基因页:Gabra4
概括?
基因 | 2557 |
象征 | Gabra4 |
同义词 | - |
描述 | γ-氨基丁酸A型受体α4亚基 |
参考 | MIM:137141|HGNC:HGNC:4078|Ensembl:ENSG00000109158|HPRD:08839|Vega:Otthumg0000000099431 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P12 |
Pascal P值 | 0.878 |
胎儿β | -2.586 |
支持 | 配体门控离子信号传导 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GABRA4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004890 | GABA-A受体活性 | IEA | GABA(GO期限:7) | - |
去:0008503 | 苯二氮卓受体活性 | 塔斯 | GABA,神经递质(GO期限:6) | 8719416 |
去:0005254 | 氯化物通道活性 | IEA | - | |
去:0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
去:0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | IEA | - | |
GO:0031404 | 氯离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007214 | γ-氨基丁酸信号通路 | 塔斯 | GABA,神经递质(GO期限:8) | 8719416 |
去:0006821 | 氯化物运输 | IEA | - | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触,神经递质(GO期限:5) | - |
GO:0045202 | 突触 | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 8719416 | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Gaba途径 | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GABA A受体激活 | 12 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GABA受体激活 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome离子通道传输 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome配体门控离子通道传输 | 21 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21靶向DN | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-186 | 659 | 665 | M8 | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu | ||||
HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu | ||||
mir-26 | 614 | 620 | 1a | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu |