基因页:apol2
概括?
基因 | 23780 |
象征 | apol2 |
同义词 | apol-ii | apol3 |
描述 | 载脂蛋白L2 |
参考 | MIM:607252|HGNC:HGNC:619|Ensembl:ENSG00000128335|HPRD:06263|Vega:Otthumg00000150634 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22Q12 |
Pascal P值 | 0.201 |
Sherlock P值 | 0.953 |
胎儿beta | -0.122 |
耶和华 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID:COOCCUR | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4820222 | CHR22 | 36609738 | apol2 | 23780 | 4.26E-4 | 顺式 | ||
RS11748886 | CHR5 | 167702040 | apol2 | 23780 | 0.08 | 反式 | ||
RS17235614 | CHR13 | 97953192 | apol2 | 23780 | 0.11 | 反式 | ||
RS4820222 | CHR22 | 36609738 | apol2 | 23780 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/APOL2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005102 | 受体结合 | nas | 神经递质(GO期限:4) | 11374903 |
去:0008289 | 脂质结合 | nas | 11374903 | |
去:0008035 | 高密度脂蛋白结合 | nas | 11374903 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008203 | 胆固醇代谢过程 | nas | 11374903 | |
去:0006953 | 急性期反应 | nas | 11374903 | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | nas | 11374903|11944986 | |
去:0006869 | 脂质运输 | nas | 11374903 | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | nas | 11374903 | |
GO:0042157 | 脂蛋白代谢过程 | IEA | - | |
去:0060135 | 怀孕涉及的母亲过程 | nas | 11374903 | |
细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005789 | 内质网膜 | nas | 11374903 | |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ropero HDAC2目标 | 114 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
萨那对ifng的回应 | 78 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Okumura炎症反应LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 | 228 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一个EGF脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |