概括
基因 2555
象征 Gabra2
同义词 -
描述 γ-氨基丁酸A型受体α2亚基
参考 MIM:137140|HGNC:HGNC:4076|ENSEMBL:ENSG00000151834|HPRD:11747|Vega:Otthumg0000000044266
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P12
Pascal P值 8.798E-4
Sherlock P值 0.842
胎儿β -1.169
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 配体门控离子信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:7

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17145698 Chrx 40218345 Gabra2 2555 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NRXN3 0.83 0.93
OXCT1 0.83 0.88
park2 0.82 0.87
PRMT8 0.82 0.85
NPTN 0.81 0.84
MAPK13 0.81 0.83
ATP6AP2 0.81 0.84
rasgef1a 0.80 0.85
DRP2 0.80 0.87
zadh2 0.80 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.40 -0.24
AF347015.18 -0.39 -0.26
AF347015.2 -0.35 -0.21
RPL38 -0.34 -0.40
anp32c -0.34 -0.34
EMX2 -0.34 -0.42
FAM159B -0.33 -0.47
MT-CO2 -0.33 -0.24
AL139819.3 -0.33 -0.29
AF347015.26 -0.33 -0.18

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004890 GABA-A受体活性 IEA GABA(GO期限:7) -
去:0008503 苯二氮卓受体活性 小鬼 GABA,神经递质(GO期限:6) 8391122
去:0005254 氯化物通道活性 IEA -
去:0005216 离子通道活动 IEA -
去:0005230 细胞外配体门控离子通道活性 IEA -
GO:0031404 氯离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007214 γ-氨基丁酸信号通路 小鬼 GABA,神经递质(GO期限:8) 8391122
去:0006836 神经递质运输 小鬼 神经元,神经递质(GO期限:5) 8391122
去:0001505 神经递质水平的调节 小鬼 突触,神经递质(GO期限:7) 8391122
去:0006821 氯化物运输 IEA -
去:0006811 离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0030285 突触囊泡膜的积分 艾达 突触(GO期限:14) 8391122
GO:0045211 突触后膜 IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
GO:0045202 突触 IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Gaba途径 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA A受体激活 12 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GABA受体激活 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome离子通道传输 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome配体门控离子通道传输 21 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 24小时DN的响应 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 161 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常衰老 93 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因