基因页:Alpl
概括?
基因 | 249 |
象征 | Alpl |
同义词 | ap-tnap | aptnap | hops | tnap | tnsalp |
描述 | 碱性磷酸酶,肝/骨/肾脏 |
参考 | MIM:171760|HGNC:HGNC:438|ENSEMBL:ENSG00000162551|HPRD:01377|Vega:Otthumg00000002949 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.12 |
Pascal P值 | 0.473 |
Sherlock P值 | 0.699 |
胎儿β | -1.128 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06035250 | 1 | 21835217 | Alpl | 5.43e-5 | 0.331 | 0.022 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2922180 | CHR3 | 125280472 | Alpl | 249 | 0.02 | 反式 | ||
SNP_A-2291543 | 0 | Alpl | 249 | 0.05 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg叶酸生物合成 | 11 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Greenbaum E2A靶向DN | 21 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yao Hoxa10通过孕酮DN靶标 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Moreira对TSA DN的响应 | 18 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma dn | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内利未成熟的中性粒细胞DN | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN | 238 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇8的时间反应8 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
萨森对促性腺营养蛋白的反应 | 91 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对Forskolin的反应 | 90 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KANG AR目标DN | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |