基因页：SH3BP1

概括？
基因 23616
象征 SH3BP1
同义词 ARHGAP43
描述 SH3膜结合蛋白1
参考 HGNC：HGNC：10824|Ensembl：ENSG00000100092|HPRD：10227|Vega：Otthumg00000030996
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.1
Pascal P值 0.756
Sherlock P值 4.225E-4
DEG P值 DEG：ZHAO_2015：P = 4.81E-04：Q = 0.0926
胎儿β -0.317
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DEG：Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG22031736 22 38239648 SH3BP1 4.181E-4 4.775 DMG：Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11127467 CHR2 12993 SH3BP1 23616 0 反式
RS921163 CHR2 205337399 SH3BP1 23616 0.19 反式
RS13003798 CHR2 205355767 SH3BP1 23616 0.15 反式
RS10934268 CHR3 114060960 SH3BP1 23616 0.03 反式
RS16827037 CHR3 117203284 SH3BP1 23616 5.331E-4 反式
RS16865151 CHR3 189900081 SH3BP1 23616 0.19 反式
RS12652146 CHR5 54573379 SH3BP1 23616 0.13 反式
RS1009606 CHR6 5726368 SH3BP1 23616 0.11 反式
RS887719 CHR7 21184272 SH3BP1 23616 0.04 反式
RS320082 CHR7 29105404 SH3BP1 23616 0.01 反式
RS317720 CHR7 29110633 SH3BP1 23616 0.09 反式
RS317714 CHR7 29115553 SH3BP1 23616 0 反式
RS317724 CHR7 29120565 SH3BP1 23616 0.09 反式
RS1419793 CHR7 34697630 SH3BP1 23616 0.03 反式
RS17166659 CHR7 132342143 SH3BP1 23616 0.14 反式
RS16891454 CHR8 42485539 SH3BP1 23616 0.14 反式
RS16886605 CHR8 115894398 SH3BP1 23616 0 反式
RS1494750 CHR8 116094224 SH3BP1 23616 0.06 反式
RS1020772 Chr9 76532511 SH3BP1 23616 0.02 反式
RS10834670 Chr11 25404015 SH3BP1 23616 0 反式
RS10834671 Chr11 25404269 SH3BP1 23616 0 反式
RS11066476 CHR12 113465366 SH3BP1 23616 0.12 反式
RS11043285 CHR12 122443533 SH3BP1 23616 0.19 反式
RS7971538 CHR12 122473662 SH3BP1 23616 0.19 反式
RS4497566 CHR13 51694324 SH3BP1 23616 0.04 反式
RS1307687 0 SH3BP1 23616 0.11 反式
RS837356 CHR16 9470886 SH3BP1 23616 0.1 反式
RS7230403 CHR18 54982203 SH3BP1 23616 0.18 反式
RS1230712 CHR18 54992531 SH3BP1 23616 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MA髓样分化DN 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D簇DN 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D DN 78 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 DN 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC目标DN 116 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王NFKB目标 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因