基因页面:CD2AP
总结吗?
| GeneID | 23607年 |
| 象征 | CD2AP |
| 同义词 | CMS |
| 描述 | CD2-associated蛋白质 |
| 参考 | MIM: 604241|HGNC: HGNC: 14258|运用:ENSG00000198087|HPRD: 05026|织女:OTTHUMG00000014799 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.416 |
| 胎儿β | 1.339 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 小脑 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg21434440 | 6 | 47446198 | CD2AP | 1.31 e-8 | -0.024 | 5.25 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 12029088|14679214 | |
| 去:0005200 | 细胞骨架的结构组成 | 助教 | 10339567 | |
| 去:0017124 | SH3域绑定 | 艾达 | 10339567 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006461 | 蛋白质复合体组装 | 助教 | 10339567 | |
| 去:0007165 | 信号转导 | NAS | 10339567 | |
| 去:0007049 | 细胞周期 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007067 | 有丝分裂 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006930 | substrate-bound细胞迁移,细胞扩展 | 助教 | 10339567 | |
| 去:0051301 | 细胞分裂 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0001726 | 莱夫 | 艾达 | 10339567 | |
| 去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 助教 | 10339567 | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | 助教 | 10339567 | |
| 去:0031941 | 丝状肌动蛋白 | 艾达 | 10339567 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BCAR1 | 中科院| CAS1 | CASS1 | CRKAS | P130Cas | 乳腺癌抗雌激素电阻1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10339567 |
| CAPZA1 | CAPPA1 | CAPZ | CAZ1 | 限制蛋白(肌动蛋白纤维)肌肉z轴,α1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12690097 |
| 桶 | 林CAGH39 |发生| FLJ22219 | FLJ31914 | | MICPCH | TNRC8 | 钙/ calmodulin-dependent丝氨酸蛋白激酶(MAGUK家人) | 重新组成复杂 | BioGRID | 15331416 |
| CBL | C-CBL | CBL2 | RNF55 | Cas-Br-M(鼠)同向性逆转录病毒转换序列 | CMS与Cbl交互。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类Cbl CMS。 | 绑定 | 15128873 |
| CBL | C-CBL | CBL2 | RNF55 | Cas-Br-M(鼠)同向性逆转录病毒转换序列 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11067845 |
| 张 | 抗体生成| T11 | 张cd分子 | 重新组成复杂 | BioGRID | 12690097 |
| 张 | 抗体生成| T11 | 张cd分子 | - - - - - - | HPRD | 9741631 |
| CD2AP | CMS | DKFZp586H0519 | CD2-associated蛋白质 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10339567 |
| CDH3 | CDHP | HJMD | PCAD | 钙粘着蛋白3 1型P-cadherin(胎盘) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 15331416 |
| 菲英岛 | MGC45350 |背景下| SYN | 菲英岛相关癌基因SRC, FGR,是的 | - - - - - - | HPRD | 10339567 |
| GRB2 | 灰| EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 | 生长因子receptor-bound蛋白2 | - - - - - - | HPRD | 10339567 |
| NPHS1 | CNF | NPHN | 先天性肾病1日,芬兰类型(nephrin) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10997929 |
| NPHS2 | PDCN | SRN1 | 抗类固醇(podocin)反应特发性肾病2日, | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11733557 |
| PIK3R1 | GRB1 | p85 | p85-ALPHA | phosphoinositide-3-kinase,调节亚基1(α) | - - - - - - | HPRD | 10339567 |
| PKD2 | APKD2 | MGC138466 | MGC138468 | PC2 | PKD4 | 多囊肾疾病2(常染色体显性遗传) | - - - - - - | HPRD | 10913159 |
| PTK2B | CADTK | CAKB | FADK2 | FAK2 | FRNK | PKB | PTK | PYK2 | RAFTK | PTK2B蛋白质酪氨酸激酶2β | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 15128873 |
| RAB4A | HRES-1 / RAB4 | RAB4 | RAB4A, RAS致癌基因家族成员 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12559036 |
| SRC | c - src ASV | SRC1 | | p60-Src | v - src肉瘤(Schmidt-Ruppin a)病毒致癌基因相同器官(禽流感) | - - - - - - | HPRD | 10339567 |
| YES1 | HsT441 | P61-YES |是| c-yes | v-yes-1山口肉瘤病毒致癌基因同族体1 | - - - - - - | HPRD | 10339567 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID NEPHRIN NEPH1通路 | 31日 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID VEGFR1通路 | 26 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME细胞细胞通讯 | 120年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME NEPHRIN交互 | 20. | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN | 463年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOGNI治疗相关的骨髓白血病DN | 33 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 角化细胞DN ENK紫外线反应 | 485年 | 334年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DARWICHE乳头状瘤进展风险 | 74年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 牛津RALA或RALB目标DN | 24 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA2 PCC网络 | 423年 | 265年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植排斥和好的DN | 546年 | 351年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 | 555年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肿瘤对胎儿肾脏1 | 182年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 外邦人集群D9紫外线反应 | 28 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡 | 314年 | 201年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染48小时血巨细胞病毒 | 180年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒18人力资源 | 178年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BAELDE糖尿病肾病DN | 434年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1 DN的目标 | 314年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DE YY1 DN的目标 | 92年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张乳腺癌的祖细胞 | 425年 | 253年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞DN | 216年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肝癌生存DN | 175年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUTELLA CSF2RB和IL4 DN | 315年 | 201年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUTELLA应对HGF | 418年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 | 408年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和T 8 21易位 | 368年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN KARLSSON TGFB1目标 | 207年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VERHAAK胶质母细胞瘤间质 | 216年 | 130年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-1/206 | 2784年 | 2791年 | 1、m8 | hsa-miR-1 | UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA |
| hsa - mir - 206深圳 | UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG | ||||
| hsa - mir - 613 | AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC | ||||
| mir - 128 | 2486年 | 2492年 | 1 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
| hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
| mir - 137 | 2642年 | 2648年 | 1 | hsa - mir - 137 | UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG |
| miR-15/16/195/424/497 | 2698年 | 2705年 | 1、m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| mir - 181 | 2290年 | 2297年 | 1、m8 | hsa - mir - 181 a大脑 | AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU |
| hsa - mir - 181 b深圳 | AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG | ||||
| hsa - mir - 181 c大脑 | AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU | ||||
| hsa - mir - 181 d大脑 | AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU | ||||
| mir - 182 | 2275年 | 2282年 | 1、m8 | hsa - mir - 182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA |
| hsa - mir - 182 | UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA | ||||
| mir - 219 | 2584年 | 2591年 | 1、m8 | hsa - mir - 219大脑 | UGAUUGUCCAAACGCAAUUCU |
| miR-221/222 | 2639年 | 2645年 | 1 | hsa - mir - 221大脑 | AGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUC |
| hsa - mir - 222大脑 | AGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUC | ||||
| miR-25/32/92/363/367 | 2659年 | 2665年 | m8 | hsa-miR-25大脑 | CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA |
| hsa-miR-32 | UAUUGCACAUUACUAAGUUGC | ||||
| hsa - mir - 92 | UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG | ||||
| hsa - mir - 367 | AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 92 b深圳 | UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC | ||||
| miR-26 | 2560年 | 2566年 | 1 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| miR-27 | 2486年 | 2492年 | m8 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
| hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
| mir - 369 - 3 - p | 308年 | 314年 | m8 | hsa - mir - 369 - 3 - p | AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU |
| mir - 409 - 3 - p | 2783年 | 2789年 | m8 | hsa - mir - 409 - 3 - p | CGAAUGUUGCUCGGUGAACCCCU |
| mir - 410 | 156年 | 162年 | 1 | hsa - mir - 410 | AAUAUAACACAGAUGGCCUGU |
| mir - 452 | 222年 | 229年 | 1、m8 | hsa - mir - 452 | UGUUUGCAGAGGAAACUGAGAC |
| mir - 485 - 3 - p | 2568年 | 2574年 | m8 | hsa - mir - 485 - 3 - p | GUCAUACACGGCUCUCCUCUCU |
| mir - 503 | 2699年 | 2705年 | 1 | hsa - mir - 503 | UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG |
| mir - 96 | 2276年 | 2282年 | 1 | hsa - mir - 96大脑 | UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC |