概括
基因 23654
象征 PLXNB2
同义词 MM1 | NBLA00445 | PLEXB2 | DJ402G11.3
描述 plexin B2
参考 MIM:604293|HGNC:HGNC:9104|ENSEMBL:ENSG00000196576|HPRD:05050|Vega:Otthumg00000150219
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.33
Pascal P值 0.006
Sherlock P值 0.611
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 PLXNB2 23654 9.064e-9 反式
RS3845734 CHR2 171125572 PLXNB2 23654 0 反式
RS7584986 CHR2 184111432 PLXNB2 23654 0.01 反式
RS7787830 CHR7 98797019 PLXNB2 23654 0.04 反式
RS3118341 Chr9 25185518 PLXNB2 23654 0.03 反式
RS16955618 CHR15 29937543 PLXNB2 23654 1.664E-16 反式
RS1041786 CHR21 22617710 PLXNB2 23654 0.04 反式
RS17328555 0 PLXNB2 23654 0.18 反式
RS2337002 Chrx 80368739 PLXNB2 23654 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0003674 Molecular_Function nd -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004812 氨基酰基-TRNA连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0050772 轴突发生的阳性调控 IEA 轴突,神经发生(GO期限:14) -
去:0006418 用于蛋白质翻译的tRNA氨基酰化 IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0008150 生物_Process nd -
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005856 细胞骨架 艾达 18029348
去:0005575 cellular_component nd -
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马良性皮肤肿瘤DN 18 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马恶性皮肤肿瘤DN 18 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson DNA损伤响应TP53 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meinhold卵巢癌低级 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌22q13 Amplicon 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与CBFB MYH11融合 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD2 45 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生7 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁尼trabectedin抗性DN 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌 66 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM有关联 171 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因