基因页:BRD1
概括?
基因 | 23774 |
象征 | BRD1 |
同义词 | BRL | BRPF1 | BRPF2 |
描述 | 包含1的溴结构域 |
参考 | MIM:604589|HGNC:HGNC:1102|ENSEMBL:ENSG00000100425|HPRD:06848|Vega:Otthumg00000150288 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.33 |
Pascal P值 | 6.558E-6 |
胎儿β | 1.195 |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | BRD1 | 23774 | 0.04 | 反式 | ||
RS6741060 | CHR2 | 217169088 | BRD1 | 23774 | 0.1 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | BRD1 | 23774 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BRD1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008150 | 生物_Process | nd | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 10602503 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Laiho结直肠癌锯齿状DN | 86 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mantovani NFKB靶向DN | 11 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mantovani病毒GPCR信号传导DN | 49 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌22q13 Amplicon | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su睾丸 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC DN的响应 | 123 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheng由雌二醇印记 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼克对Proc处理DN的反应 | 27 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-137 | 792 | 798 | 1a | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-142-5p | 589 | 595 | 1a | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
mir-155 | 876 | 882 | M8 | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |
mir-181 | 284 | 290 | M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-21 | 39 | 45 | M8 | HSA-MIR-21脑 | uagcuuaucagacugauguuga |
HSA-MIR-590 | gagcuuauucauaaaaagugcag | ||||
mir-30-5p | 740 | 747 | 1A,M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-448 | 625 | 631 | M8 | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
mir-455 | 642 | 649 | 1A,M8 | HSA-MIR-455 | Uaugugccuuuggacuacaucg |
mir-543 | 285 | 291 | M8 | HSA-MIR-543 | aaacauucgcggugcacuucu |