概括
基因 23780
象征 apol2
同义词 apol-ii | apol3
描述 载脂蛋白L2
参考 MIM:607252|HGNC:HGNC:619|Ensembl:ENSG00000128335|HPRD:06263|Vega:Otthumg00000150634
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q12
Pascal P值 0.201
Sherlock P值 0.953
胎儿beta -0.122
耶和华 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
PMID:COOCCUR 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4820222 CHR22 36609738 apol2 23780 4.26E-4 顺式
RS11748886 CHR5 167702040 apol2 23780 0.08 反式
RS17235614 CHR13 97953192 apol2 23780 0.11 反式
RS4820222 CHR22 36609738 apol2 23780 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005102 受体结合 nas 神经递质(GO期限:4) 11374903
去:0008289 脂质结合 nas 11374903
去:0008035 高密度脂蛋白结合 nas 11374903
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008203 胆固醇代谢过程 nas 11374903
去:0006953 急性期反应 nas 11374903
去:0006629 脂质代谢过程 nas 11374903|11944986
去:0006869 脂质运输 nas 11374903
去:0007275 多细胞生物发育 nas 11374903
GO:0042157 脂蛋白代谢过程 IEA -
去:0060135 怀孕涉及的母亲过程 nas 11374903
细胞成分 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005789 内质网膜 nas 11374903
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ropero HDAC2目标 114 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨那对ifng的回应 78 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Okumura炎症反应LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一个EGF脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因