基因页：一种LOX15
概括？
| 基因 | 246 |
| Symbol | 一种LOX15 |
| Synonyms | 12-LOX|15-LOX-1|15LOX-1 |
| Description | arachidonate 15-lipoxygenase |
| 参考erence | MIM:152392|HGNC：HGNC：433|Ensembl:ENSG00000161905|HPRD：01067|Vega：Otthumg0000000090746 |
| Gene type | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17p13.3 |
| Pascal p-value | 0.176 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 Cerebellum Cortex 下丘脑 元 |
| 支持 | CompositeSet |
数据源中的基因
| 基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV:PGCnp | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Fromer_2014 | Whole Exome Sequencing analysis | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNMtable
DNMtable| Gene | Chromosome | Position | 参考 | alt | 成绩单 | 一种一种change | Mutation type | 筛 | CG46 | Trait | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 一种LOX15 | CHR17 | 4542904 | 一种 | G | NM_001140 | p.53V>A | 错过 | 精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | Chromosome | Position | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2255888 | 17 | 4545581 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 8.829E-9 | 0 | 8 | gtex_brain_ba24 |
| RS11568061 | 17 | 4546445 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.333E-8 | 0 | -856 | gtex_brain_ba24 |
| RS9894225 | 17 | 4546559 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 7.286e-9 | 0 | -970 | gtex_brain_ba24 |
| RS9906642 | 17 | 4546989 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.638E-8 | 0 | -1400 | gtex_brain_ba24 |
| RS71147071 | 17 | 4547001 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.638E-8 | 0 | -1412 | gtex_brain_ba24 |
| rs7213481 | 17 | 4547906 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.251E-8 | 0 | -2317 | gtex_brain_ba24 |
| RS145394571 | 17 | 4550672 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.242E-8 | 0 | -5083 | gtex_brain_ba24 |
| rs397748648 | 17 | 4551079 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.295E-8 | 0 | -5490 | gtex_brain_ba24 |
| rs58176940 | 17 | 4552955 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.434E-8 | 0 | -7366 | gtex_brain_ba24 |
| RS72835619 | 17 | 4557285 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.043E-8 | 0 | -11696 | gtex_brain_ba24 |
| RS72835620 | 17 | 4558128 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.217E-8 | 0 | -12539 | gtex_brain_ba24 |
| RS9905711 | 17 | 4558662 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.242E-8 | 0 | -13073 | gtex_brain_ba24 |
| rs139021596 | 17 | 4559281 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.286E-8 | 0 | -13692 | gtex_brain_ba24 |
| RS11655203 | 17 | 4559393 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.158E-8 | 0 | -13804 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790670 | 17 | 4559833 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.566E-8 | 0 | -14244 | gtex_brain_ba24 |
| RS61320021 | 17 | 4559853 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.695E-8 | 0 | -14264 | gtex_brain_ba24 |
| rs12941694 | 17 | 4560033 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.613E-7 | 0 | -14444 | gtex_brain_ba24 |
| RS56170457 | 17 | 4560141 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.124e-8 | 0 | -14552 | gtex_brain_ba24 |
| RS72835625 | 17 | 4560274 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.822e-8 | 0 | -14685 | gtex_brain_ba24 |
| RS72835626 | 17 | 4560326 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.228e-8 | 0 | -14737 | gtex_brain_ba24 |
| RS55986729 | 17 | 4560499 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.439E-8 | 0 | -14910 | gtex_brain_ba24 |
| rs56020376 | 17 | 4560909 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.125E-8 | 0 | -15320 | gtex_brain_ba24 |
| RS2054467 | 17 | 4561074 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.212E-7 | 0 | -15485 | gtex_brain_ba24 |
| rs56124631 | 17 | 4561378 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.098E-8 | 0 | -15789 | gtex_brain_ba24 |
| RS55981776 | 17 | 4561401 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.098E-8 | 0 | -15812 | gtex_brain_ba24 |
| rs55780247 | 17 | 4561499 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.39e-8 | 0 | -15910 | gtex_brain_ba24 |
| RS56357040 | 17 | 4561566 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.232E-8 | 0 | -15977 | gtex_brain_ba24 |
| rs7215274 | 17 | 4561834 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.43e-8 | 0 | -16245 | gtex_brain_ba24 |
| RS7219606 | 17 | 4561928 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.49E-8 | 0 | -16339 | gtex_brain_ba24 |
| rs7213896 | 17 | 4562082 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.49E-8 | 0 | -16493 | gtex_brain_ba24 |
| RS7223840 | 17 | 4562150 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.918E-8 | 0 | -16561 | gtex_brain_ba24 |
