基因页面:PADI4
总结吗?
| GeneID | 23569年 |
| 象征 | PADI4 |
| 同义词 | 垫| PAD4 | PADI5 | PDI4 | PDI5 |
| 描述 | 肽基精氨酸deiminase IV型 |
| 参考 | MIM: 605347|HGNC: HGNC: 18368|运用:ENSG00000159339|HPRD: 05635|织女:OTTHUMG00000002371 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p36.13 |
| 帕斯卡假定值 | 0.513 |
| 胎儿β | 0.16 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 皮质 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs11203367 | chr1 | 17657615 | PADI4 | 23569年 | 0.02 | 独联体 | ||
| rs1635597 | chr1 | 17659555 | PADI4 | 23569年 | 0.03 | 独联体 | ||
| rs1748035 | chr1 | 17661995 | PADI4 | 23569年 | 0.03 | 独联体 | ||
| rs11203368 | chr1 | 17666507 | PADI4 | 23569年 | 0.05 | 独联体 | ||
| rs12156052 | chr8 | 14903733 | PADI4 | 23569年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs114195833 | 1 | 17615542 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 2.041 e-6 | 0 | -19148年 | gtex_brain_ba24 |
| rs78138254 | 1 | 17631911 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 4.751 e - | 0 | -2779年 | gtex_brain_ba24 |
| rs34470277 | 1 | 17643054 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 1.12 e - | 0 | 8364年 | gtex_brain_ba24 |
| rs35412937 | 1 | 17644463 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 1.007 e - | 0 | 9773年 | gtex_brain_ba24 |
| rs13375202 | 1 | 17651637 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 2.262 e - | 0 | 16947年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4920595 | 1 | 17652294 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 2.233 e - | 0 | 17604年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12035527 | 1 | 17658337 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 1.533 e-6 | 0 | 23647年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4506507 | 1 | 17659176 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 2.121 e-6 | 0 | 24486年 | gtex_brain_ba24 |
| rs12737739 | 1 | 17660890 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 2.219 e - | 0 | 26200年 | gtex_brain_ba24 |
| rs11587827 | 1 | 17671382 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 1.52 e-6 | 0 | 36692年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2301888 | 1 | 17672730 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 4.754 e-8 | 0 | 38040年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2240339 | 1 | 17674108 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 8.063 e-8 | 0 | 39418年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2240338 | 1 | 17674185 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 8.063 e-8 | 0 | 39495年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2240336 | 1 | 17674402 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 9.905 e - | 0 | 39712年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2240335 | 1 | 17674537 | PADI4 | ENSG00000159339.9 | 4.628 e-8 | 0 | 39847年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周炎症反应生活的DN | 384年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 武田的目标NUP98 HOXA9融合8 d DN | 205年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 武田的目标NUP98 HOXA9融合10 d DN | 142年 | 90年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 武田的目标NUP98 HOXA9融合16 d DN | 143年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 胡椒慢性淋巴细胞白血病 | 33 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ODONNELL TFRC目标了 | 456年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHETH肝癌VS TXNIP PAM1损失 | 229年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展48小时DN | 428年 | 306年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沈SMARCA2 DN的目标 | 357年 | 212年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL CIS | 128年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肝癌DENA DN | 74年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佐藤在胰腺癌1被甲基化 | 419年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 科茨巨噬细胞M1和M2 DN | 78年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN WIERENGA STAT5A目标 | 213年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |