基因页面:BACE1
总结吗?
| GeneID | 23621年 |
| 象征 | BACE1 |
| 同义词 | ASP2 | |环境HSPC104 |
| 描述 | 测试网站APP-cleaving酶1 |
| 参考 | MIM: 604252|HGNC: HGNC: 933|运用:ENSG00000186318|HPRD: 07255|织女:OTTHUMG00000160636 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q23.2-q23.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.927 |
| 夏洛克假定值 | 0.917 |
| 胎儿β | -0.274 |
| eGene | 小脑半球 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.006 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6829546 | chr4 | 12587664 | BACE1 | 23621年 | 0.14 | 反式 | ||
| rs6448932 | chr4 | 12595798 | BACE1 | 23621年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004190 | aspartic-type肽链内切酶活性 | 艾达 | 10531052 | |
| 去:0004190 | aspartic-type肽链内切酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008798 | beta-aspartyl-peptidase活动 | 助教 | 10591214 | |
| 去:0008233 | 肽酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006508 | 蛋白水解作用 | 艾达 | 10531052 | |
| 去:0006508 | 蛋白水解作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006509 | 膜蛋白ectodomain蛋白水解作用 | 助教 | 12354787 | |
| 去:0050435 | β-淀粉样蛋白代谢过程 | 艾达 | 15080893 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0030424 | 轴突 | 国际能源机构 | 神经元,轴突神经递质(术语层面:6) | - - - - - - |
| 去:0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 10531052 | |
| 去:0005768 | 核内体 | 艾达 | 10531052 | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 10887202 | |
| 去:0031410 | 胞质囊泡 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG老年痴呆症病 | 169年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 中村肿瘤区外围和中心 | 285年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯DCC DN的目标 | 121年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王LMO4 DN的目标 | 352年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌2集群DN | 141年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 唐衰老TP53的目标 | 33 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ROZANOV MMP14目标了 | 266年 | 171年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 任肺泡横纹肌肉瘤DN | 408年 | 274年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 | 393年 | 244年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| OUILLETTE CLL 13 q14删除DN | 60 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里奇尤因肉瘤祖DN | 191年 | 123年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 拉贝风TGFB1和WNT3A的目标 | 111年 | 70年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| COLINA 4 ebp1和4 ebp2的目标 | 356年 | 214年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GYORFFY阿霉素耐药性 | 56 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHYLA CBFA2T3目标了 | 387年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 124.1 | 3526年 | 3533年 | 1、m8 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| miR-124/506 | 3526年 | 3532年 | 1 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 135 | 1722年 | 1729年 | 1、m8 | hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| miR-141/200a | 1551年 | 1558年 | 1、m8 | hsa - mir - 141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
| hsa - mir - 200 a | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
| miR-15/16/195/424/497 | 267年 | 273年 | m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| miR-19 | 3448年 | 3455年 | 1、m8 | hsa-miR-19a | UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA |
| hsa-miR-19b | UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA | ||||
| mir - 214 | 431年 | 437年 | m8 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
| miR-24 * | 2904年 | 2910年 | 1 | hsa - mir - 189 | GUGCCUACUGAGCUGAUAUCAGU |
| miR-29 | 1052年 | 1058年 | 1 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
| mir - 299 - 5 - p | 1728年 | 1734年 | 1 | hsa - mir - 299 - 5 - p | UGGUUUACCGUCCCACAUACAU |
| miR-30-3p | 2188年 | 2194年 | 1 | hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC |
| hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||
| mir - 369 - 3 - p | 2156年 | 2163年 | 1、m8 | hsa - mir - 369 - 3 - p | AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU |
| mir - 374 | 2157年 | 2163年 | m8 | hsa - mir - 374 | UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG |
| mir - 378 * | 2819年 | 2825年 | m8 | hsa - mir - 422 b | CUGGACUUGGAGUCAGAAGGCC |
| hsa - mir - 422 a | CUGGACUUAGGGUCAGAAGGCC | ||||
| miR-7 | 992年 | 998年 | m8 | hsa-miR-7深圳 | UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG |
| miR-9 | 2732年 | 2739年 | 1、m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |