基因页：KCNE4
概括？
| 基因 | 23704 |
| 象征 | KCNE4 |
| 同义词 | mirp3 |
| 描述 | 钾电门控通道亚家族E监管亚基4 |
| 参考 | MIM：607775|HGNC：HGNC：6244|Ensembl：ENSG00000152049|HPRD：09689|Vega：Otthumg00000133161 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q36.1 |
| Pascal P值 | 0.772 |
| 胎儿β | -0.001 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 梭子基底神经节 |
| 支持 | 兴奋性 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01016 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00916 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24742614 | 2 | 223917590 | KCNE4 | 4.504E-4 | 0.349 | 0.045 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS13385347 | 2 | 224054346 | KCNE4 | ENSG00000152049.5 | 4.15301E-6 | 0.05 | 137814 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10176552 | 2 | 224069500 | KCNE4 | ENSG00000152049.5 | 4.27074E-6 | 0.05 | 152968 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005244 | 电压门控离子通道活性 | IEA | - | |
| 去：0005249 | 电压门控钾通道活动 | IEA | - | |
| 去：0030955 | 钾离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 去：0006813 | 钾离子运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005856 | 细胞骨架 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| GO：0043231 | 细胞内膜结合的细胞器 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Doane乳腺癌ESR1 UP | 112 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 留置权乳腺癌变质 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Izadpanah干细胞脂肪与骨DN | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌 | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-30-3p | 213 | 220 | 1A，M8 | HSA-MIR-30A-3P | cuuucagucggauguugcagc |
| HSA-MIR-30E-3P | cuuucagucggauguauacagc | ||||