概括
基因 2523
象征 fut1
同义词 H | HH | HSC
描述 岩藻糖基转移酶1(H血组)
参考 MIM:211100|HGNC:HGNC:4012|ENSEMBL:ENSG00000174951|HPRD:07186|Vega:Otthumg00000183325
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.3
Pascal P值 5.172E-4
Sherlock P值 0.095
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9564096 CHR13 64288758 fut1 2523 0.08 反式
RS9571014 CHR13 64303535 fut1 2523 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF574 0.93 0.93
USP19 0.92 0.93
var 0.92 0.93
traf7 0.92 0.90
TKT 0.92 0.92
xab2 0.91 0.93
Rab11b 0.91 0.92
DGCR14 0.91 0.91
GGA1 0.91 0.92
ARMC6 0.91 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.76 -0.86
MT-CO2 -0.74 -0.86
AF347015.27 -0.73 -0.85
mt-cyb -0.72 -0.83
AF347015.21 -0.71 -0.90
AF347015.33 -0.71 -0.81
AF347015.8 -0.71 -0.84
C5orf53 -0.68 -0.71
AF347015.15 -0.67 -0.81
ifi27 -0.67 -0.77

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KeGG糖果果脂生物合成乳酸和新乳糖系列 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg糖果果脂生物合成球序列 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常DN 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林被肿瘤微环境沉默 108 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shipp DLBCL治愈与致命 39 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI葡萄糖剥夺 60 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因