| rs7217849 | 17 | 4562165 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.49E-8 | 0 | -16576 | gtex_brain_ba24 |
| RS7219787 | 17 | 4562257 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.664E-8 | 0 | -16668 | gtex_brain_ba24 |
| RS398119647 | 17 | 4562356 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.584E-8 | 0 | -16767 | gtex_brain_ba24 |
| RS72835630 | 17 | 4562449 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.49E-8 | 0 | -16860 | gtex_brain_ba24 |
| rs56364707 | 17 | 4562579 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.49E-8 | 0 | -16990 | gtex_brain_ba24 |
| rs55959711 | 17 | 4562581 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.567E-8 | 0 | -16992 | gtex_brain_ba24 |
| rs55782417 | 17 | 4562845 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.567E-8 | 0 | -17256 | gtex_brain_ba24 |
| rs55869432 | 17 | 4562901 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.49E-8 | 0 | -17312 | gtex_brain_ba24 |
| RS72835635 | 17 | 4563127 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.49E-8 | 0 | -17538 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790671 | 17 | 4563444 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.33e-8 | 0 | -17855 | gtex_brain_ba24 |
| rs9911552 | 17 | 4563489 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.69e-8 | 0 | -17900 | gtex_brain_ba24 |
| rs145594351 | 17 | 4563608 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.229E-8 | 0 | -18019 | gtex_brain_ba24 |
| RS56184690 | 17 | 4563660 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.202E-8 | 0 | -18071 | gtex_brain_ba24 |
| rs369347996 | 17 | 4564654 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.649E-8 | 0 | -19065 | gtex_brain_ba24 |
| RS4538065 | 17 | 4566015 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.064e-8 | 0 | -20426 | gtex_brain_ba24 |
| rs4346260 | 17 | 4567215 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.518E-8 | 0 | -21626 | gtex_brain_ba24 |
| RS8074545 | 17 | 4567337 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.063E-8 | 0 | -21748 | gtex_brain_ba24 |
| RS55974786 | 17 | 4567564 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.649E-8 | 0 | -21975 | gtex_brain_ba24 |
| RS4470203 | 17 | 4567798 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 8.678E-9 | 0 | -22209 | gtex_brain_ba24 |
| rs9916135 | 17 | 4568115 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.614E-8 | 0 | -22526 | gtex_brain_ba24 |
| RS9915105 | 17 | 4568742 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.889E-8 | 0 | -23153 | gtex_brain_ba24 |
| RS68190844 | 17 | 4568953 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.208E-8 | 0 | -23364 | gtex_brain_ba24 |
| RS5818975 | 17 | 4569846 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.101E-9 | 0 | -24257 | gtex_brain_ba24 |
| RS4416072 | 17 | 4570036 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.014E-9 | 0 | -24447 | gtex_brain_ba24 |
| rs9901930 | 17 | 4570233 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.458E-9 | 0 | -24644 | gtex_brain_ba24 |
| rs9904358 | 17 | 4570263 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 8.352e-9 | 0 | -24674 | gtex_brain_ba24 |
| RS372648332 | 17 | 4570466 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.336E-8 | 0 | -24877 | gtex_brain_ba24 |
| RS11657052 | 17 | 4570573 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.149E-9 | 0 | -24984 | gtex_brain_ba24 |
| rs56396454 | 17 | 4571037 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.109E-8 | 0 | -25448 | gtex_brain_ba24 |
| RS149745524 | 17 | 4571287 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.879E-7 | 0 | -25698 | gtex_brain_ba24 |
| rs72068121 | 17 | 4571289 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.82E-7 | 0 | -25700 | gtex_brain_ba24 |
| rs145965968 | 17 | 4572105 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.014E-8 | 0 | -26516 | gtex_brain_ba24 |
| RS142108572 | 17 | 4572470 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.536E-9 | 0 | -26881 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790213 | 17 | 4572677 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.498E-8 | 0 | -27088 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790214 | 17 | 4573179 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.272E-8 | 0 | -27590 | gtex_brain_ba24 |
| RS72835642 | 17 | 4573407 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.332e-9 | 0 | -27818 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790672 | 17 | 4573414 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.231E-8 | 0 | -27825 | gtex_brain_ba24 |
| rs7222133 | 17 | 4573611 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.188e-8 | 0 | -28022 | gtex_brain_ba24 |
| RS72835643 | 17 | 4573612 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.355e-9 | 0 | -28023 | gtex_brain_ba24 |
| RS72835644 | 17 | 4573667 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.455e-9 | 0 | -28078 | gtex_brain_ba24 |
| rs145842529 | 17 | 4573846 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.185E-9 | 0 | -28257 | gtex_brain_ba24 |
| RS2174830 | 17 | 4573992 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.868E-8 | 0 | -28403 | gtex_brain_ba24 |
| rs8078044 | 17 | 4573994 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.8E-8 | 0 | -28405 | gtex_brain_ba24 |
| RS9436 | 17 | 4574751 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.252e-9 | 0 | -29162 | gtex_brain_ba24 |
| RS55677157 | 17 | 4576620 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.355e-9 | 0 | -31031 | gtex_brain_ba24 |
| RS11658808 | 17 | 4577112 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.188e-8 | 0 | -31523 | gtex_brain_ba24 |
| RS55884013 | 17 | 4579301 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.226E-9 | 0 | -33712 | gtex_brain_ba24 |
| RS8071990 | 17 | 4579638 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.188e-8 | 0 | -34049 | gtex_brain_ba24 |
| rs10775384 | 17 | 4581103 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 8.694E-8 | 0 | -35514 | gtex_brain_ba24 |
| RS55682338 | 17 | 4582183 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 8.967E-9 | 0 | -36594 | gtex_brain_ba24 |
| RS9902000 | 17 | 4582426 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.911E-9 | 0 | -36837 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790674 | 17 | 4583023 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.011E-7 | 0 | -37434 | gtex_brain_ba24 |
| RS139864929 | 17 | 4584670 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.42E-8 | 0 | -39081 | gtex_brain_ba24 |
| rs12452404 | 17 | 4587355 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 7.726E-8 | 0 | -41766 | gtex_brain_ba24 |
| RS72824951 | 17 | 4588500 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.997E-8 | 0 | -42911 | gtex_brain_ba24 |
| rs56237051 | 17 | 4589156 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.997E-8 | 0 | -43567 | gtex_brain_ba24 |
| RS55956806 | 17 | 4589209 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.319E-8 | 0 | -43620 | gtex_brain_ba24 |
| RS147867504 | 17 | 4589875 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.341 e - | 0 | -44286 | gtex_brain_ba24 |
| RS143670032 | 17 | 4590041 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.341 e - | 0 | -44452 | gtex_brain_ba24 |
| rs140888387 | 17 | 4590088 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.341 e - | 0 | -44499 | gtex_brain_ba24 |
| RS72824957 | 17 | 4590496 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.006e-8 | 0 | -44907 | gtex_brain_ba24 |
| rs139330508 | 17 | 4591490 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.011E-8 | 0 | -45901 | gtex_brain_ba24 |
| rs146767065 | 17 | 4593115 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.344e-7 | 0 | -47526 | gtex_brain_ba24 |
| rs3947040 | 17 | 4593566 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.237E-7 | 0 | -47977 | gtex_brain_ba24 |
| rs2135911 | 17 | 4593602 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.237E-7 | 0 | -48013 | gtex_brain_ba24 |
| RS7216467 | 17 | 4593867 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.353E-7 | 0 | -48278 | gtex_brain_ba24 |
| RS906453 | 17 | 4594965 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 7.803E-8 | 0 | -49376 | gtex_brain_ba24 |
| RS55711754 | 17 | 4595488 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.019E-8 | 0 | -49899 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790681 | 17 | 4596169 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.242E-7 | 0 | -50580 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790682 | 17 | 4596541 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.242E-7 | 0 | -50952 | gtex_brain_ba24 |
| RS72824966 | 17 | 4596679 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.025E-8 | 0 | -51090 | gtex_brain_ba24 |
| RS4438362 | 17 | 4597887 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.246E-7 | 0 | -52298 | gtex_brain_ba24 |
| RS7222305 | 17 | 4598593 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.023e-8 | 0 | -53004 | gtex_brain_ba24 |
| rs56239958 | 17 | 4600280 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.03e-8 | 0 | -54691 | gtex_brain_ba24 |
| rs56104723 | 17 | 4600510 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.319E-8 | 0 | -54921 | gtex_brain_ba24 |
| rs55999196 | 17 | 4600655 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.039E-8 | 0 | -55066 | gtex_brain_ba24 |
| RS56003988 | 17 | 4600764 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.033e-8 | 0 | -55175 | gtex_brain_ba24 |
| RS7214635 | 17 | 4601020 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.965E-8 | 0 | -55431 | gtex_brain_ba24 |
| rs139511077 | 17 | 4601733 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.134E-8 | 0 | -56144 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790685 | 17 | 4602515 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.852E-7 | 0 | -56926 | gtex_brain_ba24 |
| RS9891316 | 17 | 4602937 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.405E-7 | 0 | -57348 | gtex_brain_ba24 |
| RS11653940 | 17 | 4603647 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.13E-8 | 0 | -58058 | gtex_brain_ba24 |
| RS12451741 | 17 | 4604030 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.54E-7 | 0 | -58441 | gtex_brain_ba24 |
| RS28662192 | 17 | 4604497 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.153E-7 | 0 | -58908 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790687 | 17 | 4604634 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.576E-7 | 0 | -59045 | gtex_brain_ba24 |
| RS9901392 | 17 | 4604836 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.609E-7 | 0 | -59247 | gtex_brain_ba24 |
| RS9894735 | 17 | 4604838 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.61E-7 | 0 | -59249 | gtex_brain_ba24 |
| RS201988837 | 17 | 4604838 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.609E-7 | 0 | -59249 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790688 | 17 | 4605068 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.613E-7 | 0 | -59479 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790689 | 17 | 4605200 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.624E-7 | 0 | -59611年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1973555 | 17 | 4605887 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.624E-7 | 0 | -60298 | gtex_brain_ba24 |
| rs12453305 | 17 | 4606395 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.629E-7 | 0 | -60806 | gtex_brain_ba24 |
| RS7225717 | 17 | 4608052 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.215E-7 | 0 | -62463 | gtex_brain_ba24 |
| RS2174831 | 17 | 4608275 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.354e-7 | 0 | -62686 | gtex_brain_ba24 |
| RS7210729 | 17 | 4608389 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.47E-7 | 0 | -62800 | gtex_brain_ba24 |
| RS7215300 | 17 | 4608622 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.528e-7 | 0 | -63033 | gtex_brain_ba24 |
| RS200739390 | 17 | 4608774 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.299E-6 | 0 | -63185 | gtex_brain_ba24 |
| rs60410792 | 17 | 4608777 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.534E-7 | 0 | -63188 | gtex_brain_ba24 |
| RS7210953 | 17 | 4608870 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.605E-8 | 0 | -63281 | gtex_brain_ba24 |
| RS10562310 | 17 | 4608882 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.53E-7 | 0 | -63293 | gtex_brain_ba24 |
| RS61463697 | 17 | 4609422 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.841E-7 | 0 | -63833 | gtex_brain_ba24 |
| rs12601796 | 17 | 4610477 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.626E-7 | 0 | -64888 | gtex_brain_ba24 |
| RS4790692 | 17 | 4611302 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.247E-7 | 0 | -65713 | gtex_brain_ba24 |
| RS9893958 | 17 | 4611388 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.497E-7 | 0 | -65799 | gtex_brain_ba24 |
| rs8065068 | 17 | 4611453 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.508E-7 | 0 | -65864 | gtex_brain_ba24 |
| rs57038129 | 17 | 4611779 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.906E-8 | 0 | -66190 | gtex_brain_ba24 |
| RS55787856 | 17 | 4611786 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.587E-8 | 0 | -66197 | gtex_brain_ba24 |
| rs2326118 | 17 | 4611851 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.494E-7 | 0 | -66262 | gtex_brain_ba24 |
| rs55805626 | 17 | 4612249 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.32E-8 | 0 | -66660 | gtex_brain_ba24 |
| RS8071086 | 17 | 4612866 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.584e-7 | 0 | -67277 | gtex_brain_ba24 |
| RS8069382 | 17 | 4612874 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.591E-7 | 0 | -67285 | gtex_brain_ba24 |
| RS72824977 | 17 | 4612975 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.322E-8 | 0 | -67386 | gtex_brain_ba24 |
| rs34230287 | 17 | 4613630 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.309E-8 | 0 | -68041 | gtex_brain_ba24 |
| RS11868227 | 17 | 4614539 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.121 e - | 0 | -68950 | gtex_brain_ba24 |
| RS3786047 | 17 | 4615098 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.692E-7 | 0 | -69509 | gtex_brain_ba24 |
| RS35592645 | 17 | 4616387 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.057E-8 | 0 | -70798 | gtex_brain_ba24 |
| RS11324202 | 17 | 4617388 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 7.299E-7 | 0 | -71799 | gtex_brain_ba24 |
| RS144830084 | 17 | 4618101 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.045E-8 | 0 | -72512 | gtex_brain_ba24 |
| RS35741745 | 17 | 4620897 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.359E-8 | 0 | -75308 | gtex_brain_ba24 |
| RS28365158 | 17 | 4620928 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.363E-8 | 0 | -75339 | gtex_brain_ba24 |
| RS4522461 | 17 | 4621773 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.964e-8 | 0 | -76184 | gtex_brain_ba24 |
| rs34199454 | 17 | 4622203 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.469E-8 | 0 | -76614 | gtex_brain_ba24 |
| RS28365160 | 17 | 4622551 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.494e-8 | 0 | -76962 | gtex_brain_ba24 |
| RS1045280 | 17 | 4622638 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.237E-7 | 0 | -77049 | gtex_brain_ba24 |
| rs2271167 | 17 | 4622880 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.304e-7 | 0 | -77291 | gtex_brain_ba24 |
| RS35980444 | 17 | 4623375 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 3.548e-8 | 0 | -77786 | gtex_brain_ba24 |
| rs35383686 | 17 | 4623456 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 6.623E-8 | 0 | -77867 | gtex_brain_ba24 |
| RS9913156 | 17 | 4624966 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 2.234E-7 | 0 | -79377 | gtex_brain_ba24 |
| RS2036657 | 17 | 4625159 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.044e-6 | 0 | -79570 | gtex_brain_ba24 |
| rs35795124 | 17 | 4625212 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.412E-7 | 0 | -79623 | gtex_brain_ba24 |
| rs71904792 | 17 | 4625568 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.754 e-8 | 0 | -79979 | gtex_brain_ba24 |
| rs8068774 | 17 | 4625669 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.752E-8 | 0 | -80080 | gtex_brain_ba24 |
| rs8068781 | 17 | 4625672 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.751E-8 | 0 | -80083 | gtex_brain_ba24 |
| rs8064343 | 17 | 4625758 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.245E-7 | 0 | -80169 | gtex_brain_ba24 |
| rs35045092 | 17 | 4625800 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.18e-7 | 0 | -80211 | gtex_brain_ba24 |
| rs8064504 | 17 | 4625870 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.69E-8 | 0 | -80281 | gtex_brain_ba24 |
| rs35186877 | 17 | 4625892 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.802E-9 | 0 | -80303 | gtex_brain_ba24 |
| RS34625233 | 17 | 4625958 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 1.738E-7 | 0 | -80369 | gtex_brain_ba24 |
| RS67966027 | 17 | 4626086 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 9.167e-8 | 0 | -80497 | gtex_brain_ba24 |
| RS36019118 | 17 | 4626220 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.609E-8 | 0 | -80631 | gtex_brain_ba24 |
| RS35552228 | 17 | 4626318 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 4.863E-7 | 0 | -80729 | gtex_brain_ba24 |
| rs145042193 | 17 | 4626587 | 一种LOX15 | ENSG00000161905.8 | 5.813E-7 | 0 | -80998 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
| 一种NKRD55 | 0.59 | 0.54 |
| CORT | 0.59 | 0.56 |
| apitd1 | 0.57 | 0.49 |
| C5orf40 | 0.57 | 0.60 |
| C4orf44 | 0.55 | 0.43 |
| Wnt1 | 0.54 | 0.57 |
| CHRM4 | 0.54 | 0.51 |
| MADCAM1 | 0.54 | 0.38 |
| Sectm1 | 0.53 | 0.50 |
| rxrg | 0.53 | 0.57 |
| Top 10 negatively co-expressed genes | ||
| Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
| NEUROD6 | -0.46 | -0.41 |
| ZNF435 | -0.46 | -0.51 |
| COTL1 | -0.45 | -0.48 |
| SNX7 | -0.45 | -0.46 |
| CBS | -0.45 | -0.45 |
| CSRP2 | -0.45 | -0.56 |
| SLA | -0.45 | -0.41 |
| mllt3 | -0.44 | -0.48 |
| ZEB2 | -0.44 | -0.45 |
| Dact1 | -0.43 | -0.38 |
V.途径注释
| Pathway name | 路径大小 | # SZGR 2.0 genes in pathway | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg蛛网膜酸代谢 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG亚油酸代谢 | 29 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL4 2 Pathway | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS UP | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GOZGIT ESR1 TARGETS DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH SUZ12 TARGETS | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH EED TARGETS | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH ES WITH H3K27ME3 | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH PRC2 TARGETS | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bystroem与IL5 UP相关 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中岛嗜酸性粒细胞 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LENAOUR DENDRITIC CELL MATURATION UP | 114 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| H3K27me3 | 97 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION D | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应15 | 35 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE BMP2 TARGETS UP | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |