基因页：Gabra3
概括？
| 基因 | 2556 |
| 象征 | Gabra3 |
| 同义词 | - |
| 描述 | γ-氨基丁酸A型受体α3亚基 |
| 参考 | MIM：305660|HGNC：HGNC：4077|Ensembl：ENSG00000011677|HPRD：02375|Vega：Otthumg0000000024183 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XQ28 |
| 胎儿β | -0.586 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 配体门控离子信号传导 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6733654 | CHR2 | 1963270 | Gabra3 | 2556 | 0.07 | 反式 | ||
| RS891877 | CHR2 | 2043348 | Gabra3 | 2556 | 0.14 | 反式 | ||
| RS6544404 | CHR2 | 41502544 | Gabra3 | 2556 | 0.08 | 反式 | ||
| RS1155107 | CHR3 | 26843376 | Gabra3 | 2556 | 0.05 | 反式 | ||
| RS1395163 | CHR3 | 31028951 | Gabra3 | 2556 | 0.08 | 反式 | ||
| RS17029291 | CHR3 | 32402138 | Gabra3 | 2556 | 3.403e-11 | 反式 | ||
| RS1553189 | CHR3 | 112939422 | Gabra3 | 2556 | 0.06 | 反式 | ||
| RS624496 | CHR3 | 120506736 | Gabra3 | 2556 | 0.15 | 反式 | ||
| RS16858348 | CHR3 | 173958675 | Gabra3 | 2556 | 0.11 | 反式 | ||
| RS750544 | CHR5 | 51749054 | Gabra3 | 2556 | 0.05 | 反式 | ||
| RS17146240 | CHR5 | 119522933 | Gabra3 | 2556 | 0.05 | 反式 | ||
| RS17146261 | CHR5 | 119534252 | Gabra3 | 2556 | 0.05 | 反式 | ||
| RS2807510 | CHR6 | 73090536 | Gabra3 | 2556 | 0.13 | 反式 | ||
| RS4617108 | CHR7 | 49423831 | Gabra3 | 2556 | 0.04 | 反式 | ||
| RS4607971 | Chr10 | 19407890 | Gabra3 | 2556 | 0.06 | 反式 | ||
| RS11000486 | Chr10 | 74762547 | Gabra3 | 2556 | 0.08 | 反式 | ||
| RS12253630 | Chr10 | 74768923 | Gabra3 | 2556 | 0.04 | 反式 | ||
| RS7078127 | Chr10 | 74847633 | Gabra3 | 2556 | 0.03 | 反式 | ||
| RS3829166 | Chr10 | 74879373 | Gabra3 | 2556 | 0.1 | 反式 | ||
| RS12569493 | Chr10 | 74886042 | Gabra3 | 2556 | 0.01 | 反式 | ||
| RS7072086 | Chr10 | 74886597 | Gabra3 | 2556 | 0.1 | 反式 | ||
| RS16930362 | Chr10 | 74890320 | Gabra3 | 2556 | 7.313E-4 | 反式 | ||
| RS7083730 | Chr10 | 74890448 | Gabra3 | 2556 | 0.13 | 反式 | ||
| RS2271904 | Chr10 | 74894374 | Gabra3 | 2556 | 0.03 | 反式 | ||
| RS7092445 | Chr10 | 74921991 | Gabra3 | 2556 | 0.01 | 反式 | ||
| RS12256576 | Chr10 | 74934313 | Gabra3 | 2556 | 0.03 | 反式 | ||
| RS1867565 | Chr10 | 74977780 | Gabra3 | 2556 | 0.05 | 反式 | ||
| RS11000557 | Chr10 | 74987393 | Gabra3 | 2556 | 0.03 | 反式 | ||
| RS16915029 | Chr10 | 75001994 | Gabra3 | 2556 | 0 | 反式 | ||
| RS14488 | Chr10 | 75007274 | Gabra3 | 2556 | 0.03 | 反式 | ||
| RS16930466 | Chr10 | 75007587 | Gabra3 | 2556 | 0.01 | 反式 | ||
| RS11000579 | Chr10 | 75027961 | Gabra3 | 2556 | 0.05 | 反式 | ||
| RS11000594 | Chr10 | 75064566 | Gabra3 | 2556 | 0.2 | 反式 | ||
| RS11000607 | Chr10 | 75089777 | Gabra3 | 2556 | 0.01 | 反式 | ||
| RS6480700 | Chr10 | 75101689 | Gabra3 | 2556 | 0.02 | 反式 | ||
| RS16930573 | Chr10 | 75167645 | Gabra3 | 2556 | 0.1 | 反式 | ||
| RS12571454 | Chr10 | 75208954 | Gabra3 | 2556 | 0 | 反式 | ||
| RS909288 | Chr10 | 124257417 | Gabra3 | 2556 | 0.17 | 反式 | ||
| RS17136959 | Chr11 | 78373036 | Gabra3 | 2556 | 0.12 | 反式 | ||
| RS4944213 | Chr11 | 78395188 | Gabra3 | 2556 | 0.12 | 反式 | ||
| RS17133022 | Chr11 | 98980829 | Gabra3 | 2556 | 0.03 | 反式 | ||
| RS17034050 | CHR12 | 103914944 | Gabra3 | 2556 | 0.16 | 反式 | ||
| RS2254834 | CHR14 | 43596184 | Gabra3 | 2556 | 0.17 | 反式 | ||
| RS1954396 | CHR14 | 43601835 | Gabra3 | 2556 | 0.01 | 反式 | ||
| RS8055506 | CHR16 | 13661723 | Gabra3 | 2556 | 0.2 | 反式 | ||
| RS16962446 | CHR16 | 13694936 | Gabra3 | 2556 | 0.2 | 反式 | ||
| RS16958358 | CHR17 | 55502410 | Gabra3 | 2556 | 0.02 | 反式 | ||
| RS6040268 | CHR20 | 10956100 | Gabra3 | 2556 | 0.08 | 反式 | ||
| RS6040269 | CHR20 | 10956136 | Gabra3 | 2556 | 0.08 | 反式 | ||
| RS11906936 | CHR20 | 10957136 | Gabra3 | 2556 | 0.04 | 反式 | ||
| RS1327232 | CHR20 | 10958909 | Gabra3 | 2556 | 0.09 | 反式 | ||
| RS6098023 | CHR20 | 53113740 | Gabra3 | 2556 | 0.03 | 反式 | ||
| RS6015314 | CHR20 | 57167224 | Gabra3 | 2556 | 0.14 | 反式 | ||
| RS12157904 | CHR22 | 37982011 | Gabra3 | 2556 | 3.039E-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC32A1 | 0.76 | 0.90 |
| HS6ST2 | 0.68 | 0.80 |
| RCN1 | 0.67 | 0.64 |
| DLX5 | 0.66 | 0.40 |
| TMEM123 | 0.63 | 0.42 |
| GAD1 | 0.63 | 0.85 |
| cdc25b | 0.63 | 0.60 |
| tbl1x | 0.63 | 0.45 |
| DLX1 | 0.63 | 0.39 |
| mobkl2b | 0.63 | 0.44 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| metrnl | -0.32 | -0.42 |
| DAB1 | -0.27 | 0.00 |
| Scube1 | -0.27 | -0.22 |
| Neurod6 | -0.27 | -0.06 |
| RNF182 | -0.27 | -0.28 |
| AF347015.2 | -0.26 | -0.12 |
| klhl1 | -0.26 | 0.07 |
| SLA | -0.26 | 0.06 |
| AF347015.18 | -0.26 | -0.12 |
| TMEM108 | -0.26 | -0.04 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004890 | GABA-A受体活性 | IEA | GABA（GO期限：7） | - |
| 去：0008503 | 苯二氮卓受体活性 | 塔斯 | GABA，神经递质（GO期限：6） | 8391122 |
| 去：0005254 | 氯化物通道活性 | IEA | - | |
| 去：0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
| 去：0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | IEA | - | |
| GO：0031404 | 氯离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007214 | γ-氨基丁酸信号通路 | 塔斯 | GABA，神经递质（GO期限：8） | 8391122 |
| 去：0006821 | 氯化物运输 | IEA | - | |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005856 | 细胞骨架 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 8391122 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Gaba途径 | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GABA A受体激活 | 12 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GABA受体激活 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome离子通道传输 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome配体门控离子通道传输 | 21 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Firestein CTNNB1途径 | 33 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |