基因页:TMCO4
概括?
基因 | 255104 |
象征 | TMCO4 |
同义词 | - |
描述 | 跨膜和盘绕螺旋域4 |
参考 | HGNC:HGNC:27393|ENSEMBL:ENSG00000162542|HPRD:14140|Vega:Otthumg00000002697 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.13 |
Pascal P值 | 0.601 |
胎儿β | -0.295 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00966591 | 1 | 20126388 | TMCO4 | 3.9e-5 | -0.287 | 0.02 | DMG:Wockner_2014 |
CG15931673 | 1 | 20084760 | TMCO4 | 4.1e-5 | -0.448 | 0.021 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10958910 | Chr9 | 10134759 | TMCO4 | 255104 | 0.15 | 反式 | ||
RS7132043 | CHR12 | 80968399 | TMCO4 | 255104 | 0.17 | 反式 | ||
RS11080561 | CHR18 | 12257229 | TMCO4 | 255104 | 0 | 反式 | ||
RS5950350 | Chrx | 20344855 | TMCO4 | 255104 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
furukawa dusp6靶向pci35 | 74 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定DN | 98 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |