概括
基因 23600
象征 amacr
同义词 amacrd | cbas4 |种族| rm
描述 α-甲基酰基-COA Racemase
参考 MIM:604489|HGNC:HGNC:451|ENSEMBL:ENSG00000242110|HPRD:05134|Vega:Otthumg0000000090734
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5p13
Pascal P值 0.739
Sherlock P值 0.915
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
下丘脑
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS168803 CHR5 33995704 amacr 23600 1.235E-5 顺式
RS840399 CHR5 34015680 amacr 23600 7.743E-5 顺式
RS840391 CHR5 34018503 amacr 23600 0.03 顺式
RS971074 CHR4 100341860 amacr 23600 0.14 反式
RS168803 CHR5 33995704 amacr 23600 0 反式
RS840399 CHR5 34015680 amacr 23600 0.01 反式
RS253189 5 33993865 amacr ENSG00000242110.3 6.586E-8 0 14355 gtex_brain_ba24
RS10472909 5 33994116 amacr ENSG00000242110.3 3.001E-9 0 14104 gtex_brain_ba24
RS11742345 5 33994316 amacr ENSG00000242110.3 1.317E-9 0 13904 gtex_brain_ba24
RS168803 5 33995705 amacr ENSG00000242110.3 7.795E-8 0 12515 gtex_brain_ba24
RS9918189 5 33996454 amacr ENSG00000242110.3 8.832e-10 0 11766 gtex_brain_ba24
RS10941110 5 33999079 amacr ENSG00000242110.3 1.819E-10 0 9141 gtex_brain_ba24
RS10941112 5 34004707 amacr ENSG00000242110.3 1.535E-10 0 3513 gtex_brain_ba24
RS386403520 5 34005414 amacr ENSG00000242110.3 7.773E-10 0 2806 gtex_brain_ba24
RS3195676 5 34008100 amacr ENSG00000242110.3 7.791E-10 0 120 gtex_brain_ba24
RS3217251 5 34008206 amacr ENSG00000242110.3 7.663e-10 0 14 gtex_brain_ba24
RS6875926 5 34012492 amacr ENSG00000242110.3 8.021e-10 0 -4272 gtex_brain_ba24
RS253200 5 34012564 amacr ENSG00000242110.3 8.802e-8 0 -4344 gtex_brain_ba24
RS194126 5 34014022 amacr ENSG00000242110.3 2.147E-9 0 -5802 gtex_brain_ba24
RS253202 5 34015174 amacr ENSG00000242110.3 1.671E-7 0 -6954 gtex_brain_ba24
RS840399 5 34015681 amacr ENSG00000242110.3 3.317E-7 0 -7461 gtex_brain_ba24
RS840398 5 34016023 amacr ENSG00000242110.3 3.317E-7 0 -7803 gtex_brain_ba24
RS840397 5 34016138 amacr ENSG00000242110.3 1.504E-7 0 -7918 gtex_brain_ba24
RS840396 5 34016484 amacr ENSG00000242110.3 1.945E-7 0 -8264 gtex_brain_ba24
RS840395 5 34016554 amacr ENSG00000242110.3 6.333e-7 0 -8334 gtex_brain_ba24
RS840391 5 34018504 amacr ENSG00000242110.3 2.589E-6 0 -10284 gtex_brain_ba24
RS840389 5 34018684 amacr ENSG00000242110.3 2.586E-6 0 -10464 gtex_brain_ba24
RS840388 5 34018890 amacr ENSG00000242110.3 2.586E-6 0 -10670 gtex_brain_ba24
RS840387 5 34019048 amacr ENSG00000242110.3 2.586E-6 0 -10828 gtex_brain_ba24
RS840385 5 34020358 amacr ENSG00000242110.3 2.586E-6 0 -12138 gtex_brain_ba24
RS840382 5 34021706 amacr ENSG00000242110.3 2.567E-6 0 -13486 gtex_brain_ba24
RS10941113 5 34026756 amacr ENSG00000242110.3 7.564e-7 0 -18536 gtex_brain_ba24
RS7721230 5 33992529 amacr ENSG00000242110.3 3.04e-6 0 15691 gtex_brain_putamen_basal
RS253189 5 33993865 amacr ENSG00000242110.3 1.572E-6 0 14355 gtex_brain_putamen_basal
RS10472909 5 33994116 amacr ENSG00000242110.3 1.05E-8 0 14104 gtex_brain_putamen_basal
RS11742345 5 33994316 amacr ENSG00000242110.3 5.599E-9 0 13904 gtex_brain_putamen_basal
RS168803 5 33995705 amacr ENSG00000242110.3 1.446E-7 0 12515 gtex_brain_putamen_basal
RS9918189 5 33996454 amacr ENSG00000242110.3 1.333E-10 0 11766 gtex_brain_putamen_basal
RS10941110 5 33999079 amacr ENSG00000242110.3 6.441e-11 0 9141 gtex_brain_putamen_basal
RS10941112 5 34004707 amacr ENSG00000242110.3 3.134e-10 0 3513 gtex_brain_putamen_basal
RS386403520 5 34005414 amacr ENSG00000242110.3 5.633e-10 0 2806 gtex_brain_putamen_basal
RS3195676 5 34008100 amacr ENSG00000242110.3 5.633e-10 0 120 gtex_brain_putamen_basal
RS3217251 5 34008206 amacr ENSG00000242110.3 1.486E-9 0 14 gtex_brain_putamen_basal
RS6875926 5 34012492 amacr ENSG00000242110.3 5.669E-10 0 -4272 gtex_brain_putamen_basal
RS253200 5 34012564 amacr ENSG00000242110.3 1.058E-6 0 -4344 gtex_brain_putamen_basal
RS194126 5 34014022 amacr ENSG00000242110.3 3.254e-7 0 -5802 gtex_brain_putamen_basal
RS10941113 5 34026756 amacr ENSG00000242110.3 2.838e-6 0 -18536 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG初级胆汁酸生物合成 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg过氧化物酶体 78 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胆汁酸和胆汁盐代谢 27 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过7Alpha羟化胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 15 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过24羟基胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 19 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组过氧化物酶体脂质代谢 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌 96 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD UP 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson遗传毒性签名 105 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tomlins前列腺癌 40 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯肝癌 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林引用1个目标1 dn 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林引用1个目标2 dn 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouyang前列腺癌标记 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类干扰素DN 52 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha FFA氧气 22 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5A靶向 217 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a Targets Group1 136 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因