基因页:Ly96
概括?
基因 | 23643 |
象征 | Ly96 |
同义词 | ESOP-1 | MD-2 | MD2 | LY-96 |
描述 | 淋巴细胞抗原96 |
参考 | MIM:605243|HGNC:HGNC:17156|ENSEMBL:ENSG00000154589|HPRD:05579|Vega:Otthumg00000164504 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q21.11 |
Pascal P值 | 0.32 |
Sherlock P值 | 0.455 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23732024 | 8 | 74903801 | Ly96 | 0.002 | -4.085 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17013080 | CHR1 | 208862652 | Ly96 | 23643 | 0.12 | 反式 | ||
RS4844714 | CHR1 | 208874118 | Ly96 | 23643 | 0.02 | 反式 | ||
RS10494904 | CHR1 | 208883320 | Ly96 | 23643 | 0.11 | 反式 | ||
RS12097986 | CHR1 | 208883360 | Ly96 | 23643 | 0.11 | 反式 | ||
RS2275450 | CHR1 | 238070458 | Ly96 | 23643 | 0.11 | 反式 | ||
RS1448219 | CHR2 | 46407927 | Ly96 | 23643 | 0.14 | 反式 | ||
RS277655 | CHR3 | 100044586 | Ly96 | 23643 | 0.2 | 反式 | ||
RS7754123 | CHR6 | 132667231 | Ly96 | 23643 | 0.01 | 反式 | ||
RS17484200 | CHR7 | 112570501 | Ly96 | 23643 | 0.18 | 反式 | ||
RS7807249 | CHR7 | 131615735 | Ly96 | 23643 | 0.19 | 反式 | ||
RS17111364 | Chr10 | 97901813 | Ly96 | 23643 | 0.19 | 反式 | ||
RS17076272 | CHR13 | 22726361 | Ly96 | 23643 | 0 | 反式 | ||
RS17076274 | CHR13 | 22726381 | Ly96 | 23643 | 0 | 反式 | ||
RS10483856 | CHR14 | 74365294 | Ly96 | 23643 | 0.14 | 反式 | ||
RS8023616 | CHR15 | 87539679 | Ly96 | 23643 | 0.12 | 反式 | ||
RS8072151 | CHR17 | 50228268 | Ly96 | 23643 | 0.02 | 反式 | ||
RS6114613 | CHR20 | 24277074 | Ly96 | 23643 | 0 | 反式 | ||
RS6114624 | CHR20 | 24282281 | Ly96 | 23643 | 0.17 | 反式 | ||
RS6106837 | CHR20 | 24284844 | Ly96 | 23643 | 0.02 | 反式 | ||
RS6106843 | CHR20 | 24288460 | Ly96 | 23643 | 0 | 反式 | ||
RS6106844 | CHR20 | 24288505 | Ly96 | 23643 | 0.04 | 反式 | ||
RS16982879 | Chrx | 92924110 | Ly96 | 23643 | 2.33E-4 | 反式 | ||
RS17342476 | Chrx | 102243644 | Ly96 | 23643 | 0.13 | 反式 | ||
RS17342483 | Chrx | 102250155 | Ly96 | 23643 | 0 | 反式 | ||
RS17342504 | Chrx | 102272107 | Ly96 | 23643 | 0.13 | 反式 | ||
SNP_A-2138851 | 0 | Ly96 | 23643 | 0.13 | 反式 | |||
SNP_A-2059928 | 0 | Ly96 | 23643 | 0.13 | 反式 | |||
RS7879274 | Chrx | 145592957 | Ly96 | 23643 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LY96_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Toll像受体信号通路 | 102 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG致病性大肠杆菌感染 | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta GSK3途径 | 27 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta收费途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TOLL内源性途径 | 25 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由TBK1 IKK Epsilon介导的IRF3 IRF7的Reactome激活IRF3 IRF7 | 14 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Traf6介导的TAK1复合物的诱导 | 14 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IKK复合物由RIP1介导 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TLR4信号传导 | 93 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome收费受体级联 | 118 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗 | 78 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEMBA FHIT目标 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON | 132 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs供体DN | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 | 88 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Munshi多发性骨髓瘤 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙齿龋齿DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 | 174 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sharma毛囊星形胶质细胞瘤位置 | 25 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
戴维斯多发性骨髓瘤与MGUS DN | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PYEON CANER CANCAR HEAD和NECK与宫颈DN | 29 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |