基因页:PLXNB2
概括?
基因 | 23654 |
象征 | PLXNB2 |
同义词 | MM1 | NBLA00445 | PLEXB2 | DJ402G11.3 |
描述 | plexin B2 |
参考 | MIM:604293|HGNC:HGNC:9104|ENSEMBL:ENSG00000196576|HPRD:05050|Vega:Otthumg00000150219 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.33 |
Pascal P值 | 0.006 |
Sherlock P值 | 0.611 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | PLXNB2 | 23654 | 9.064e-9 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | PLXNB2 | 23654 | 0 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | PLXNB2 | 23654 | 0.01 | 反式 | ||
RS7787830 | CHR7 | 98797019 | PLXNB2 | 23654 | 0.04 | 反式 | ||
RS3118341 | Chr9 | 25185518 | PLXNB2 | 23654 | 0.03 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | PLXNB2 | 23654 | 1.664E-16 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | PLXNB2 | 23654 | 0.04 | 反式 | ||
RS17328555 | 0 | PLXNB2 | 23654 | 0.18 | 反式 | |||
RS2337002 | Chrx | 80368739 | PLXNB2 | 23654 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PLXNB2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004812 | 氨基酰基-TRNA连接酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0050772 | 轴突发生的阳性调控 | IEA | 轴突,神经发生(GO期限:14) | - |
去:0006418 | 用于蛋白质翻译的tRNA氨基酰化 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0008150 | 生物_Process | nd | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005856 | 细胞骨架 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005575 | cellular_component | nd | - | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG轴突指导 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马良性皮肤肿瘤DN | 18 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马恶性皮肤肿瘤DN | 18 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson DNA损伤响应TP53 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meinhold卵巢癌低级 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌22q13 Amplicon | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML与CBFB MYH11融合 | 52 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD2 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生7 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁尼trabectedin抗性DN | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine卵泡甲状腺腺瘤 | 75 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine乳头状甲状腺癌 | 66 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM有关联 | 171 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |