基因页：FYN
概括?
| 基因ID | 2534 |
| 象征 | FYN |
| 同义词 | 背景下| SYN | p59-FYN |
| 描述 | FYN原始癌基因，SRC家族酪氨酸激酶 |
| 参考 | MIM：137025|HGNC：HGNC：4037|Ensembl：ENSG00000010810|HPRD：00655|Vega：Otthumg0000000016305 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 地图位置 | 6Q21 |
| Pascal P值 | 0.009 |
| Sherlock P值 | 0.861 |
| Fetal beta | 1.145 |
| DMG | 1（＃研究） |
| eGene | 伏隔核基底神经节 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | Genome-wide DNA methylation analysis | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
| PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | P价值：1.398 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizophrenias | 点击to show details |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：1.777 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | beta（dis） | FDR (dis) | Study |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg20985014 | 6 | 112374151 | FYN | 0.003 | -5.708 | DMG：Vaneijk_2014 |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NDRG4 | 0.86 | 0.89 |
| TTC7B | 0.85 | 0.86 |
| CLPTM1 | 0.85 | 0.83 |
| PLBD2 | 0.84 | 0.81 |
| AP001107.1 | 0.83 | 0.86 |
| clstn3 | 0.83 | 0.83 |
| DCTN1 | 0.82 | 0.81 |
| PINK1 | 0.82 | 0.86 |
| C2CD2L | 0.82 | 0.85 |
| ADAMTSL2 | 0.82 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RBMX2 | -0.48 | -0.55 |
| FAM159B | -0.48 | -0.66 |
| Bcl7c | -0.46 | -0.57 |
| C21orf57 | -0.44 | -0.53 |
| RPL31 | -0.44 | -0.50 |
| RPL35 | -0.44 | -0.51 |
| RPS20 | -0.43 | -0.55 |
| C9orf46 | -0.43 | -0.50 |
| RPL24 | -0.43 | -0.50 |
| RPL13AP22 | -0.43 | -0.61 |
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| GO:0005515 | protein binding | IEA | - | |
| GO:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0004713 | protein tyrosine kinase activity | IEA | - | |
| 去：0004715 | 非膜跨度蛋白酪氨酸激酶活性 | nas | 7822789 | |
| GO：0016740 | transferase activity | IEA | - | |
| GO：0042802 | 相同的蛋白质结合 | IPI | 14993658 | |
| GO：0030145 | manganese ion binding | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| Biological process | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
| GO:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | nas | 7822789 | |
| 去：0007243 | 蛋白激酶级联反应 | 塔斯 | 1361685 | |
| 去：0007631 | feeding behavior | 塔斯 | 8264796 | |
| 去：0007612 | 学习 | 塔斯 | 1361685 | |
| GO:0006816 | calcium ion transport | nas | 7822789 | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| GO：0050852 | T细胞受体信号通路 | 艾达 | 7722293 | |
| GO：0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | 经验 | 10858437 | |
| GO:0005768 | 内体 | 艾达 | 15611048 | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 15611048 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ADAM15 | MDC15 | 亚当金属肽酶结构域15 | - | HPRD，Biogrid | 11741929 |
| add2 | addb | adducin 2 (beta) | - | HPRD，Biogrid | 11526103 |
| BCAR1 | cas |CAS1 | CASS1 | CRKAS | P130Cas | 乳腺癌抗雌激素抵抗1 | - | HPRD，Biogrid | 9188452 |
| Bcl3 | bcl4 |D19S37 | B细胞CLL/淋巴瘤3 | - | HPRD，Biogrid | 9576921 |
| btk | AGMX1 | AT | ATK | BPK | IMD1 | MGC126261 | MGC126262 | PSCTK1 | XLA | 布鲁顿阿氨基葡萄糖酸酪氨酸激酶 | Reconstituted Complex | BioGRID | 8058772 |
| CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence | - | HPRD，Biogrid | 9535867 |
| CBLC | CBL-3 |CBL-SL |RNF57 | CAS-BR-M（鼠）生态逆转录病毒转化序列C | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 10571044 |
| CD19 | B4 |MGC12802 | CD19分子 | - | HPRD | 7589101 |
| CD2 | SRBC |T11 | CD2分子 | - | HPRD，Biogrid | 9677430 |
| CD226 | DNAM-1 |DNAM1 |pta1 |tlisa1 | CD226molecule | - | HPRD，Biogrid | 10591186 |
| CD2AP | CMS |DKFZP586H0519 | 与CD2相关的蛋白质 | - | HPRD | 10339567 |
| CD36 | CHDS7 |脂肪|gp3b |GP4 |GPIV |帕西夫|Scarb3 | CD36分子（血小板传播受体） | - | HPRD，Biogrid | 7521304 |
| CD44 | CDW44 |CSPG8 |ECMR-III |hcell |在|lhr |MC56 |mdu2 |mdu3 |MGC10468 | MIC4 | MUTCH-I | Pgp1 | CD44molecule (Indian blood group) | - | HPRD，Biogrid | 9573028 |
