概括
基因 2530
象征 fut8
同义词 -
描述 岩藻糖基转移酶8(α(1,6)岩藻糖基转移酶)
参考 MIM:602589|HGNC:HGNC:4019|Ensembl:ENSG0000000033170|HPRD:03994|Vega:Otthumg00000142818
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q24.3
Pascal P值 0.381
Sherlock P值 0.623
胎儿β -0.207
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08074084 14 65880369 fut8 7.4e-9 -0.01 3.67E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2729048 CHR3 602688 fut8 2530 0.19 反式
RS6530123 Chrx 7951068 fut8 2530 0.09 反式
RS874294 Chrx 7957468 fut8 2530 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016757 转移酶活性,转移糖基团 IEA -
去:0008424 糖蛋白6-α-L-L-核糖基转移酶活性 塔斯 11698403
GO:0017124 SH3域结合 IEA -
GO:0046921 α(1,6) - 葡萄糖基转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0043112 受体代谢过程 IEA 神经递质(GO期限:4) -
去:0001701 在子宫胚胎开发中 nas 11698403
去:0006491 N-聚糖处理 塔斯 11698403
去:0007229 整联蛋白介导的信号通路 IEA -
去:0007179 转化生长因子β受体信号通路 IEA -
去:0007585 呼吸气态交换 IEA -
去:0009312 寡糖生物合成过程 塔斯 9133635
GO:0042355 L-核分解代谢过程 nas 11698403
GO:0016477 细胞迁移 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 nas 11698403
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg n glycan生物合成 46 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG糖胺聚糖生物合成硫酸盐 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome运输到高尔基体和随后的修改 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome N Golgi内侧Golgi中的Glycan触角伸长 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘sox4靶向 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与小叶正常 73 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不良DN 60 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 UP 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化克拉斯 126 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
受甲基化DN调节的Missiaglia 122 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI mir34a目标 148 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haslinger B Cll,带有11q23删除 23 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞发育DN 129 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wagner Apo2敏感性 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李最近的胸腺移民 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wendt粘蛋白靶向 33 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1 DN 45 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转换签名 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1的Juban目标 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang Gata2靶向 149 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-122 460 466 1a HSA-MIR-122A uggagugugacaaugguuuugu
mir-34/449 296 303 1A,M8 HSA-MIR-34A uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-342 335 342 1A,M8 HSA-MIR-342 ucucacacagaaaucgcacccccguc
mir-377 334 340 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-494 683 689 M8 HSA-MIR-494 ugaaacauacgggaaaccucuu