基因页面:LEMD3
总结吗?
GeneID | 23592年 |
象征 | LEMD3 |
同义词 | 男士一 |
描述 | 登月舱域包含3 |
参考 | MIM: 607844|HGNC: HGNC: 28887|运用:ENSG00000174106|HPRD: 09704|织女:OTTHUMG00000168840 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 12 q14 |
帕斯卡假定值 | 0.832 |
夏洛克假定值 | 0.509 |
胎儿β | 0.371 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg10134882 | 12 | 65563916 | LEMD3 | 1.56平台以及 | -0.026 | 5 e - | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs12422789 | chr12 | 66469849 | LEMD3 | 23592年 | 0.12 | 独联体 | ||
rs11176031 | chr12 | 66476971 | LEMD3 | 23592年 | 0.11 | 独联体 | ||
rs12649085 | chr4 | 39108078 | LEMD3 | 23592年 | 0.08 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LEMD3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
ENK紫外线反应表皮DN | 508年 | 354年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
胎儿肝脏DN MARTORIATI MDM4目标 | 514年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MOREAUX TACI多发性骨髓瘤的DN | 172年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AGUIRRE胰腺癌拷贝数DN | 238年 | 145年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NOUSHMEHR GBM体细胞突变 | 9 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PURBEY CTBP1没有SATB1的目标 | 344年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 | 448年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |