基因页:OSBP2
概括?
基因 | 23762 |
象征 | OSBP2 |
同义词 | HLM | ORP-4 | ORP4 | OSBPL1 | OSBPL4 |
描述 | 氧蛋白酶结合蛋白2 |
参考 | MIM:606729|HGNC:HGNC:8504|ENSEMBL:ENSG00000184792|HPRD:09471|Vega:Otthumg00000151153 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q12.2 |
Pascal P值 | 0.004 |
耶和华 | 小脑 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OSBP2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008202 | 类固醇代谢过程 | IEA | - | |
去:0006869 | 脂质运输 | IEA | - | |
细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27Me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild Myc致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村转移模型DN | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集7 | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集8 | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MEISSNER NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a Targets Group1 | 136 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8目标DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124.1 | 1327 | 1333 | M8 | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-124/506 | 1327 | 1333 | 1a | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-137 | 844 | 850 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-31 | 463 | 470 | 1A,M8 | HSA-MIR-31 | aggcaagaugcuggcauagcug |
mir-410 | 978 | 984 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |