基因页:fut1
概括?
基因 | 2523 |
象征 | fut1 |
同义词 | H | HH | HSC |
描述 | 岩藻糖基转移酶1(H血组) |
参考 | MIM:211100|HGNC:HGNC:4012|ENSEMBL:ENSG00000174951|HPRD:07186|Vega:Otthumg00000183325 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.3 |
Pascal P值 | 5.172E-4 |
Sherlock P值 | 0.095 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9564096 | CHR13 | 64288758 | fut1 | 2523 | 0.08 | 反式 | ||
RS9571014 | CHR13 | 64303535 | fut1 | 2523 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FUT1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF574 | 0.93 | 0.93 |
USP19 | 0.92 | 0.93 |
var | 0.92 | 0.93 |
traf7 | 0.92 | 0.90 |
TKT | 0.92 | 0.92 |
xab2 | 0.91 | 0.93 |
Rab11b | 0.91 | 0.92 |
DGCR14 | 0.91 | 0.91 |
GGA1 | 0.91 | 0.92 |
ARMC6 | 0.91 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.76 | -0.86 |
MT-CO2 | -0.74 | -0.86 |
AF347015.27 | -0.73 | -0.85 |
mt-cyb | -0.72 | -0.83 |
AF347015.21 | -0.71 | -0.90 |
AF347015.33 | -0.71 | -0.81 |
AF347015.8 | -0.71 | -0.84 |
C5orf53 | -0.68 | -0.71 |
AF347015.15 | -0.67 | -0.81 |
ifi27 | -0.67 | -0.77 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG糖果果脂生物合成乳酸和新乳糖系列 | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg糖果果脂生物合成球序列 | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王食道癌与正常DN | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林被肿瘤微环境沉默 | 108 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shipp DLBCL治愈与致命 | 39 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI葡萄糖剥夺 | 60 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 | 74 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |