概括
基因 2532
象征 ACKR1
同义词 ccbp1 | cd234 | darc | dfy | fy | gpd | gpfy | wbcq1
描述 非典型趋化因子受体1(达菲血型)
参考 MIM:613665|HGNC:HGNC:4035|Ensembl:ENSG00000213088|HPRD:00192|Vega:Otthumg0000000037182
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21-Q22

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17389107 CHR2 18498020 达克 2532 0.02 反式
RS711251 CHR2 36706420 达克 2532 0.15 反式
RS16829545 CHR2 151977407 达克 2532 2.484e-6 反式
RS16841750 CHR2 158288461 达克 2532 0.01 反式
RS7584986 CHR2 184111432 达克 2532 0.02 反式
RS16955618 CHR15 29937543 达克 2532 1.303e-11 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C19orf6 0.85 0.86
SYVN1 0.85 0.86
ZNF335 0.85 0.83
ATG2A 0.85 0.86
SMG5 0.85 0.84
FAM160B2 0.84 0.85
clcn7 0.84 0.84
KRBA1 0.84 0.84
机舱1 0.83 0.84
鸽子 0.83 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.64 -0.65
GNG11 -0.59 -0.61
AF347015.31 -0.58 -0.56
C1orf54 -0.57 -0.60
MT-CO2 -0.57 -0.56
Sycp3 -0.56 -0.58
AL050337.1 -0.54 -0.58
AF347015.27 -0.53 -0.52
AF347015.8 -0.53 -0.52
clec2b -0.52 -0.60

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0004950 趋化因子受体活性 nas -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0006954 炎症反应 IEA -
去:0006952 国防反应 nas 10570183
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 塔斯 7689250