SZGR2 - Beplay体育中心

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基因	2521
象征	FUS
Synonyms	ALS6 \| ETM4 \| FUS1 \| HNRNPP2 \| POMP75 \| TLS
Description	FUS RNA结合蛋白
Reference	MIM:137070\|HGNC:HGNC:4010\|ENSEMBL：ENSG00000089280\|HPRD：00660\|Vega:OTTHUMG00000132395
基因类型	蛋白质编码
Map location	16p11.2
Pascal p-value	0.226
Sherlock p-value	0.178
胎儿β	0.817
DMG	1(# studies)
Support	G2CDB.HUMANNRC G2Cdb.humanPSP 潜在的突触基因

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG：JAFFE_2016	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。	1
PMID：cooccur	High-throughput literature-search	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
gsma_iie	Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples)	Psr: 0.01775
Literature	High-throughput literature-search	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

Differentially methylated gene

Probe	染色体	位置	Nearest gene	p（dis）	Beta (dis)	fdr（dis）	学习
cg17022635	16	31190875	FUS	1.09E-8	-0.008	4.61E-6	DMG：JAFFE_2016

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10名中的基因
Gene	Pearson's Correlation	斯皮尔曼的相关性
ISG15	0.98	0.89
OAS1	0.94	0.84
BST2	0.93	0.82
ifitm1	0.92	0.80
ifi35	0.89	0.84
OASL	0.88	0.81
PLA1A	0.85	0.70
TAP1	0.84	0.79
PSMB8	0.84	0.84
HLA-A	0.82	0.65

Top 10 negatively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	斯皮尔曼的相关性
DDX42	-0.46	-0.63
GGNBP2	-0.45	-0.61
C14orf102	-0.45	-0.62
ABCF1	-0.45	-0.60
USP48	-0.45	-0.66
IWS1	-0.45	-0.73
PELP1	-0.45	-0.68
Ankrd17	-0.44	-0.66
rnasen	-0.44	-0.74
SF3B2	-0.44	-0.68

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0003674	Molecular_Function	nd		-
去：0003677	DNA binding	IEA		-
GO:0003723	RNA结合	TAS		8510758
去：0005515	蛋白质结合	IPI		9774382
GO:0008270	锌离子结合	IEA		-
GO：0046872	metal ion binding	IEA		-
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0000398	核mRNA剪接，通过剪接体	经验		12226669
GO:0008150	biological_process	nd		-
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005575	cellular_component	nd		-
去：0005622	细胞内	IEA		-
去：0005634	nucleus	TAS		8510758
去：0005730	nucleolus	IDA		18029348

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
EIF6	2 \| CAB \| EIF3A \| ITGB4BP \| b \| b(2)gcn \| gcn \| p27BBP	eukaryotic translation initiation factor 6	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
fusip1	fusip2 \|NSSR \|SFRS13 \|srp38 \|SRRP40 \|tasr \|tasr1 \|tasr2	FUS相互作用蛋白（丝氨酸/精氨酸富含）1	-	HPRD,BioGRID	9774382\|10779324
GRIN1	NMDA1 \| NMDAR1 \| NR1	谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸1	-	HPRD	10862698
ILF3	CBTF \|drbf \|DRBP76 \|mmp4 \|mphosph4 \|mpp4 \|NF-AT-90 \|NF110 \|NF90 \|nfar \| NFAR-1 \| NFAR2 \| TCP110 \| TCP80	白介素增强子结合因子3，90kDa	-	HPRD,BioGRID	11438536
PRMT1	ANM1 \|HCP1 \|HRMT1L2 \|IR1B4	蛋白精氨酸甲基转移酶1	-	HPRD,BioGRID	11850402
PTBP1	HNRNP-I\|HNRNPI \| HNRPI \| MGC10830 \| MGC8461 \| PTB \| PTB-1 \| PTB-T \| PTB2 \| PTB3 \| PTB4 \| pPTB	息肉嘧啶道结合蛋白1	-	HPRD	12581738
PTBP2	FLJ34897 \|PTB \|ptblp \|brptb \|NPTB \|NPTB5 \|NPTB6 \|NPTB7 \|NPTB8	息肉嘧啶道结合蛋白2	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12581738
RELA	MGC131774 \|NFKB3 \|P65	V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A（Avian）	-	HPRD,BioGRID	11278855
RXRA	FLJ00280 \| FLJ00318 \| FLJ16020 \| FLJ16733 \| MGC102720 \| NR2B1	类维生素X受体，α	-	HPRD,BioGRID	9440806
SF1	D11S636 \| ZFM1 \| ZNF162	剪接因子1	-	HPRD,BioGRID	9660765
SFRS2	PR264 \|SC-35 \|SC35 \|SFRS2A \|SRP30B	splicing factor, arginine/serine-rich 2	-	HPRD	9774382
SPI1	OF \| PU.1 \| SFPI1 \| SPI-1 \| SPI-A	脾脏焦点形成病毒（SFFV）前病毒整合Oncogene SPI1	-	HPRD,BioGRID	9478924
SRM1	160-KD \| MGC39488 \| POP101 \| SRM160	serine/arginine repetitive matrix 1	-	HPRD,BioGRID	12581738
THRA	AR7 \|Ear7 \|ERB-T-1 \|Erba \|erba1 \|MGC000261 \|MGC43240 \|NR1A1 \|thra1 \|thra2 \| c-ERBA-1	thyroid hormone receptor, alpha (erythroblastic leukemia viral (v-erb-a) oncogene homolog, avian)	-	HPRD,BioGRID	9440806
USF2	FIP \|BHLHB12	上游转录因子2，C-FOS相互作用	Affinity Capture-MS	Biogrid	17353931
YBX1	BP-8 \|CSDA2 \|CSDB \|DBPB \|MDR-NF1 \|MGC104858 \|MGC110976 \|MGC117250 \|NSEP-1 \|NSEP1 \| YB-1 \| YB1	Y盒结合蛋白1	-	HPRD,BioGRID	12168660

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理	140	77	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome mRNA处理	161	86	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome mRNA剪接	111	58	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN	463	290	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gary CD5目标	473	314	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOOI ST7 TARGETS DN	123	78	All SZGR 2.0 genes in this pathway
THUM SYSTOLIC HEART FAILURE UP	423	283	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN	663	425	All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与基础	380	215	All SZGR 2.0 genes in this pathway
OSMAN BLADDER CANCER UP	404	246	All SZGR 2.0 genes in this pathway
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞	233	161	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Odonnell TFRC靶向DN	139	76	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MYC和TFRC DN的ODONNELL目标	45	25	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向	457	269	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SENESE HDAC3 TARGETS UP	501	327	All SZGR 2.0 genes in this pathway
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 24HR UP	557	331	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION UP	1278	748	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Elvidge缺氧DN	146	94	All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN	1375	806	All SZGR 2.0 genes in this pathway
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED UP	633	376	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE UP	530	342	All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN	137	97	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mohankumar TLX1靶向	414	287	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652	1023	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络	1442	892	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔卡拉凋亡	88	60	All SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌吸烟者	80	52	All SZGR 2.0 genes in this pathway
狮子转移	539	324	All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤分化中等程度与不良	121	71	All SZGR 2.0 genes in this pathway
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤	165	104	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BENPORATH NANOG TARGETS	988	594	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Oct4目标	290	172	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath SOX2目标	734	436	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath NOS目标	179	105	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MANALO HYPOXIA DN	289	166	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS	882	572	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PENG GLUTAMINE DEPRIVATION DN	337	230	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Affar YY1靶向DN	234	137	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARIADASON RESPONSE TO CURCUMIN SULINDAC 5	23	17	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应	911	527	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应	1011	592	All SZGR 2.0 genes in this pathway
TOYOTA TARGETS OF MIR34B AND MIR34C	463	262	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MATZUK精子细胞	72	55	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mueller Plurinet	299	189	All SZGR 2.0 genes in this pathway
格雷希克癌症复制号码	323	240	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C D UP	139	95	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因	389	245	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI假足趋化性DN	457	302	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Liu Vav3前列腺致癌作用	89	61	All SZGR 2.0 genes in this pathway
fontaine乳头状甲状腺癌	66	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHANDRAN METASTASIS UP	221	135	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KYNG RESPONSE TO H2O2 VIA ERCC6 DN	46	31	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PILON KLF1 TARGETS DN	1972	1213	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标1 DN	63	39	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KATSANOU ELAVL1 TARGETS DN	148	88	All SZGR 2.0 genes in this pathway
IRS1和IRS2的GUO目标	98	67	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	Target position			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
miR-141/200a	46	53	1A，M8	HSA-MIR-141	uaacacugucugugugugugaugg
miR-141/200a	46	53	1A，M8	hsa-miR-200a	UAACACUGUCUGGUAACGAUGU

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

Gene Page:FUS