| CD48 | BCM1 |爆炸|Blast1 |mem-102 |slamf2 |HCD48 |MCD48 | CD48分子 | - | HPRD | 8104794 |
| CD55 | Cr |克罗姆|DAF |TC | CD55分子，补体的衰减加速因子（Cromer血型） | - | HPRD | 1385527 |
| CDC2 | CDC28A | CDK1 | DKFZp686L20222 | MGC111195 | 细胞分裂周期2，G1至S和G2至M | - | HPRD，Biogrid | 8910336 |
| CDH1 | 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO | 钙粘蛋白1，1型，e-钙粘蛋白（上皮） | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 12640114 |
| chrna7 | chrna7-2 | NACHRA7 | 胆碱能受体，烟碱，α7 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11278378 |
| CNTN1 | F3 |GP135 | 联系人1 | - | HPRD，Biogrid | 7595520 |
| CSF1R | C-FMS |CD115 |CSFR |fim2 |FMS | 菌落刺激因子1受体 | - | HPRD，Biogrid | 7681396 |
| CSK | MGC117393 | C-SRC酪氨酸激酶 | - | HPRD，Biogrid | 8262983 |
| CTLA4 | CD152 | CELIAC3 | CTLA-4 | GSE | IDDM12 | 细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4 | - | HPRD，Biogrid | 9712716 |
| CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | Catenin（cadherin相关蛋白），β1，88KDA | Biochemical Activity | BioGRID | 12640114 |
| ctnnd1 | cas |ctnnd |KIAA0384 |P120CAS |P120CTN |P120 | Catenin（钙粘蛋白相关蛋白），三角洲1 | Affinity Capture-Western Biochemical Activity |
BioGRID | 12640114|12835311 |
| ctnnd2 | GT24 |nprap | Catenin（钙粘蛋白相关蛋白），三角洲2（神经plakophilin相关的手臂重复蛋白） | - | HPRD | 12835311 |
| dag1 | 156DAG |A3A |agrnr |dag | 多糖1（肌营养不良蛋白相关的糖蛋白1） | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 11724572 |
| DCC | CRC18 |CRCR1 | 在结直肠癌中删除 | DCC与FYN相互作用。 | 绑定 | 15494732 |
| DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘，大型同源物4（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 12419528 |
| DOK3 | dokl |FLJ22570 |FLJ39939 | 对接蛋白3 | - | HPRD | 10733577 |
| DOK4 | FLJ10488 | 对接蛋白4 | IRS5/DOK4 interacts with Fyn. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human IRS5/DOK4 and hamster Fyn. | 绑定 | 12730241 |
| DOK4 | FLJ10488 | 对接蛋白4 | - | HPRD | 12730241 |
| Epha4 | hek8 |sek |Tyro1 | EPH受体A4 | - | HPRD，Biogrid | 12084815 |
| Epha8 | EEK |hek3 |KIAA1459 | EPH受体A8 | - | HPRD，Biogrid | 10498895 |
| EPHB3 | ETK2 | HEK2 | TYRO6 | EPH受体B3 | - | HPRD，Biogrid | 9674711 |
| EVL | RNB6 | Enah/Vasp-like | - | HPRD | 10945997 |
| fas | Alps1a |apo-1 |apt1 |CD95 |fas1 |FastM |TNFRSF6 | FAS（TNF受体超家族，成员6） | - | HPRD，Biogrid | 8626376 |
| fasLG | APT1LG1 | CD178 | CD95L | FASL | TNFSF6 | Fas ligand (TNF superfamily, member 6) | - | HPRD，Biogrid | 7589480 |
| FNBP4 | DKFZp686M14102 | DKFZp779I1064 | FBP30 | FLJ41904 | KIAA1014 | formin结合蛋白4 | - | HPRD，Biogrid | 10744724 |
| FYB | ADAP | PRO0823 | SLAP-130 | FYN结合蛋白（FYB-120/130） | - | HPRD | 7504057|9207119 |
| FYB | ADAP | PRO0823 | SLAP-130 | FYN结合蛋白（FYB-120/130） | - | HPRD，Biogrid | 7504057 |
| FYN | MGC45350 |SLK |syn | Fyn Oncogene与SRC，FGR，是的 | - | HPRD，Biogrid | 7687536 |
| GAB3 | - | GRB2相关的结合蛋白3 | - | HPRD，Biogrid | 11739737 |
| GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1 | - | HPRD，Biogrid | 11943848|12524444 |
| GP6 | GPIV |GPVI |MGC138168 | 糖蛋白VI（血小板） | - | HPRD，Biogrid | 11943772 |
| GRB10 | grb-ir |GRB-10 |IRBP |KIAA0207 |MEG1 |RSS | 生长因子受体结合蛋白10 | - | HPRD，Biogrid | 10871840 |
| GRIN2A | NMDAR2A | NR2A | 谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸2A | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 9892651|10458595 |12419528|12932824 |
| GRIN2A | NMDAR2A | NR2A | 谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸2A | - | HPRD | 10458595|12932824 |
| GRIN2B | MGC142178 |MGC142180 |NMDAR2B |NR2B |HNR3 | 谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸2B | - | HPRD，Biogrid | 10458595 |
| hnrnpk | CSBP |FLJ41122 |hnrpk |隧道 | 异质核核糖核蛋白K | Fyn与HNRNPK相互作用。这种相互作用是在未指定源和人类HNRNPK的FYN之间进行的相互作用建模的。 | 绑定 | 8810341 |
| IL7R | CD127 |CDW127 |IL-7R-Alpha |IL7RA |伊拉 | 白介素7受体 | - | HPRD，Biogrid | 7515933 |
| itk | EMT |lyk |MGC126257 |MGC126258 |PSCTK2 | IL2诱导的T细胞激酶 | - | HPRD，Biogrid | 8810341 |
| JAK2 | JTK10 | Janus激酶2（蛋白酪氨酸激酶） | - | HPRD，Biogrid | 10551884 |
| KHDRBS1 | FLJ34027 |SAM68 |p62 | KH结构域含有RNA结合，信号转导相关1 | - | HPRD，Biogrid | 9045636 |
| MAG | GMA |s-mag |SIGLEC-4A |siglec4a | 髓鞘相关的糖蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 7525550 |
| MAP2 | DKFZP686I2148 |map2a |MAP2B |MAP2C | 微管相关蛋白2 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11546790 |
| mapt | ddpac |FLJ31424 |FTDP-17 |maptl |MGC138549 |MSTD |mtbt1 |mtbt2 |ppnd |tau | microtubule-associated protein tau | - | HPRD，Biogrid | 11826099 |
| MCAM | CD146 |MUC18 | melanoma cell adhesion molecule | - | HPRD，Biogrid | 9756930 |
| MS4A1 | B1 | Bp35 | CD20 | LEU-16 | MGC3969 | MS4A2 | S7 | 跨膜四域，亚家族A，成员1 | - | HPRD，Biogrid | 7545683 |
| NCAM1 | CD56 |MSK39 |NCAM | 神经细胞粘附分子1 | - | HPRD | 9079653|11839780 |
| nedd9 | CAS-L | CAS2 | CASL | CASS2 | HEF1 | dJ49G10.2 | dJ761I2.1 | 神经前体细胞表达，发育下调9 | - | HPRD，Biogrid | 9360983 |
| NMT1 | NMT | N- myristoyltransferase 1 | Biochemical Activity | BioGRID | 11594778 |
| NPHS1 | CNF |nphn | 肾脏病1，先天性，芬兰类型（肾素） | - | HPRD，Biogrid | 12668668|12846735 |
| NTRK2 | gp145-trkb |trkb | 神经营养性酪氨酸激酶，受体，2型 | - | HPRD，Biogrid | 9648856 |
| PAG1 | CBP | FLJ37858 | MGC138364 | PAG | 与糖磷脂微域1相关的磷蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 10790433 |
| pde4d | dpde3 |HSPDE4D |PDE4DN2 |strk1 | 磷酸二酯酶4D，营地特异性（磷酸二酯酶E3 Dunce同源物，果蝇） | PDE4D4与FYN SH3域相互作用。 | 绑定 | 10571082 |
| PDGFRB | CD140B |JTK12 |PDGF-R-BETA |PDGFR |PDGFR1 | 血小板衍生的生长因子受体，β多肽 | - | HPRD | 1696179 |
| PECAM1 | CD31 |PECAM-1 | 血小板/内皮细胞粘附分子 | - | HPRD，Biogrid | 10858437 |
| PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 1 (alpha) | - | HPRD | 8394019 |
| PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 1 (alpha) | Reconstituted Complex | BioGRID | 8294442 |
| PIK3R2 | P85B | p85 | p85-BETA | phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 2 (beta) | - | HPRD，Biogrid | 1334406 |
| plaur | CD87 |UPAR |urkr | 纤溶酶原激活剂，尿激酶受体 | - | HPRD | 9417082 |
| PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | 磷脂酶C，伽马1 | - | HPRD | 10586033 |
| PLCG2 | - | 磷脂酶C，伽马2（磷脂酰肌醇特异性） | - | HPRD，Biogrid | 8395016 |
| PLD2 | - | phospholipase D2 | - | HPRD | 12697812 |
| prkcq | MGC126514 | MGC141919 | PRKCT | nPKC-theta | protein kinase C, theta | - | HPRD，Biogrid | 10383400 |
| PTK2 | Fadk |fak |fak1 |pp125fak | PTK2蛋白酪氨酸激酶2 | - | HPRD，Biogrid | 11278857 |
| ptk2b | Cadtk |cakb |fadk2 |fak2 |frnk |PKB |PTK |pyk2 |筏 | PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β | - | HPRD，Biogrid | 9091579|9104812 |10867021 |
| PTPN11 | bptp3 |CFC |MGC14433 |NS1 |PTP-1D |PTP2C |SH-PTP2 |sh-ptp3 |SHP2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体11型 | - | HPRD，Biogrid | 10212213 |
| PTPN5 | FLJ14427 |ptpstep |步 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体5型（富含纹状体） | - | HPRD，Biogrid | 11983687 |
| PTPRA | HEPTP |HLPR |hptpa |hptpalpha |LRP |PTPA |ptprl2 |R-PTP-Alpha |RPTPA | protein tyrosine phosphatase, receptor type, A | - | HPRD，Biogrid | 9535845 |
| PTPRC | B220 | CD45 | CD45R | GP180 | LCA | LY5 | T200 | protein tyrosine phosphatase, receptor type, C | - | HPRD | 9368621|12589038 |
| PXN | FLJ16691 | 帕西林 | - | HPRD，Biogrid | 10804218 |
| RAF1 | CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf | V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1 | - | HPRD，Biogrid | 7517401 |
| RICS | GC-GAP |砂砾|KIAA0712 |MGC1892 |P200RHOGAP |P250GAP | Rho GTPase激活蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 12788081|12857875 |
| RPL10 | DKFZP686J1851 |DXS648 |DXS648E |FLJ23544 |FLJ27072 |十一月|QM | 核糖体蛋白L10 | Reconstituted Complex | BioGRID | 12138090 |
| SDC3 | n-syndecan |SDCN |Synd3 | Syndecan 3 | - | HPRD，Biogrid | 9553134 |
| SH2B2 | APS | SH2B适配器蛋白2 | - | HPRD | 10872802 |
| SH2D1A | DSHP | EBVS | FLJ18687 | FLJ92177 | IMD5 | LYP | MTCP1 | SAP | XLP | XLPD | SH2 domain protein 1A | - | HPRD，Biogrid | 12545174 |
| SH3BP2 | 3BP2 | CRBM | CRPM | FLJ42079 | RES4-23 | SH3膜结合蛋白2 | 两个杂交 | BioGRID | 9846481 |
| SIT1 | MGC125908 | MGC125909 | MGC125910 | RP11-331F9.5 | SIT | 信号传导阈值调节跨膜适配器1 | - | HPRD，Biogrid | 10209036 |
| SKAP1 | SCAP1 | SKAP55 | SRC激酶相关的磷蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 9195899 |
| SKAP2 | MGC10411 |MGC33304 |prap |RA70 |SAPS |scap2 |skap-hom |SKAP55R | SRC激酶相关的磷蛋白2 | - | HPRD，Biogrid | 9837776 |
| Slamf1 | CD150 |CDW150 |大满贯 | signaling lymphocytic activation molecule family member 1 | Reconstituted Complex | BioGRID | 12545174 |
| SNCA | MGC110988 |NACP |park1 |park4 |PD1 | 突触核蛋白，α（淀粉样蛋白前体的非A4成分） | - | HPRD，Biogrid | 11162638 |
| SOCS1 | 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 | 抑制细胞因子信号传导1 | SOCS1与Fyn相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的小鼠SOCS1和FYN之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 10022833 |
| SOCS1 | 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 | 抑制细胞因子信号传导1 | - | HPRD，Biogrid | 10022833 |
| SOS1 | GF1 | GGF1 | GINGF | HGF | NS4 | 七个无同胞1的儿子（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 9856337 |
| SPN | CD43 | GPL115 | LSN | 唾液磷脂 | - | HPRD | 9603925 |
| SRC | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian) | 蛋白质肽 | BioGRID | 9169421 |
| Syk | dkfzp313n1010 |FLJ25043 |FLJ37489 | spleen tyrosine kinase | - | HPRD，Biogrid | 9535867 |
| THY1 | CD90 |FLJ33325 | THY-1细胞表面抗原 | - | HPRD，Biogrid | 1351058 |
| TNK2 | Ack |ack1 |FLJ44758 |FLJ45547 |P21CDC42HS | 酪氨酸激酶，非受体，2 | - | HPRD，Biogrid | 11087735 |
| tom1l1 | OK/KNS-CL.3 |Srcasm | MYB1（鸡）的目标 - 类似1 | Reconstituted Complex | BioGRID | 11711534 |
| trat1 | HSPC062 | TCRIM | TRIM | T细胞受体相关的跨膜适配器1 | Reconstituted Complex | BioGRID | 10790433 |
| TRPC6 | FLJ11098 |FLJ14863 |FSGS2 |TRP6 | 瞬态受体电位阳离子通道，亚家族C，成员6 | - | HPRD，Biogrid | 14761972 |
| TRPV4 | OTRPC4 |TRP12 |VR-OAC |VRL-2 |VRL2 |Vroac | 瞬态受体电势阳离子通道，亚家族V，成员4 | - | HPRD，Biogrid | 12538589 |
| TUBA1B | K-ALPHA-1 | 微管蛋白，α1B | - | HPRD | 11826099 |
| TUBA3C | tuba2 |BA408E5.3 | 微管蛋白，α3C | - | HPRD，Biogrid | 8566014|11826099 |
| TUBA4A | FLJ30169 | H2-ALPHA | TUBA1 | 微管蛋白，α4A | - | HPRD | 8566014 |
| tyk2 | JTK1 | tyrosine kinase 2 | - | HPRD，Biogrid | 9196040 |
| Tyro3 | byk |BRT |DTK |FLJ16467 |RSE |天空|tif | TYRO3蛋白酪氨酸激酶 | - | HPRD | 7537495 |
| UNC119 | HRG4 | UNC-119同源物（秀丽隐杆线虫） | - | HPRD，Biogrid | 14757743 |
| vav1 | VAV | vav 1 guanine nucleotide exchange factor | - | HPRD，Biogrid | 9822663 |
| 曾是 | IMD2 |THC |黄蜂 | Wiskott-Aldrich综合征（湿疹 - 肉毒细胞减少症） | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 8805332|10532312 |
| 曾是 | IMD2 |THC |黄蜂 | Wiskott-Aldrich综合征（湿疹 - 肉毒细胞减少症） | - | HPRD | 8805332|10224664 |10532312 |
| WASF1 | FLJ31482 |KIAA0269 |Scar1 |波|Wave1 | 是蛋白质家族，成员1 | - | HPRD | 10532312 |
| WASF2 | scar2 |Wave2 |DJ393P12.2 | 是蛋白质家族，成员2 | - | HPRD | 10532312 |
| 是的1 | HsT441 | P61-YES | Yes | c-yes | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒癌基因同源1 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 12640114 |
| ythdc1 | KIAA1966 |YT521 |YT521-B | YTH domain containing 1 | - | HPRD，Biogrid | 15175272 |
| ZAP70 | FLJ17670 |FLJ17679 |SRK |std |tzk |ZAP-70 | Zeta链（TCR）相关蛋白激酶70KDA | - | HPRD，Biogrid | 7760813 |
V.途径注释
| 路径名 | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG轴突指导 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG FOCAL ADHESION | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg粘附交界处 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 | 137 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg t细胞受体信号通路 | 108 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG FC EPSILON RI SIGNALING PATHWAY | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg Prion疾病 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG致病性大肠杆菌感染 | 59 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG病毒心肌炎 | 73 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA BIOPEPTIDES PATHWAY | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Epha4途径 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA ECM PATHWAY | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta IL7途径 | 17 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta整联蛋白途径 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA TCRA PATHWAY | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta TCR途径 | 49 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST INTEGRIN SIGNALING PATHWAY | 82 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID FCER1途径 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ERBB4途径 | 38 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Glypican 1 Pathway | 27 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TCR途径 | 66 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PTP1B途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid reelin途径 | 29 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID p38 alpha beta途径 | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CD8 TCR PATHWAY | 53 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ANGIOPOIETIN RECEPTOR PATHWAY | 50 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TXA2 Pathway | 57 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Netrin途径 | 32 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL2 1 Pathway | 55 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CXCR4途径 | 102 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PI3KCI途径 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID AJDISS 2PATHWAY | 48 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID AMB2中性粒细胞途径 | 41 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Epha FWDPathway | 34 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ecadherin角质形成细胞途径 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PDGFRB途径 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID肾素Neph1途径 | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID VEGFR1 2途径 | 69 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID SYNDECAN 3 PATHWAY | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ephrinb Rev Pathway | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PIDα突触核蛋白途径 | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID FAK PATHWAY | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SIGNALING BY SCF KIT | 78 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞通信 | 120 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 套件信号的反应组调节 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2的Reactome信号传导 | 101 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME ANTIGEN ACTIVATES B CELL RECEPTOR LEADING TO GENERATION OF SECOND MESSENGERS | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL | 91 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组血小板粘附于暴露的胶原蛋白 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome PECAM1相互作用 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME GPVI MEDIATED ACTIVATION CASCADE | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome NCAM信号传导，用于神经突的生长 | 64 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome CD28 CO刺激 | 32 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SEMA3A信号中的Reactome CRMP | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome sema3a pak依赖性轴突排斥 | 15 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome CD28依赖VAV1途径 | 11 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Smaphorin相互作用 | 68 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Sema3a丛集蛋白排斥信号通过抑制整联蛋白粘附 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME COSTIMULATION BY THE CD28 FAMILY | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome CD28依赖性PI3K AKT信号传导 | 22 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome CTLA4抑制信号传导 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ILS的Reactome信号传导 | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Netrin1信号传导 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome DCC介导的有吸引力的信号 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CBL对信号的反应组调节 | 18 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组肾素相互作用 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome IL 3 5和GM CSF信号传导 | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome NEF在HIV1复制和疾病发病机理中的作用 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘vmyb的目标 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODRIGUES DCC TARGETS DN | 121 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bilban B Cll LPL DN | 42 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AKL HTLV1感染DN | 68 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG UP | 130 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Elvidge Hif1a靶向DN | 91 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Elvidge HIF1A和HIF2A靶向DN | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向 | 149 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PROVENZANI METASTASIS UP | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DELYS THYROID CANCER UP | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LINDGREN BLADDER CANCER HIGH RECURRENCE | 49 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LUI甲状腺癌簇1 | 51 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU HGF信令不通过Akt1 48hr向上 | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牛甲基化的乳腺癌 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WU CELL MIGRATION | 184 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 丁肺癌经常突变 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD1 UP | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肥胖症的纳德勒高血糖 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LU AGING BRAIN UP | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWNE HCMV INFECTION 18HR DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bandres对Carmustin没有MGMT 48小时DN的响应 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YIH RESPONSE TO ARSENITE C3 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线响应集群D8 | 40 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTINEZ RESPONSE TO TRABECTEDIN DN | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染12小时DN | 101 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE AMINO ACID DEPRIVATION | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHENG BOUND BY FOXP3 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ACEVEDO METHYLATED IN LIVER CANCER DN | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE DN | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL OPTIMAL DEBULKING | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| podar对Apaphostin的反应 | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu肿瘤血管生成 | 25 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jiang Tip30目标 | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HSIAO HOUSEKEEPING GENES | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VALK AML CLUSTER 11 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G123 DN | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村掺杂早期 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WHITFIELD CELL CYCLE G2 M | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | miRNA seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR start | UTR end | Match method | |||
| mir-27 | 186 | 192 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||
| miR-369-3p | 387 | 393 | M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
| miR-96 | 295 | 301 | M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |