基因页：gabbr1
概括？
| 基因 | 2550 |
| 象征 | gabbr1 |
| 同义词 | gababr1 | gabbr1-3 | gb1 | gprc3a |
| 描述 | B型氨基丁酸B受体亚基1 |
| 参考 | MIM：603540|HGNC：HGNC：4070|Ensembl：ENSG00000204681|HPRD：04644|Vega：Otthumg00000031095 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.31 |
| Pascal P值 | 1E-12 |
| Sherlock P值 | 0.351 |
| 胎儿β | -0.847 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | 配体门控离子信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：4 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0246 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG21552290 | 6 | 29578423 | gabbr1 | 8.92e-5 | 0.444 | 0.027 | DMG：Wockner_2014 |
| CG24628013 | 6 | 29580367 | gabbr1 | 2.66E-4 | 0.353 | 0.038 | DMG：Wockner_2014 |
| CG17806418 | 6 | 29599319 | gabbr1 | 5.478E-4 | 0.398 | 0.049 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 准备 | 0.95 | 0.93 |
| NSF | 0.94 | 0.94 |
| ATP6V1B2 | 0.93 | 0.93 |
| synj1 | 0.92 | 0.92 |
| GLS | 0.92 | 0.92 |
| NCOA7 | 0.91 | 0.90 |
| Gabra1 | 0.91 | 0.88 |
| SLC3A1 | 0.90 | 0.92 |
| ATP6V0A1 | 0.90 | 0.94 |
| EFR3A | 0.90 | 0.85 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Bcl7c | -0.44 | -0.51 |
| EFEMP2 | -0.42 | -0.43 |
| Rab13 | -0.41 | -0.50 |
| NME4 | -0.41 | -0.53 |
| Rab34 | -0.40 | -0.45 |
| IRF7 | -0.40 | -0.51 |
| CLEC3B | -0.39 | -0.50 |
| WDR86 | -0.38 | -0.34 |
| AC006276.2 | -0.37 | -0.34 |
| C1orf61 | -0.37 | -0.44 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004965 | GABA-B受体活性 | IEA | GABA，谷氨酸（GO期限：7） | - |
| 去：0004965 | GABA-B受体活性 | 塔斯 | GABA，谷氨酸（GO期限：7） | 9069281 |
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0004930 | G蛋白偶联受体活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007214 | γ-氨基丁酸信号通路 | 塔斯 | GABA，神经递质（GO期限：8） | 9069281 |
| 去：0007186 | G蛋白偶联受体蛋白信号通路 | IEA | - | |
| 去：0006464 | 蛋白质修饰过程 | IEA | - | |
| 去：0007194 | 腺苷酸环化酶活性的阴性调节 | 塔斯 | 9069281 | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9753614 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome C类C 3代谢型谷氨酸信息素受体 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过GBETA伽马亚基对电压门控Ca2通道的反应组抑制 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GABA B受体激活 | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GABA受体激活 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组向内纠正K通道 | 31 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 加兹达钻石黑凡富贫血祖细胞 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FAELT B CLL与VH重新排列 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李小脑老化 | 84 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kyng环境应力响应不是WS中的4NQO | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kyng环境压力反应不是伽玛在旧的 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng环境压力反应不是WS中伽马的 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng环境应力反应DN | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yokoe Cancer testis抗原 | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hinata NFKB靶向成纤维细胞 | 84 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gutierrez Waldenstroems大球蛋白血症1 UP | 9 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng Werner综合征和正常老化DN | 225 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病持续时间corr dn | 146 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 双龙血清敏感基因 | 90 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LE神经元分化 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |