基因页面:ZDHHC20
总结吗?
GeneID | 253832年 |
象征 | ZDHHC20 |
同义词 | 4933421 l13rik | DHHC-20 |
描述 | 锌指DHHC-type包含20 |
参考 | HGNC: HGNC: 20749|运用:ENSG00000180776|HPRD: 08078| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 13 q12.11 |
帕斯卡假定值 | 2.645的军医 |
胎儿β | 1.268 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg22111723 | 13 | 21872664 | ZDHHC20 | 1.26 e-8 | -0.009 | 5.11 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs9552360 | chr13 | 21689937 | ZDHHC20 | 253832年 | 0.19 | 独联体 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZDHHC20_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008415 | 酰基转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
DN HORIUCHI WTAP目标 | 310年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺未分化癌 | 722年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAUSSMANN MLL AF4融合目标 | 191年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANTVEER乳腺癌转移DN | 121年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
道格拉斯BMI1目标了 | 566年 | 371年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
郑受FOXP3 | 491年 | 310年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANOEVELEN肌发生SIN3A目标 | 220年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 124.1 | 154年 | 161年 | 1、m8 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
miR-124/506 | 154年 | 160年 | 1 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir - 224 | 205年 | 212年 | 1、m8 | hsa - mir - 224 | CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA |