基因页：Gabra6
概括？
| 基因 | 2559 |
| 象征 | Gabra6 |
| 同义词 | - |
| 描述 | γ-氨基丁酸A型受体α6亚基 |
| 参考 | MIM：137143|HGNC：HGNC：4080|ENSEMBL：ENSG00000145863|HPRD：08841|Vega：Otthumg00000130351 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q34 |
| Pascal P值 | 0.049 |
| 胎儿β | -0.205 |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 配体门控离子信号传导 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00459 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01718 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | Gabra6 | 2559 | 1.743E-4 | 反式 | ||
| RS6741060 | CHR2 | 217169088 | Gabra6 | 2559 | 0.1 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | Gabra6 | 2559 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004890 | GABA-A受体活性 | IEA | GABA（GO期限：7） | - |
| 去：0008503 | 苯二氮卓受体活性 | 塔斯 | GABA，神经递质（GO期限：6） | 8632757 |
| 去：0005254 | 氯化物通道活性 | IEA | - | |
| 去：0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
| 去：0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | IEA | - | |
| GO：0031404 | 氯离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007214 | γ-氨基丁酸信号通路 | IEA | GABA，神经递质（GO期限：8） | - |
| 去：0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 8632757 | |
| 去：0006821 | 氯化物运输 | IEA | - | |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 8632757 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Gaba途径 | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 | 137 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GABA A受体激活 | 12 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GABA受体激活 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome离子通道传输 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome配体门控离子通道传输 | 21 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶标为B | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Cerebellum标记 | 85 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zembutsu对甲氨蝶呤的敏感性 | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |