概括
基因 249
象征 Alpl
同义词 ap-tnap | aptnap | hops | tnap | tnsalp
描述 碱性磷酸酶,肝/骨/肾脏
参考 MIM:171760|HGNC:HGNC:438|ENSEMBL:ENSG00000162551|HPRD:01377|Vega:Otthumg00000002949
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.12
Pascal P值 0.473
Sherlock P值 0.699
胎儿β -1.128
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06035250 1 21835217 Alpl 5.43e-5 0.331 0.022 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2922180 CHR3 125280472 Alpl 249 0.02 反式
SNP_A-2291543 0 Alpl 249 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg叶酸生物合成 11 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Greenbaum E2A靶向DN 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yao Hoxa10通过孕酮DN靶标 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江VHL目标 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Moreira对TSA DN的响应 18 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma dn 100 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内利未成熟的中性粒细胞DN 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇8的时间反应8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨森对促性腺营养蛋白的反应 91 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin的反应 90 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG AR目标DN 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因