概括
基因 23761
象征 PISD
同义词 DJ858B16 | PSD | PSDC | PSSC | DJ858B16.2
描述 磷脂酰丝氨酸脱羧酶
参考 MIM:612770|HGNC:HGNC:8999|ENSEMBL:ENSG00000241878|HPRD:17854|Vega:Otthumg00000030252
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q12.2
Pascal P值 0.205
胎儿β -0.358
主持人 小脑
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Ambalavanan_2016 整个外显子组测序 该数据集包括在17个cos概率中检测到的20个从头突变。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
PISD CHR22 32021757 C t NM_014338 p。(=) 同义SNV 儿童期精神分裂症 DNM:Ambalavanan_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17572651 CHR1 218943612 PISD 23761 0.13 反式
RS16829545 CHR2 151977407 PISD 23761 5.006e-9 反式
RS3845734 CHR2 171125572 PISD 23761 0.06 反式
RS7584986 CHR2 184111432 PISD 23761 0.01 反式
RS17762315 CHR5 76807576 PISD 23761 0.03 反式
RS2393316 Chr10 59333070 PISD 23761 0.03 反式
RS11185824 Chr10 91393711 PISD 23761 0.13 反式
RS16955618 CHR15 29937543 PISD 23761 1.112E-13 反式
RS1041786 CHR21 22617710 PISD 23761 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004609 磷脂酰丝氨酸脱羧酶活性 IEA -
GO:0016829 裂解酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008654 磷脂生物合成过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005739 线粒体 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG甘油磷脂代谢 77 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HNF3A途径 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲基化调节的米西亚利亚 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞向上 90 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化小脑DN 86 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP 49 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman vincristine抗性B 38 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman Vincristine抗性全部 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-15/16/195/424/497 819 826 1A,M8 HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-485-3p 1042 1049 1A,M8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu
mir-503 820 826 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag