基因页面:CADM1
总结吗?
| GeneID | 23705年 |
| 象征 | CADM1 |
| 同义词 | b12 | IGSF4 | IGSF4A | NECL2 | Necl-2 | RA175 | ST17 | SYNCAM | TSLC1 | sTSLC-1 | sgIGSF | synCAM1 |
| 描述 | 细胞粘附分子1 |
| 参考 | MIM: 605686|HGNC: HGNC: 5951|运用:ENSG00000182985|HPRD: 05746|织女:OTTHUMG00000168202 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q23.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.017 |
| 夏洛克假定值 | 0.835 |
| 胎儿β | 0.531 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
| 支持 | 细胞粘附和TRANSSYNAPTIC信号 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.006 | |
| 表达式 | 荟萃分析的基因表达 | P值:1.893 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.004 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg23202979 | 11 | 115373757 | CADM1 | 1.66 e-9 | -0.015 | 1.48 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2427665 | chr11 | 114956088 | CADM1 | 23705年 | 0.19 | 独联体 | ||
| rs2507909 | chr11 | 115010866 | CADM1 | 23705年 | 0.01 | 独联体 | ||
| rs7125361 | chr11 | 115080041 | CADM1 | 23705年 | 3.845 e-5 | 独联体 | ||
| rs11601041 | chr11 | 115083347 | CADM1 | 23705年 | 0.06 | 独联体 | ||
| rs12274772 | chr11 | 115098767 | CADM1 | 23705年 | 0.05 | 独联体 | ||
| rs16829545 | chr2 | 151977407 | CADM1 | 23705年 | 0 | 反式 | ||
| rs7125361 | chr11 | 115080041 | CADM1 | 23705年 | 0 | 反式 | ||
| rs16955618 | chr15 | 29937543 | CADM1 | 23705年 | 0.01 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005102 | 受体结合 | 新闻学会 | 神经递质(术语级别:4) | 15811952 |
| 去:0005102 | 受体结合 | 国际空间站 | 神经递质(术语级别:4) | 12826663 |
| 去:0030165 | PDZ域绑定 | 国际空间站 | 12826663 | |
| 去:0008022 | 蛋白质糖基绑定 | 国际空间站 | 12826663 | |
| 去:0042803 | 蛋白质homodimerization活动 | 国际空间站 | 12826663 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0001913 | T细胞介导的细胞毒性 | 艾达 | 15811952 | |
| 去:0007155 | 细胞粘附 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007156 | 亲同种抗原的细胞粘附 | 国际空间站 | 12826663 | |
| 去:0007157 | 异染的细胞粘附 | 国际空间站 | 12826663 | |
| 去:0007283 | 精子发生 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008037 | 细胞识别 | 艾达 | 15811952 | |
| 去:0008037 | 细胞识别 | 国际空间站 | 12826663 | |
| 去:0006955 | 免疫反应 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006915 | 细胞凋亡 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0042271 | 对自然杀伤细胞介导的细胞毒性 | 艾达 | 15811952 | |
| 去:0042271 | 对自然杀伤细胞介导的细胞毒性 | 国际空间站 | 12826663 | |
| 去:0030154 | 细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0051606 | 检测的刺激 | 艾达 | 15811952 | |
| 去:0051606 | 检测的刺激 | 国际空间站 | 12826663 | |
| 去:0050715 | 积极的调节细胞因子的分泌 | 艾达 | 15811952 | |
| 去:0045786 | 负调控细胞周期 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0050798 | 激活T细胞增殖 | 艾达 | 15811952 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005911 | 信息结 | 国际空间站 | 12826663 | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 艾达 | 15811952 | |
| 去:0016323 | 管基底等离子体膜 | 国际空间站 | 12826663 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG细胞粘附分子凸轮 | 134年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME细胞细胞通讯 | 120年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME交互粘合连接处并且 | 27 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME细胞细胞连接组织 | 56 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME细胞组织结 | 78年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘前列腺癌 | 96年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BERTUCCI髓与乳腺癌导管DN | 169年 | 118年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAVICIONI PAX FOXO1融合的目标 | 255年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TURASHVILI乳腺导管癌和小叶正常的DN | 69年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌导管和基地 | 380年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 武田的目标NUP98 HOXA9融合10 d | 194年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌2小时DN | 88年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌6小时DN | 167年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌24小时 | 557年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维奇缺氧了 | 171年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 维奇DMOG缺氧的 | 130年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ENK紫外线反应表皮DN | 508年 | 354年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARKEY RB1慢性LOF DN | 118年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VANHARANTA子宫肌瘤7 q删除DN | 36 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| EPOXOMICIN CONCANNON凋亡的DN | 172年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NAISHIRO CTNNB1目标LEF1图案 | 8 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WEINMANN适应缺氧 | 29日 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WEINMANN适应缺氧的DN | 41 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN MOHANKUMAR TLX1目标 | 193年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力DN | 637年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼转移了 | 344年 | 180年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH自行车基因 | 648年 | 385年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHIN集群3 B细胞淋巴瘤 | 28 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不知道背景目标2 DN | 464年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| IIZUKA肝癌进展L1 G1 DN | 12 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LE EGR2目标了 | 108年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的喀斯特目标了 | 84年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佐佐木成人T细胞白血病 | 176年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 彭雷帕霉素的反应了 | 203年 | 130年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 松田自然杀伤细胞分化 | 475年 | 313年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肿瘤对胎儿肾脏1 DN | 163年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阮NOTCH1 DN的目标 | 86年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 在APL NOUZOVA甲基化 | 68年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊格莱西亚斯E2F目标了 | 151年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦克朗CREB1 DN的目标 | 57 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标了 | 37 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过NOVA2 ULE拼接 | 43 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 | 428年 | 266年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王SMARCE1目标了 | 280年 | 183年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DURCHDEWALD皮肤致癌DN | 264年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗1 | 528年 | 324年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗4 | 307年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近藤前列腺癌HCP H3K27ME3 | 97年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STEARMAN肺癌早期和晚期 | 125年 | 89年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC DN的目标 | 292年 | 189年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC目标被甲基化DN | 281年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 科茨巨噬细胞M1和M2 | 81年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH三苯氧胺耐药性DN | 258年 | 160年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织DN | 354年 | 216年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 霍克甲基化在癌症 | 56 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK精细胞分化 | 37 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK精子 | 114年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 在肿瘤血管生成HELLEBREKERS沉默 | 80年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HUNSBERGER运动调节基因 | 31日 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHRAETS MLL目标了 | 35 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的肺癌喀斯特DN | 435年 | 289年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MCMURRAY TP53 hra合作响应 | 26 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VALK AML集群16 | 26 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VALK AML和11 q23处重新安排 | 22 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WHITFIELD细胞周期G2 M | 216年 | 124年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STAMBOLSKY应对维生素D3 | 84年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 国外RB1目标融合性的 | 567年 | 365年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ISSAEVA MLL2目标 | 62年 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过KDM3A KRIEG缺氧不 | 770年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PEDRIOLI MIR31目标了 | 221年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LIM乳腺干细胞 | 489年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-10 | 720年 | 726年 | m8 | hsa-miR-10a | UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG |
| hsa-miR-10b | UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU | ||||
| mir - 101 | 714年 | 720年 | 1 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
| hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG | ||||
| mir - 124.1 | 1415年 | 1421年 | 1 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| miR-124/506 | 293年 | 299年 | m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 128 | 673年 | 679年 | 1 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
| hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
| mir - 138 | 521年 | 527年 | 1 | hsa - mir - 138大脑 | AGCUGGUGUUGUGAAUC |
| mir - 144 | 714年 | 720年 | 1 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
| hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG | ||||
| miR-15/16/195/424/497 | 622年 | 628年 | m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| mir - 190 | 1498年 | 1504年 | m8 | hsa - mir - 190 | UGAUAUGUUUGAUAUAUUAGGU |
| mir - 194 | 1790年 | 1796年 | 1 | hsa - mir - 194 | UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA |
| mir - 214 | 409年 | 415年 | m8 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
| mir - 216 | 752年 | 758年 | m8 | hsa - mir - 216 | UAAUCUCAGCUGGCAACUGUG |
| miR-23 | 1358年 | 1364年 | m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-27 | 673年 | 679年 | m8 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
| hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
| mir - 323 | 1358年 | 1364年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 329 | 740年 | 746年 | m8 | hsa - mir - 329大脑 | AACACACCUGGUUAACCUCUUU |
| mir - 486 | 718年 | 724年 | m8 | hsa - mir - 486 | UCCUGUACUGAGCUGCCCCGAG |
| mir - 495 | 307年 | 313年 | m8 | hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU |
| hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU | ||||
| mir - 544 | 280年 | 287年 | 1、m8 | hsa - mir - 544 | AUUCUGCAUUUUUAGCAAGU |
| 米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 | 1998年 | 2004年 | 1 | hsa - mir - 93大脑 | AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG |
| hsa - mir - 302 a | UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 302 b | UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG | ||||
| hsa - mir - 302 c | UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG | ||||
| hsa - mir - 302 d | UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU | ||||
| hsa - mir - 372 | AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU | ||||
| hsa - mir - 373 | GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU | ||||
| hsa - mir - 520 e | AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 a | AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU | ||||
| hsa - mir - 520 b | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 c | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU | ||||
| hsa - mir - 520 d | AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU | ||||