶活性 | ISS | 谷氨酸(GO期限:6) | 10964921 |
去:0004326 | 四氢基聚谷氨酸合酶活性 | 塔斯 | 谷氨酸(GO期限:6) | 7721888 |
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
GO:0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0009116 | 核苷代谢过程 | ISS | 10964921 | |
去:0006139 | 核苷酶,核苷,核苷酸和核酸代谢过程 | 塔斯 | 7721888 | |
去:0009396 | 叶酸和衍生物生物合成过程 | IEA | - | |
去:0009058 | 生物合成过程 | IEA | - | |
去:0006730 | 单碳复合代谢过程 | IEA | - | |
去:0006544 | 甘氨酸代谢过程 | ISS | 10964921 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 塔斯 | 7721888 | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 1409616 | |
去:0005739 | 线粒体 | 塔斯 | 7721888 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg叶酸生物合成 | 11 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
维生素和辅因子的反应组代谢 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC和血清反应协同 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan V2晚分化基因 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向DN | 148 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |