概括
基因 23643
象征 Ly96
同义词 ESOP-1 | MD-2 | MD2 | LY-96
描述 淋巴细胞抗原96
参考 MIM:605243|HGNC:HGNC:17156|ENSEMBL:ENSG00000154589|HPRD:05579|Vega:Otthumg00000164504
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q21.11
Pascal P值 0.32
Sherlock P值 0.455
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23732024 8 74903801 Ly96 0.002 -4.085 DMG:Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17013080 CHR1 208862652 Ly96 23643 0.12 反式
RS4844714 CHR1 208874118 Ly96 23643 0.02 反式
RS10494904 CHR1 208883320 Ly96 23643 0.11 反式
RS12097986 CHR1 208883360 Ly96 23643 0.11 反式
RS2275450 CHR1 238070458 Ly96 23643 0.11 反式
RS1448219 CHR2 46407927 Ly96 23643 0.14 反式
RS277655 CHR3 100044586 Ly96 23643 0.2 反式
RS7754123 CHR6 132667231 Ly96 23643 0.01 反式
RS17484200 CHR7 112570501 Ly96 23643 0.18 反式
RS7807249 CHR7 131615735 Ly96 23643 0.19 反式
RS17111364 Chr10 97901813 Ly96 23643 0.19 反式
RS17076272 CHR13 22726361 Ly96 23643 0 反式
RS17076274 CHR13 22726381 Ly96 23643 0 反式
RS10483856 CHR14 74365294 Ly96 23643 0.14 反式
RS8023616 CHR15 87539679 Ly96 23643 0.12 反式
RS8072151 CHR17 50228268 Ly96 23643 0.02 反式
RS6114613 CHR20 24277074 Ly96 23643 0 反式
RS6114624 CHR20 24282281 Ly96 23643 0.17 反式
RS6106837 CHR20 24284844 Ly96 23643 0.02 反式
RS6106843 CHR20 24288460 Ly96 23643 0 反式
RS6106844 CHR20 24288505 Ly96 23643 0.04 反式
RS16982879 Chrx 92924110 Ly96 23643 2.33E-4 反式
RS17342476 Chrx 102243644 Ly96 23643 0.13 反式
RS17342483 Chrx 102250155 Ly96 23643 0 反式
RS17342504 Chrx 102272107 Ly96 23643 0.13 反式
SNP_A-2138851 0 Ly96 23643 0.13 反式
SNP_A-2059928 0 Ly96 23643 0.13 反式
RS7879274 Chrx 145592957 Ly96 23643 0.13 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Toll像受体信号通路 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG致病性大肠杆菌感染 59 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta GSK3途径 27 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta收费途径 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TOLL内源性途径 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由TBK1 IKK Epsilon介导的IRF3 IRF7的Reactome激活IRF3 IRF7 14 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Traf6介导的TAK1复合物的诱导 14 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IKK复合物由RIP1介导 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗 78 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEMBA FHIT目标 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时 176 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON 132 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs供体DN 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Munshi多发性骨髓瘤 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sharma毛囊星形胶质细胞瘤位置 25 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戴维斯多发性骨髓瘤与MGUS DN 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
池子侵入性乳腺癌 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PYEON CANER CANCAR HEAD和NECK与宫颈DN 29 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 216 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转换签名 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因