基因页:amacr
概括?
基因 | 23600 |
象征 | amacr |
同义词 | amacrd | cbas4 |种族| rm |
描述 | α-甲基酰基-COA Racemase |
参考 | MIM:604489|HGNC:HGNC:451|ENSEMBL:ENSG00000242110|HPRD:05134|Vega:Otthumg0000000090734 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5p13 |
Pascal P值 | 0.739 |
Sherlock P值 | 0.915 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS168803 | CHR5 | 33995704 | amacr | 23600 | 1.235E-5 | 顺式 | ||
RS840399 | CHR5 | 34015680 | amacr | 23600 | 7.743E-5 | 顺式 | ||
RS840391 | CHR5 | 34018503 | amacr | 23600 | 0.03 | 顺式 | ||
RS971074 | CHR4 | 100341860 | amacr | 23600 | 0.14 | 反式 | ||
RS168803 | CHR5 | 33995704 | amacr | 23600 | 0 | 反式 | ||
RS840399 | CHR5 | 34015680 | amacr | 23600 | 0.01 | 反式 | ||
RS253189 | 5 | 33993865 | amacr | ENSG00000242110.3 | 6.586E-8 | 0 | 14355 | gtex_brain_ba24 |
RS10472909 | 5 | 33994116 | amacr | ENSG00000242110.3 | 3.001E-9 | 0 | 14104 | gtex_brain_ba24 |
RS11742345 | 5 | 33994316 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.317E-9 | 0 | 13904 | gtex_brain_ba24 |
RS168803 | 5 | 33995705 | amacr | ENSG00000242110.3 | 7.795E-8 | 0 | 12515 | gtex_brain_ba24 |
RS9918189 | 5 | 33996454 | amacr | ENSG00000242110.3 | 8.832e-10 | 0 | 11766 | gtex_brain_ba24 |
RS10941110 | 5 | 33999079 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.819E-10 | 0 | 9141 | gtex_brain_ba24 |
RS10941112 | 5 | 34004707 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.535E-10 | 0 | 3513 | gtex_brain_ba24 |
RS386403520 | 5 | 34005414 | amacr | ENSG00000242110.3 | 7.773E-10 | 0 | 2806 | gtex_brain_ba24 |
RS3195676 | 5 | 34008100 | amacr | ENSG00000242110.3 | 7.791E-10 | 0 | 120 | gtex_brain_ba24 |
RS3217251 | 5 | 34008206 | amacr | ENSG00000242110.3 | 7.663e-10 | 0 | 14 | gtex_brain_ba24 |
RS6875926 | 5 | 34012492 | amacr | ENSG00000242110.3 | 8.021e-10 | 0 | -4272 | gtex_brain_ba24 |
RS253200 | 5 | 34012564 | amacr | ENSG00000242110.3 | 8.802e-8 | 0 | -4344 | gtex_brain_ba24 |
RS194126 | 5 | 34014022 | amacr | ENSG00000242110.3 | 2.147E-9 | 0 | -5802 | gtex_brain_ba24 |
RS253202 | 5 | 34015174 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.671E-7 | 0 | -6954 | gtex_brain_ba24 |
RS840399 | 5 | 34015681 | amacr | ENSG00000242110.3 | 3.317E-7 | 0 | -7461 | gtex_brain_ba24 |
RS840398 | 5 | 34016023 | amacr | ENSG00000242110.3 | 3.317E-7 | 0 | -7803 | gtex_brain_ba24 |
RS840397 | 5 | 34016138 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.504E-7 | 0 | -7918 | gtex_brain_ba24 |
RS840396 | 5 | 34016484 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.945E-7 | 0 | -8264 | gtex_brain_ba24 |
RS840395 | 5 | 34016554 | amacr | ENSG00000242110.3 | 6.333e-7 | 0 | -8334 | gtex_brain_ba24 |
RS840391 | 5 | 34018504 | amacr | ENSG00000242110.3 | 2.589E-6 | 0 | -10284 | gtex_brain_ba24 |
RS840389 | 5 | 34018684 | amacr | ENSG00000242110.3 | 2.586E-6 | 0 | -10464 | gtex_brain_ba24 |
RS840388 | 5 | 34018890 | amacr | ENSG00000242110.3 | 2.586E-6 | 0 | -10670 | gtex_brain_ba24 |
RS840387 | 5 | 34019048 | amacr | ENSG00000242110.3 | 2.586E-6 | 0 | -10828 | gtex_brain_ba24 |
RS840385 | 5 | 34020358 | amacr | ENSG00000242110.3 | 2.586E-6 | 0 | -12138 | gtex_brain_ba24 |
RS840382 | 5 | 34021706 | amacr | ENSG00000242110.3 | 2.567E-6 | 0 | -13486 | gtex_brain_ba24 |
RS10941113 | 5 | 34026756 | amacr | ENSG00000242110.3 | 7.564e-7 | 0 | -18536 | gtex_brain_ba24 |
RS7721230 | 5 | 33992529 | amacr | ENSG00000242110.3 | 3.04e-6 | 0 | 15691 | gtex_brain_putamen_basal |
RS253189 | 5 | 33993865 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.572E-6 | 0 | 14355 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10472909 | 5 | 33994116 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.05E-8 | 0 | 14104 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11742345 | 5 | 33994316 | amacr | ENSG00000242110.3 | 5.599E-9 | 0 | 13904 | gtex_brain_putamen_basal |
RS168803 | 5 | 33995705 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.446E-7 | 0 | 12515 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9918189 | 5 | 33996454 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.333E-10 | 0 | 11766 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10941110 | 5 | 33999079 | amacr | ENSG00000242110.3 | 6.441e-11 | 0 | 9141 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10941112 | 5 | 34004707 | amacr | ENSG00000242110.3 | 3.134e-10 | 0 | 3513 | gtex_brain_putamen_basal |
RS386403520 | 5 | 34005414 | amacr | ENSG00000242110.3 | 5.633e-10 | 0 | 2806 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3195676 | 5 | 34008100 | amacr | ENSG00000242110.3 | 5.633e-10 | 0 | 120 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3217251 | 5 | 34008206 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.486E-9 | 0 | 14 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6875926 | 5 | 34012492 | amacr | ENSG00000242110.3 | 5.669E-10 | 0 | -4272 | gtex_brain_putamen_basal |
RS253200 | 5 | 34012564 | amacr | ENSG00000242110.3 | 1.058E-6 | 0 | -4344 | gtex_brain_putamen_basal |
RS194126 | 5 | 34014022 | amacr | ENSG00000242110.3 | 3.254e-7 | 0 | -5802 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10941113 | 5 | 34026756 | amacr | ENSG00000242110.3 | 2.838e-6 | 0 | -18536 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AMACR_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG初级胆汁酸生物合成 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg过氧化物酶体 | 78 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胆汁酸和胆汁盐代谢 | 27 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过7Alpha羟化胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 | 15 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过24羟基胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 | 19 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组过氧化物酶体脂质代谢 | 21 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌 | 96 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD UP | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tomlins前列腺癌 | 40 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯肝癌 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍林引用1个目标1 dn | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍林引用1个目标2 dn | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ouyang前列腺癌标记 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类干扰素DN | 52 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha FFA氧气 | 22 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5A靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a Targets Group1 | 136 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |