Gene Page:GABARAPL1

概括?
基因 23710
象征 GABARAPL1
Synonyms APG8-LIKE|APG8L|ATG8|ATG8B|ATG8L|GEC1
Description GABA(A) receptor-associated protein like 1
Reference MIM:607420|HGNC:HGNC:4068|Ensembl:ENSG00000139112|HPRD:07601|Vega:OTTHUMG00000168411
Gene type protein-coding
Map location 12p13.2
Pascal p-value 0.132
Sherlock p-value 0.924
Fetal beta -2.294
eGene Myers' cis & trans

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV：GWASDB Genome-wide Association Studies GWASdb records for schizophrenia
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs7132043 chr12 80968399 GABARAPL1 23710 0.19 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
死神:胎儿(13 - 26 postconception凌晨ks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

No co-expressed genes in brain regions


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO：0050811 GABA receptor binding ISS GABA（GO期限：5） -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 9892355
GO:0005515 protein binding ISS -
GO:0048487 beta-tubulin binding ISS -
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005794 Golgi apparatus IEA -
GO:0005874 microtubule IEA -
GO:0005622 intracellular IDA 11256614
GO:0005737 细胞质 IEA -
GO:0005776 autophagic vacuole IDA 15292400
GO:0005783 endoplasmic reticulum IEA -
去：0016020 membrane IEA -

Section V. Pathway annotation

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG REGULATION OF AUTOPHAGY 35 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARENT MTOR SIGNALING UP 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KORKOLA EMBRYONAL CARCINOMA UP 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KORKOLA SEMINOMA UP 44 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSMAN BLADDER CANCER DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS TURQUOISE UP 79 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS MAGENTA UP 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY UP 78 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAATINEN HEMATOPOIETIC STEM CELL DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIDUS METASTASIS DN 161 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 CHRONIC LOF DN 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN UP 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN RESPONSE TO ARSENIC TRIOXIDE 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATTIOLI MULTIPLE MYELOMA SUBGROUPS 16 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONG INTERACT WITH PTTG1 57 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUH COEXPRESSED WITH ID1 AND ID2 UP 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 1 UP 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IIZUKA LIVER CANCER PROGRESSION G1 G2 UP 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CLOCK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET KRAS TARGETS UP 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG TARGETS OF MLL CBP FUSION DN 45 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REN ALVEOLAR RHABDOMYOSARCOMA DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION UP 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODWELL AGING KIDNEY NO BLOOD DN 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODWELL AGING KIDNEY DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 common 77 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEIN NEURON MARKERS 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESRRA TARGETS UP 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 8G 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN UP 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOCHKIS FOXA2 TARGETS 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUECKNER TARGETS OF MIRLET7A3 UP 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PODAR RESPONSE TO ADAPHOSTIN UP 147 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG CORE SERUM RESPONSE DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 36HR UP 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR UP 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS UP 108 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G123 DN 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESRRA TARGETS 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 0 76 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KARLSSON TGFB1 TARGETS DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIERENGA STAT5A TARGETS UP 217 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIERENGA STAT5A TARGETS GROUP2 60 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS UP 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kohoutek CCNT2目标 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG GATA2 TARGETS UP 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-133 453 460 1A,m8 hsa-miR-133a UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU
hsa-miR-133b UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA
miR-143 1145 1151 m8 hsa-miR-143brain UGAGAUGAAGCACUGUAGCUCA
miR-203.1 1135 1142 1A,m8 hsa-miR-203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG