基因页:SMCO1
概括?
基因 | 255798 |
象征 | SMCO1 |
同义词 | C3orf43 |
描述 | 具有卷曲螺旋结构域1的单通膜蛋白1 |
参考 | HGNC:HGNC:27407|ENSEMBL:ENSG00000214097|Vega:Otthumg00000155581 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q29 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2119242 | Chr10 | 21344772 | C3orf43 | 255798 | 0.09 | 反式 | ||
RS9318386 | CHR13 | 24771100 | C3orf43 | 255798 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SMCO1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。