概括
基因 239
象征 Alox12
同义词 12-lox | 12s-lox | log12
描述 蛛网酸12-脂氧合酶
参考 MIM:152391|HGNC:HGNC:429|ENSEMBL:ENSG00000108839|HPRD:01066|Vega:Otthumg00000102088
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p13.1
Pascal P值 0.603
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG22040627 17 6617030 Alox12 0.002 -7.554 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATG9B 0.67 0.56
SLC29A3 0.66 0.63
ptprm 0.65 0.59
TMEM132E 0.65 0.62
法庭 0.65 0.64
TNK1 0.64 0.65
exoc3l 0.64 0.52
AP001979.1 0.62 0.52
msto1 0.62 0.60
cacna2d2 0.62 0.65
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.46 -0.47
AF347015.31 -0.44 -0.42
MT-CO2 -0.43 -0.41
AF347015.2 -0.42 -0.38
AF347015.8 -0.42 -0.39
mt-cyb -0.41 -0.40
鼻孔 -0.41 -0.42
GNG11 -0.40 -0.45
MT-ATP8 -0.40 -0.40
AL139819.3 -0.40 -0.44

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg蛛网膜酸代谢 58 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Barretts食道和食道癌DN 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌E 89 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由KRAS DN 120 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因