基因页:TMEM2
概括?
基因 | 23670 |
象征 | TMEM2 |
同义词 | - |
描述 | 跨膜蛋白2 |
参考 | MIM:605835|HGNC:HGNC:11869|Ensembl:ENSG00000135048|HPRD:09317|Vega:Otthumg00000020000 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q21.13 |
Pascal P值 | 0.854 |
Sherlock P值 | 0.461 |
胎儿β | 0.165 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.939 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03358216 | 9 | 74383998 | TMEM2 | 1.49E-8 | -0.025 | 5.69E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TMEM2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | 塔斯 | 10767548 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Cisplatin抗性 | 28 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petretto心脏质量QTL顺式DN | 24 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标1 DN | 169 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性2D DN | 64 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI炎症反应LPS | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) | 98 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 | 222 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 1470 | 1477 | 1A,M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-132/212 | 77 | 83 | 1a | HSA-MIR-212SZ | uaacagucuccagucacgccc |
HSA-MIR-132脑 | uaacagucuacccaugggg | ||||
mir-224 | 1658年 | 1664年 | 1a | HSA-MIR-224 | caagucacuaguguguccuuua |
mir-23 | 35 | 42 | 1A,M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-26 | 383 | 390 | 1A,M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
mir-320 | 724 | 731 | 1A,M8 | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
mir-323 | 35 | 41 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |