基因页:ACKR1
概括?
基因 | 2532 |
象征 | ACKR1 |
同义词 | ccbp1 | cd234 | darc | dfy | fy | gpd | gpfy | wbcq1 |
描述 | 非典型趋化因子受体1(达菲血型) |
参考 | MIM:613665|HGNC:HGNC:4035|Ensembl:ENSG00000213088|HPRD:00192|Vega:Otthumg0000000037182 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q21-Q22 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17389107 | CHR2 | 18498020 | 达克 | 2532 | 0.02 | 反式 | ||
RS711251 | CHR2 | 36706420 | 达克 | 2532 | 0.15 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | 达克 | 2532 | 2.484e-6 | 反式 | ||
RS16841750 | CHR2 | 158288461 | 达克 | 2532 | 0.01 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | 达克 | 2532 | 0.02 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | 达克 | 2532 | 1.303e-11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ACKR1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C19orf6 | 0.85 | 0.86 |
SYVN1 | 0.85 | 0.86 |
ZNF335 | 0.85 | 0.83 |
ATG2A | 0.85 | 0.86 |
SMG5 | 0.85 | 0.84 |
FAM160B2 | 0.84 | 0.85 |
clcn7 | 0.84 | 0.84 |
KRBA1 | 0.84 | 0.84 |
机舱1 | 0.83 | 0.84 |
鸽子 | 0.83 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.64 | -0.65 |
GNG11 | -0.59 | -0.61 |
AF347015.31 | -0.58 | -0.56 |
C1orf54 | -0.57 | -0.60 |
MT-CO2 | -0.57 | -0.56 |
Sycp3 | -0.56 | -0.58 |
AL050337.1 | -0.54 | -0.58 |
AF347015.27 | -0.53 | -0.52 |
AF347015.8 | -0.53 | -0.52 |
clec2b | -0.52 | -0.60 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0004950 | 趋化因子受体活性 | nas | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007186 | G蛋白偶联受体蛋白信号通路 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0006954 | 炎症反应 | IEA | - | |
去:0006952 | 国防反应 | nas | 10570183 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 7689250 |