基因页:PISD
概括?
基因 | 23761 |
象征 | PISD |
同义词 | DJ858B16 | PSD | PSDC | PSSC | DJ858B16.2 |
描述 | 磷脂酰丝氨酸脱羧酶 |
参考 | MIM:612770|HGNC:HGNC:8999|ENSEMBL:ENSG00000241878|HPRD:17854|Vega:Otthumg00000030252 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q12.2 |
Pascal P值 | 0.205 |
胎儿β | -0.358 |
主持人 | 小脑 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Ambalavanan_2016 | 整个外显子组测序 | 该数据集包括在17个cos概率中检测到的20个从头突变。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PISD | CHR22 | 32021757 | C | t | NM_014338 | p。(=) | 同义SNV | 儿童期精神分裂症 | DNM:Ambalavanan_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17572651 | CHR1 | 218943612 | PISD | 23761 | 0.13 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | PISD | 23761 | 5.006e-9 | 反式 | ||
RS3845734 | CHR2 | 171125572 | PISD | 23761 | 0.06 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | PISD | 23761 | 0.01 | 反式 | ||
RS17762315 | CHR5 | 76807576 | PISD | 23761 | 0.03 | 反式 | ||
RS2393316 | Chr10 | 59333070 | PISD | 23761 | 0.03 | 反式 | ||
RS11185824 | Chr10 | 91393711 | PISD | 23761 | 0.13 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | PISD | 23761 | 1.112E-13 | 反式 | ||
RS1041786 | CHR21 | 22617710 | PISD | 23761 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PISD_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004609 | 磷脂酰丝氨酸脱羧酶活性 | IEA | - | |
GO:0016829 | 裂解酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008654 | 磷脂生物合成过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG甘油磷脂代谢 | 77 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HNF3A途径 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲基化调节的米西亚利亚 | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化小脑DN | 86 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP | 49 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman vincristine抗性B | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman Vincristine抗性全部 | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-15/16/195/424/497 | 819 | 826 | 1A,M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
mir-485-3p | 1042 | 1049 | 1A,M8 | HSA-MIR-485-3P | gucauacgggcucucucucucucu |
mir-503 | 820 | 826 | 1a | HSA-MIR-503 | uagcagcgggaacaguucugcag |